北京市新型冠状病毒核酸检测混检策略应用

International Journal of Virology(2023)

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摘要
目的:通过收集北京市新型冠状病毒样本混采核酸检测结果,评价混采检出能力,总结规律,为新型冠状病毒及其它传染病病原体混采策略提供参考。方法:收集北京市2022年11月3日至17日10合1混采阳性样本,对其中核酸阳性感染者进行流行病学调查和实验室检测,汇总分析。结果:累计收集942管10合1混采阳性样本,每管检出(0.98±0.05)例感染者。混采开放读码框1ab(open reading frame,ORF1ab)基因、核衣壳蛋白(nucleocapsid protein,N)基因Ct值≥30占单采检出感染者812管混管的百分比分别为59.7%、67.9%。单采ORF1ab基因、N基因Ct值<30占检出923例感染者的百分比分别为72.2%、64.6%。混采与单采的O、N基因差值均值分别为(4.44±6.85)、(4.40±6.93)。空间分布显示,混管及单采阳性感染者分布存在明显空间聚集性。结论:混检策略在实际应用过程中能有效发现阳性感染者。今后开展人群感染情况检测时,应用混采筛查也能有效判断空间聚集性,实现预警作用。
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关键词
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,Nucleic acid test,Pooled testing strategy,ORFlab gene,N gene
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