HSPH1在肝细胞癌中的表达及临床意义

WANG Xudong,WU Liang, LI Yi, SHI Xuezhi, WANG Limei,XU Jianhong

Infectious Disease Information(2023)

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摘要
目的 基于癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、高通量基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)及人类蛋白质图谱数据库(Human Protein Atls,HPA)等生物信息学数据库探讨热休克蛋白H1(heat shock protein H1,HSPH1)在肝细胞癌中的表达及临床意义.方法 下载TCGA和GEO数据库肝细胞癌相关mRNA微阵列表达谱,比较肝细胞癌和癌旁组织的HSPH1 mRNA表达差异,并利用HPA数据库信息验证其蛋白水平的表达.分析HSPH1 表达与肝细胞癌患者预后的相关性.建立ROC曲线和列线图模型,比较不同HSPH1 表达组患者的生存差异.采用R软件分析HSPH1 表达与肝细胞癌组织中免疫细胞浸润、免疫细胞生物标志物和免疫检查点的相关性.采用STRING数据库分析HSPH1 相关蛋白质-蛋白质相互作用网络信息.并利用基因本体分析(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)和基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)等数据库分析HSPH1 在肝细胞癌中的功能及信号通路.结果 HSPH1 在肝细胞癌组织中的表达水平高于癌旁组织(P=0.000),Kaplan-Meier图显示HSPH1 高表达肝细胞癌患者的总体生存期(P=0.000)、疾病特异性生存期(P=0.000)和无进展间隔期(P=0.010)均较HSPH1低表达者更短,HSPH1对肝细胞癌具有较好的诊断价值(AUC=0.895,95%CI:0.862~0.928,P=0.000).多因素Cox回归分析显示,HSPH1 是肝细胞癌患者预后的预测因素(HR=2.226,95%CI:1.393~3.557,P=0.000).时间依赖性ROC曲线图显示 1 年、3 年和 5 年AUC分别为 0.699、0.581、0.588.在肝细胞癌组织中,HSPH1 蛋白表达水平与树突状细胞和细胞毒性细胞浸润呈负相关,与巨噬细胞、CD56 高表达的NK细胞等免疫细胞浸润及免疫检查点程序性死亡受体 1 和细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白 4 表达呈弱正相关.蛋白质-蛋白质相互作用、GO、KEGG和GSEA通路富集分析显示HSPH1 与HSPA2、HSPA4、HSPA8 和HSPA9 等分子相互作用,并与HSPA4、HSPA8 表达呈正相关,且具有调节凋亡、抗原加工和提呈、调节免疫等功能.结论 HSPH1 在肝细胞癌组织中高表达,是肝细胞癌潜在的诊断和预后标志物.HSPH1 参与了肝细胞癌的免疫调节过程,可能成为其治疗靶点之一.
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