基于WGCNA构建食管鳞癌免疫相关基因预后模型

目的:采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选食管鳞癌(ESCC)预后相关免疫相关基因(IRG),构建预后模型,为ESCC患者预后预测提供依据.方法:从TCGA数据库下载81例ESCC及11例正常食管组织的全转录组数据及对应样本临床数据,筛选差异表达IRGs.采用WGCNA、单因素Cox回归和多因素Cox回归分析构建ESCC预后模型,绘制受试者工作特征曲线(ROC)及Kaplan-Meier(K-M)曲线评价模型,单因素Cox回归和多因素Cox回归分析评价模型是否可成为独立预测因子.结果:筛选出545个差异表达IRGs,其中383个上调,162个下调.单因素Cox回归分析得到6个预后相关IRGs,多因素Cox回归分析得到4个预后相关IRGs(SLC40A1、IGHA2、STC2、NR2F2)用于构建预后风险模型.K-M曲线显示,高风险组患者总生存期(OS)显著低于低风险组(P<0.01).多因素Cox回归分析表明,预后风险模型可作为一个独立预后因素(HR=1.133,P<0.01).结论:本模型具有较高的准确性,可作为ESCC患者预后的独立预测因子.