东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库

WU Feng, WEN Peiying, TANG Zhizhen, LI Qingjian, ZHU Di, WANG Tianming, GE Jianping,WANG Hongfang

Journal of Beijing Normal University(Natural Science)(2023)

引用 0|浏览0
暂无评分
摘要
DNA宏条形码技术已成为环境DNA分析的常用手段,选择合适的引物并建立本地微条形码数据库,对于环境DNA结果的进一步探究十分重要.本文通过数字模拟PCR技术,对食草动物环境DNA研究中常用的3个微条形码进行比较,发现psbCL具有最高或略低于最高的覆盖度和分辨率,在环境DNA分析中推荐优先使用.利用psbCL建立了东北虎豹国家公园本地微条形码库,同时利用psbCL扩增梅花鹿粪便中的进食物种,以比较本地微条形码库和公共数据库在物种鉴别能力方面的差异.结果表明,本地数据库在属和种水平均提高了鉴别能力.因此,本研究推荐环境DNA分析中建立本地微条形码库,以提高研究的精度,本研究所建立的东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库也将为未来高精度的环境DNA分析提供基础.
更多
关键词
plant DNA mini-barcode,environmental DNA,DNA metabarcoding,barcode libraries,psbCL
AI 理解论文
溯源树
样例
生成溯源树,研究论文发展脉络
Chat Paper
正在生成论文摘要