基于MAGIC群体瓠瓜白粉病抗性的全基因组关联分析

ZHONG Liping, WANG Jian, WU Xiaohua, WANG Ying, WU Xinyi, WANG Baogen, LU Zhongfu,WANG Huasen,LI Guojing

Acta Agriculturae Zhejiangensis（2023）

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摘要

白粉病是葫芦科作物共有的病害之一,严重影响瓠瓜的产量和品质.本研究采用 8 个瓠瓜亲本F8代的203 个MAGIC(multi-parent advanced generation inter-cross)群体,利用2020 和2021 年两年的抗病表型数据,基于基因重测序过滤筛选得到的221043 个高质量SNPs进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS).在两年数据中重复检测到46 个SNPs位点与白粉病抗性显著相关,在与抗病相关联的候选区段内共检测到32 个候选基因,其中有12 个基因预测与瓠瓜抗病功能相关.本研究首次在葫芦科作物中构建了MAGIC群体,并通过GWAS分析进行白粉病抗病基因定位,为克隆瓠瓜抗白粉病相关基因奠定了基础,也对深入了解白粉病抗性机制、辅助培育抗病品种具有重要意义.

关键词

powdery mildew of bottle gourd,MAGIC group,genome wide association analysis,candidate gene

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