Chemoproteomik‐basierte Identifikation von 4‐Oxo‐β‐lactamen als Inhibitoren der Dipeptidylpeptidasen 8 und 9

Angewandte Chemie(2022)

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Abstract Die Dipeptidylpeptidasen 8 und 9 (DPP8/9) sind aufgrund ihrer wichtigen Rolle in biologischen Prozessen wie der Immunität und Tumorgenese in den letzten Jahren in den Fokus der Wirkstoffforschung gerückt. Der individuelle Beitrag der jeweiligen Protease innerhalb dieser Prozesse ist bisher jedoch meistens noch unbekannt. Die Untersuchung ihrer individuellen Funktion kann dabei von der Verfügbarkeit Protease‐selektiver und chemisch‐diverser Hemmstoffe profitieren. In dieser Arbeit stellen wir die durch Anwendung von Aktivitäts‐basiertem Protein‐Profiling (ABPP) entdeckten 4‐Oxo‐β‐lactame als potente, nicht‐Substrat‐abgeleitete, nanomolare DPP8/9‐Inhibitoren vor. Röntgenkristallographische Untersuchungen von Liganden‐DPP‐Komplexen offenbarten dabei unterschiedliche Ligandenbindungsmodi für DPP8 und DPP9, einschließlich einer neuartigen Adressierung einer erweiterten S2′ (eS2′)‐Bindetasche in DPP8. Zusätzliche Assays bestätigten ihre Hemmwirkung sowohl auf biochemischer als auch auf zellulärer Ebene. Zusammenfassend führte unser kombinierter Ansatz aus chemischer Proteomik und strukturbasiertem Design somit zu der Entwicklung neuartiger DPP8/9‐Inhibitoren mit einem alternativem molekularen Hemmmechanismus und einem bisher nicht erreichten Selektivitätsindex.
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