广州地区创伤弧菌分子生物学特征分析

ZHANG Jing, CHEN Huiling, HE Peng,HOU Shuiping,BAI Zhijun,TAO Xia,WU Xinwei

Chinese Journal of Food Hygiene(2023)

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摘要
目的 了解广州地区创伤弧菌的分子生物学特征.方法 对采集自广州地区的38株创伤弧菌进行全基因组测序,结合从NCBI公共数据库下载的50株序列数据,利用fineSTRUCTURE软件解析创伤弧菌的种群结构,并利用CARD、ResFinder和VFDB数据库对其毒力基因和耐药基因进行鉴定.结果 创伤弧菌分为4个系统发育谱系(L1~L4),广州地区分离株全部聚集于L1(占47%)和L2(占53%)谱系,ST分型主要为ST357、ST157、ST136、ST139、ST345、ST303等,呈现一定的区域聚集性.创伤弧菌多个基因组鉴定发现acrF、CRP、catB9、rpoC、ugd等11种耐药基因,并首次在创伤弧菌中发现与多黏菌素耐药相关的MCR基因.该物种还携带5类23种毒力基因,编码鞭毛蛋白、Ⅱ型分泌系统蛋白、荚膜多糖、RtxA毒素、铁超载等毒力相关基因.结论 广州地区创伤弧菌高度同源重组,并且携带多种耐药、毒力相关基因,应加强对其监测管理.
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关键词
Vibrio vulnificus,whole-genome sequencing,population structure,multilocus sequence typing,antimicrobial resistance gene,virulence-related genes
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