为了解复旦大学附属金山医院近年来明显增多的非伤寒沙门菌(nontyphoidal Salmonella,NTS)感染儿童病例的临床特点及病原体特征,本研究回顾性分析了 2018年1月—2021年12月该院NTS感染患儿的临床特征、血清型分布及耐药情况,并比较新型冠状病毒感染(简称新冠)疫情出现前后的差异.2018-2021年该院腹泻患儿中NTS的平均分离率为18.1％(110/609),其中2020-2021年(新冠疫情开始后)的分离率(21.3％,57/268)明显高于2018-2019年(15.5％,53/341)(P=0.04).NTS感染病例主要集中在6个月～＜3岁年龄段(80.0％,88/110),多发于每年的5-10月(84.5％,93/110).临床症状常见发热(70.9％)和肉眼血便(22.7％);均接受第3代头孢菌素类抗生素治疗,疗程一般为5～7 d,所有患儿均临床痊愈.共检出21种血清型,其中鼠伤寒沙门菌单相变种最常见(29.1％,32/110),其次是鼠伤寒沙门菌(26.4％,29/110).药敏试验结果显示,NTS对头孢曲松的耐药率为21.8％,对阿奇霉素和环丙沙星的耐药率较低(分别为8.2％和6.4％);29.1％的菌株为多重耐药株,2.7％的菌株对所检测抗菌药物均耐药.NTS已成为上海金山及其周边地区儿童急性肠炎的重要病原体,且感染率呈上升趋势,很可能与鼠伤寒沙门菌及其单相变种感染增多有关,对目前临床常用的第3代头孢菌素类抗生素的耐药率较高,因此有必要持续监测NTS的流行特征及其对抗菌药物耐药性的变化.
本研究旨在了解关节假体周围感染(periprosthetic joint infection,PJI)中金黄色葡萄球菌小菌落变异体(Staphylococcus aureus small colony variant,SASCV)的毒力、耐药基因携带情况及分子型别,为探讨其致病机制提供基础数据.收集从19例PJI患者关节液中分离出的SASCV,进行全基因组测序、生物信息学分析及数据库比对,以了解其毒力相关基因和耐药基因的携带情况;采用多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)分析菌株型别,并构建系统发育树.结果显示,19株SASCV中,有8株与正常形态金黄色葡萄球菌混合生长.对全部27株菌株进行全基因组测序,基因组长度为2 696 437～3 011 803 bp,G+C含量为(32.8±0.05)％.共检出23种毒力相关基因:其中14种黏附素相关基因的检出率较高,为21.1％～100.0％;4种与免疫逃逸相关基因的检出率为36.8％～68.4％;5种溶血及杀白细胞素基因也有检出.耐药基因检出12种:blaZ检出率为78.9％(15/19);mecA检出率为31.6％(6/19);大环内酯类及氨基糖苷类抗生素耐药基因也有不同比例的检出.耐甲氧西林金黄色葡萄球菌中耐药基因的检出数量高于甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌.MLST分析结果显示,19株SASCV共分10个型别.8组表型混合生长的菌株中,2组SCV与正常表型菌株分属不同型别,且毒力及耐药基因差异较大,其余6组为同一型别.本研究还发现,PJI中SASCV的生物膜相关黏附素基因检出率高,耐药基因中mecA检出率较高,MLST以ST59最多,其次为ST398和ST25.SCV与正常表型菌株混合生长时可分属不同型别.
本文报道了空肠弯曲杆菌血流感染1例,并研究了其生物学特性与可能存在的耐药基因,为临床有效治疗相关疾病提供科学的实验室依据.采用常规方法、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析、测序分析和聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)等技术,对从1位老年女性血液中分离出的1株致病菌进行菌种鉴定、药物敏感试验、耐药基因检测等.结果显示,此分离菌株为空肠弯曲杆菌,其对环丙沙星、四环素耐药,对红霉素敏感.采用PCR检测出空肠弯曲杆菌的3种耐药基因gyrA,gyrB,tex(O),可能与其药敏试验结果相关.
本文报道了 1例新生儿支原体脑炎.患儿因"皮肤黄染3天"入院,病程中有发热,人院后仍持续发热22天,热峰高达39 ℃,脑脊液检查显示白细胞计数升高、蛋白水平明显升高及葡萄糖水平显著降低,按照新生儿细菌性脑膜炎治疗后效果不佳,遂取脑脊液行宏基因组测序,第22天明确诊断为解脲支原体(Ureaplasma urealyticum,UU)感染.新生儿支原体感染以解脲支原体为主,感染主要来自母体宫内感染的垂直传播.支原体脑炎的临床表现及脑脊液改变均与新生儿细菌性脑膜炎类似,因此临床医师应重视病原学诊断,治疗宜选用大环内酯类药物.
结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是我国常见的消化道恶性肿瘤.大量研究证实,肠道菌群紊乱可通过多种机制促进CRC的发生、发展,以调节肠道菌群为目的的治疗方式可能对辅助治疗CRC有一定的效果,但仍存在局限性和不良反应.有研究表明,采用基因编辑工程菌与基因编辑直接改造肠道细菌2种方式治疗CRC,具有潜在的临床应用价值.本文通过梳理现阶段基因编辑肠道细菌治疗CRC的相关研究进展,探讨了未来基因编辑肠道细菌治疗CRC的可能性.
本研究旨在分析儿童泌尿道感染(urinary tract infection,UTI)的临床特点、病原菌构成、变迁及药敏试验结果,来帮助儿科医师更好地管理儿童UTI.通过收集2014年1月—2021年12月591例UTI住院患儿的临床资料,分析其临床特点和病原菌.结果显示:在不同的年龄组,男女发病率、临床症状、合并疾病的差异分别具有统计学意义(P＜0.05).常见病原菌主要为大肠埃希菌、屎肠球菌.2014-2017年度和2018-2021年度病原菌构成比的差异具有统计学意义(P＜0.05).近年来,大肠埃希菌的产酶率下降,产酶菌株有更高的耐药率,部分抗生素的耐药率下降.屎肠球菌对庆大霉素、左氧氟沙星等的耐药率均高于50％,而对达托霉素、呋喃妥因等的敏感率高于60％.本研究表明,儿童UTI的男女发病率、临床症状、合并的疾病随年龄不同而有差异.近年来,革兰氏阴性菌的占比呈上升趋势,而革兰氏阳性菌的占比呈下降趋势,大肠埃希菌的产酶率有所下降.产酶大肠埃希菌和屎肠球菌对多种常用抗生素耐药.
在抗感染免疫过程中,中性粒细胞可通过释放中性粒细胞胞外诱捕网(neutrophil extracellular trap,NET)捕获并杀伤病原体.NET是一把"双刃剑",一方面可维持机体稳态,另一方面NET过量或清除不及时会导致一些疾病的发生.细菌诱导和抵御NET的机制不尽相同,本文就NET的生成和释放及其在细菌感染过程中的作用进行综述.
鲍曼不动杆菌是一种多重耐药的机会致病菌,其致病机制复杂多样,对人类健康造成了严重威胁,故研究其致病机制势在必行.细菌运动不仅在细菌的迁移中起作用,还与其毒力、耐药性、黏附性、趋化性及生物膜形成等密切相关.鲍曼不动杆菌因缺乏鞭毛早期被认为不具备运动性,然而随着研究的深入发现其可通过蹭行运动及表面相关运动在潮湿的表面移动,影响其运动性的因素主要包括Ⅳ型菌毛、群体感应、外排泵、趋化系统及蓝光感应等.本文主要就鲍曼不动杆菌的运动性、影响因素及运动性的生物学作用展开讨论,并为鲍曼不动杆菌感染的预防及治疗提供参考.
为探讨上海市不同来源的柯萨奇病毒B组3型(coxsackievirus B3,CVB3)菌株的循环动态变化及基因特征,本研究对分离自上海市环境污水、健康儿童和急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例中的CVB3菌株进行VP1区基因序列测定,并对照全球CVB3代表株进行序列相似性分析和系统发生学分析.结果显示,1989-2021年上海市不同来源的CVB3分离株共有120株,属于D、E基因亚型.上海CVB3分离株的核苷酸和氨基酸相似性差异较大,分别为78.7％～100％和93.3％-100.0％.2016年首次从上海环境污水中分离到E基因亚型CVB3,2021年再次分离到该基因亚型.2021年上海环境污水中的E基因亚型CVB3分离株与2020年的广东手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)病例CVB3分离株VP1区的核苷酸相似性较高,但上海暂未有该基因亚型感染病例报道.因此,仍须长期对环境污水和不同肠道病毒感染病例进行监测,以提高肠道病毒监测的敏感性,为肠道病毒相关疾病的诊疗提供数据支撑.
严重急性呼吸综合征冠状病毒 2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)是引起2019冠状病毒病(coronavirus disease 2019,COVID-19)的病原体,在人群中广泛持久传播,对人类健康和社会经济造成了巨大危害.目前,针对COVID-19的治疗尚无特异高效的抗病毒药物.病毒为实现寄生感染,通常先与宿主细胞膜表面受体结合,进而内化入胞.因此,SARS-CoV-2受体决定着病毒的感染特性和宿主范围,对其进行研究和解析是战胜SARS-CoV-2感染的一个关键手段.SARS-CoV-2受体的发现和鉴定,将为COVID-19提供新的治疗靶点.本文主要对SARS-CoV-2入侵受体及黏附受体的研究进展进行综述.
自2020年首次报告2019冠状病毒病(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)病例以来,严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)突变株不断出现.继奥密克戎(Omicron)毒株肆虐之后,XBB变异株崛起,世界卫生组织(World Health Organization,WHO)SARS-CoV-2 技术小组负责人Kerkhove在2023年1月4日称XBB1.5变异株是目前人们检测到的最具传染性的毒株.SARS-CoV-2感染的大流行似乎处于过渡阶段.虽然通常认为病毒进化的趋势是致病性越来越弱,但在某些阶段也会增强,所以XBB1.5不会是SARS-CoV-2演化的"终点".针对新变种出现和感染病例增加的风险,WHO提出2个策略:①通过个人防护(特别是患有严重基础疾病或职业性接触病毒的脆弱群体)减少病毒的传播;②通过有效预防、诊断和治疗COVID-19,减少病毒感染导致的发病、死亡和疾病造成的长期后果.当前我国COVID-19疫情防控政策从"乙类甲管"调整为"乙类乙管",疫情防控工作的重点是"保健康、防重症".我们的工作重心由防范全人群感染转移到保护重点人群、降低重症率和死亡率,目的还是为了最大程度保护人民群众生命安全和身体健康,最大限度降低疫情对社会经济发展的影响.
严重急性呼吸综合征冠状病毒 2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染所致的2019冠状病毒病(coronavirus disease 2019,COVID-19)给人民的生命健康造成了严重的威胁,目前该病毒仍然在广泛传播,针对SARS-CoV-2有效的治疗方法仍有限,因此寻找广谱中和抗体阻断SARS-CoV-2感染具有重要的意义.本文成功表达并纯化了 3株靶向SARS-CoV-2的受体结合结构域(receptor-binding domain,RBD)的人鼠嵌合抗体,并且检测了这几株抗体对多种SARS-CoV-2假病毒和活病毒的中和活性.本研究表明这3株抗体能特异性地中和SARS-CoV-2野生型假病毒,IC50分别为0.03 μg/mL、0.06 μg/mL、0.03 μg/mL.此外,这3株抗体对Alpha株假病毒、Delta株假病毒和Lambda株假病毒也具有广谱中和活性,并可以抑制SARS-CoV-2 Delta株活病毒的复制.机制研究表明,这些抗体可以阻断SARS-CoV-2的S蛋白介导的细胞-细胞融合,且RBD上的K417、E484和N501位点可能是其与这3株抗体结合的关键位点.
结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)作为全球流行性、慢性传染病结核病的病原体,其致病机制、耐药性与其特异性细胞壁成分密切相关,尤其是脂质成分,如脂阿拉伯甘露聚糖、海藻糖二霉菌酸酯、酚糖脂等糖脂类.因此,结核分枝杆菌细胞壁脂质成分的相关研究对结核病的诊断、防治具有重要价值.本文对结核分枝杆菌细胞壁部分脂质成分的生物学活性作一综述,以期为结核分枝杆菌相关基础研究提供参考.
本刊名誉主编闻玉梅院士及其丈夫宁寿葆教授以个人名义捐赠的"一健康基金"于2013年1月16日在复旦大学上海医学院正式成立. "一健康",是英文"One Health"的中文缩写,意指"一体化健康".它突出了人的健康是一个"系统工程",需要整合基础医学、临床医学、公共卫生学、药学、生命科学和人文社会科学等诸多学科共同研究与实施保障.也就是说,人类健康问题不仅仅是医学的事、医生的事,而是涉及多个学科交叉的系统性科学领域,是"一体化"事业.
海南医学院第一附属医院临床微生物实验室于2022年6月16日从左胫骨平台骨折患者伤口分泌物中分离培养出 1株革兰阴性杆菌,经全自动微生物鉴定药敏分析系统、血清凝集和基质辅助激光解吸飞行时间质谱等鉴定为肠炎沙门菌.根据病原学检测及药敏试验结果,序贯给予该患者美洛培南1.0 g q8h静脉点滴9 d,哌拉西林钠/他唑巴坦钠4.5 g q6h静脉点滴5 d,美洛培南1.0 g q8h静脉点滴19 d,万古霉素1.0 g q12h静脉点滴10 d,以及左胫骨平台感染清创+引流术后,患者伤口处未见明显渗血渗液且感染指标未见明显异常,最终治愈出院.
作为新近发现的血清学标志物,乙型肝炎核心相关抗原(Hepatitis B core-related antigen,HBcrAg)由乙型肝炎核心抗原(Hepatitis core antigen,HBcAg)、乙型肝炎 e 抗原(Hepatitis e antigen,HBeAg)、p22cr组成.血清HBcrAg可反映肝内共价闭合环状DNA的水平及转录活性,并在一定程度上预测慢性乙型肝炎(简称乙肝)患者自然转归或核苷(酸)类似物、干扰素的疗效与预后,包括复发、功能性治愈等临床结局的发生率等,从而为临床抗病毒治疗起点与终点的确定、治疗方案的选择提供指导.同时,HBcrAg水平与乙肝相关的肝细胞肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)的发生率亦有关联,可识别潜在的HCC高危患者.因此,HBcrAg在慢性乙肝诊治中有着重要的临床应用价值.
为探索伤寒沙门菌Ⅵ型分泌系统(type 6 secretion system,T6SS)对SopE表达的影响,阐明其中的分子机制,本研究利用自杀质粒同源重组法构建携带sopE::3×Flag的伤寒沙门菌野生株(WT-pBAD33)、T6SS功能分子缺陷株(ΔsciG-pBAD33)和回补株(C-ΔsciG),用构建成功的菌株感染巨噬细胞THP-1并在模拟巨噬细胞内环境(LPM培养基、微需氧)下培养,通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)与蛋白质印迹法(Western blot,WB)试验探索 T6SS 对SopE表达的影响,采用β-半乳糖苷酶活性检测来进一步验证sopE基因启动子的转录水平,Ni柱纯化T6SS功能蛋白SciG,电泳迁移率变动分析(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)研究SciG蛋白对sopE基因启动子的调控作用.结果显示:ΔsciG-pBAD33中SopE表达水平较于WT-pBAD33明显降低;SciG蛋白不能直接与sopE基因启动子区域结合.本研究结果表明,伤寒沙门菌T6SS影响了 SopE的表达,但是其功能蛋白SciG不能直接调控sopE基因的表达.
本文建立了蜱传脑炎病毒(tick-borne encephalitis virus,TBEV)感染的动物模型,为筛选抗TBEV药物提供合适的工具.选取BALB/c小鼠,经皮下注射途径接种TBEV,观察其感染症状、体重及生存率.检测小鼠脑、脾、肾组织中TBEV抗原分布、病毒滴度、组织病理和肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor α,TNF-α)、干扰素β(interferon β,IFN-β)mRNA表达水平的动态变化.结果表明,感染小鼠出现弓背、后肢瘫痪的症状;与未感染病毒的小鼠相比,感染小鼠的体重及生存率显著降低;TBEV抗原分布在小鼠的脑、脾、肾组织;脑组织中病毒滴度高且发生病理改变;感染鼠脑、脾、肾组织中TNF-α与IFN-β mRNA的表达水平呈动态变化.本文采用皮下注射攻毒途径成功建立了 TBEV感染的BALB/c小鼠模型.
本刊重点介绍国内外微生物学基础研究与临床相结合的研究成果和新进展,主要内容涉及与人类、动物和植物感染有关的微生物,如病毒、细菌、真菌、立克次体、螺旋体、支原体等的生物学及分子生物学特性,抗感染免疫,实验室诊断技术以及临床感染等方面的研究.
为适应当前微生物学领域研究迅速发展的需要，缩短文章的出版周期，及时报道最新研究成果，经上海市新闻出版局批准，本刊自2015年起改为双月刊出版。<br> 《微生物与感染》重点介绍国内外微生物学基础研究与临床相结合的研究成果和新进展，主要内容涉及与人类、动物和植物感染有关的微生物，如病毒、细菌、真菌、立克次体、螺旋体、支原体等的生物学及分子生物学特性、抗感染免疫、实验室诊断技术以及临床感染等方面的研究。主要栏目有特约专稿、论著、病例分析、综述等。可供从事微生物与感染的教学、科研、医疗等工作者参考。欢迎广大读者到当地邮局订阅。
