目的 比较微阵列芯片法和多同源基因序列测序在非结核分枝杆菌(NTM)菌种鉴定中的差异,为NTM感染提供精准诊断依据.方法 采用罗氏固体培养法复苏天津市海河医院2016-2019年保存的170株NTM菌株,分别采用微阵列芯片法和同源基因序列[16SrRNA、RNA聚合酶亚基B(rpoB)、热休克蛋白65(hsp65)]测序进行鉴定.以多同源序列测序分析结果为参考,分析微阵列芯片法菌种鉴定的准确性.比较2种方法样本周转时间(TAT)的差异.结果 微阵列芯片法鉴定出8个NTM菌种,同源序列测序鉴定出14个.微阵列芯片法无法鉴定出缓慢生长群的猿分枝杆菌、慢生黄分枝杆菌、副瘰疬分枝杆菌和快速生长群的龟分枝杆菌、马德里分枝杆菌、母牛分枝杆菌等10个菌种,多同源序列测序可鉴定出全部的菌种.以多同源序列测序分析结果为参考,微阵列芯片法鉴定错误7株,鉴定到复合群的正确率为90.0％(153/170);16S rRNA、rpoB、hsp65单独和3个同源序列联合分析鉴定到复合群的正确率分别为93.5％、98.8％、99.4％和100.0％.对于微阵列芯片法无法区分的53株龟/脓肿分枝杆菌复合群(MABC),3个同源序列联合测序鉴定出6株龟分枝杆菌、25株MABC脓肿亚种、20株MABC马赛亚种和2株MABC bolletii亚种.微阵列芯片法单个样本鉴定TAT为8 h,170株NTM菌株全部鉴定需要2 d;多同源序列测序单个样本鉴定TAT为3 d,170株NTM菌株全部鉴定约需要5 d.结论 微阵列芯片技术可快速鉴定临床常见分枝杆菌.多同源基因序列测序不仅可鉴定临床常见分枝杆菌,还可鉴定微阵列芯片法无法鉴定出的菌种和可能鉴定错误的菌种及其亚种,但所需时间较微阵列芯片法长.
目的 比较核酸适配体荧光探针法和液基夹层杯法检测结核分枝杆菌(MTB)的临床应用价值.方法 采集175例肺结核患者和80名健康体检者的痰液样本,分别采用液体培养法、固体培养法、抗酸染色镜检法、液基夹层杯法、核酸适配体荧光探针法检测MTB.以液体培养法结果为标准,评价核酸适配体荧光探针法、液基夹层杯法与液体培养法结果的一致性.结果 与液体培养法结果比较,液基夹层杯法的敏感性为78.08％、特异性为98.04％;核酸适配体荧光探针法的敏感性为54.79％、特异性为50.98％.结论 液基夹层杯法与液体培养法一致性较好,具有较好的临床诊断价值;核酸适配体荧光探针法性能尚需优化.
目的 构建北京地区1个月～12岁儿童末梢全血C反应蛋白(CRP)百分位数曲线和参考值.方法 选取2015年1月—2020年6月首都儿科研究所健康儿童629名,检测其末梢全血CRP水平.按年龄分为＜2岁组、2～＜4岁组、4～＜6岁组、6～＜8岁组、8～＜10岁组、10～＜12岁组.应用GAMLSS模型绘制不同性别、年龄儿童CRP水平P50、P75、P90、P95、P97和P99百分位数标准曲线.结果 各组CRP数据均服从Box-Cox-t分布.＜2岁组男童CRP水平高于女童,其他年龄组男、女童之间CRP差异无统计学意义(P＞0.05).＜6岁男童的CRP水平随年龄增长而降低,6～12岁男童的CRP水平随年龄增长而升高;＜9岁女童的CRP水平随年龄增长而升高,9～12岁女童的CRP水平随年龄增长而降低.结论 建立了北京地区1个月～12岁儿童末梢全血CRP的百分位数曲线图,男童和女童末梢全血CRP随年龄增长的变化趋势不同.
使用血液样本进行血浆表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因检测已经成为非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)临床诊疗的关键环节[1].本研究报道 1 例EGFR:c.2572_2573delinsAG阳性NSCLC患者,采用改进的突变扩增阻碍系统(super amplification refractory mutation system,Super-ARMS)检测血浆循环游离DNA(circulating tumor DNA,ctDNA),未检出该突变;采用抑制探针置换扩增(blocker displacement amplification,BDA)法检出该突变位点.
目的 探讨口腔腺样囊性癌(ACC)患者血清miR-24、X染色体连锁凋亡抑制蛋白(XIAP)mRNA表达情况,及其与患者预后的关系.方法 选取2010年6月-2016年2月张家口市第一医院口腔ACC患者60例(口腔ACC组),以60名体检健康者作为正常对照组.收集所有研究对象的血清样本和ACC患者的癌组织、癌旁组织(距肿瘤组织边缘≥5 cm)样本,以及临床资料.检测血清和组织中miR-24、XIAP mRNA的相对表达量.采用Pearson相关分析评估miR-24与XIAP的相关性.对ACC患者进行随访.采用Kaplan-Meier生存曲线和Log-rank x2检验分析血清miR-24、XIAP相对表达量与口腔ACC患者预后的关系.采用Cox回归分析评估影响口腔ACC患者预后的危险因素.结果 与正常对照组比较,口腔ACC组血清miR-24相对表达量显著降低(P＜0.05),XIAP mRNA相对表达量显著升高(P＜0.05).与癌旁组织比较,癌组织miR-24相对表达量显著降低(P＜0.05),XIAP mRNA相对表达量显著升高(P＜0.05).口腔ACC患者血清miR-24与XIAPmRNA呈负相关(r=-0.486,P＜0.05).分别以口腔ACC患者血清miR-24和XIAP mRNA相对表达量的均值作为临界值,分为高表达组和低表达组.miR-24低表达组、XIAP mRNA高表达组神经侵袭和淋巴转移患者例数分别显著多于miR-24高表达组、XIAP mRNA低表达组(P＜0.05).Kaplan-Meier生存曲线分析结果显示,miR-24低表达组、XIAP mRNA高表达组累积生存率分别显著低于miR-24高表达组、XIAP mRNA低表达组(Log-rank x2值分别为7.212、8.568,P值分别为0.007、0.003).Cox回归分析结果显示,有神经侵袭、XIAP mRNA高表达是口腔ACC患者预后不良的独立危险因素(P＜0.05),miR-24高表达是口腔ACC患者预后的独立保护因素(P＜0.05).结论 口腔ACC患者血清miR-24和XIAP表达均与预后相关,或可作为新的口腔ACC预后评估生物标志物.
