基于二代测序技术的浙江省地方猪种的分子遗传聚类

本试验选取了金华猪、嵊县花猪、嘉兴黑猪、兰溪花猪、岔路黑猪、碧湖猪、淳安花猪等7个浙江省地方猪种和大白、长白、杜洛克3个外来猪种共491头,采用第二代测序技术,得到SNP座位53860个,并使用最大似然法计算遗传距离,结果表明：7个浙江省地方猪种之间的平均遗传距离为1.073,3个外来猪种之间的平均遗传距离为0.60,金华猪与长白猪之间的遗传距离最远,为2.031。构建的N-J系统进化树表明3个外来猪种首先归为一类,淳安花猪和嘉兴黑猪也较早归为一类,而岔路黑猪、金华猪和嵊县花猪相对其他猪种较远。这一研究结果为浙江省地方猪种的种质特性和进一步的开发利用提供了参考。