广西麻鸡STMN2基因克隆、生物信息学及组织表达分析

为了探究Stathmin-like 2(STMN2)在广西麻鸡中的蛋白结构和组织表达水平,本研究克隆了广西麻鸡STMN2基因并进行生物信息和组织表达谱分析.通过克隆获得STMN2基因CDS序列全长,利用qRT-PCR分析STMN2基因在不同组织中的表达水平.结果显示,STMN2基因编码区序列全长540 bp,共编码179个氨基酸.生物信息学分析表明,广西麻鸡STMN2氨基酸序列与原鸡、雉鸡、绿头鸭、鸽、人、小鼠的同源性分别为99.3％、98.8％、96.1％、97.8％、85.7％、87.9％.进化树分析结果显示,STMN2基因在禽类和哺乳类之间存在明显的遗传距离,其中广西麻鸡与原鸡的亲缘关系最近,与雏鸡的亲缘关系较近,鸽和绿头鸭次之.STMN2蛋白的分子质量20.88 ku,等电点为8.72,是不具有跨膜结构和信号肽的不稳定亲水碱性蛋白.qRT-PCR结果显示,STMN2基因在脑中表达量最高,显著高于其他组织或器官.本实验结果为进一步研究鸡STMN2基因功能提供了理论参考.