Using the analysis of variability of mitochondrial and nuclear DNA genes, it was established that the Krusensterniella genus is included in the Gymnelinae subfamily and, along with the Gymnelopsis genus, generates a group of taxa of species devoid of ventral fins. Considerable genetic differences between the Krusensterniella genus and the group of genera of Gymnelinae fish with ventral fins ( Hadropareia, Magadanichthys, Bilabria , and Davidijordania ) were demonstrated. Differences between the Krusensterniella species correspond to the level interspecific differentiation in closely related Lycodinae subfamily.
Based on the analysis of nucleotide sequences of mitochondrial (COI, cytochrome b, 16S rRNA genes) and nuclear (RNF213 and rhodopsin genes) molecular markers, we defined the levels of divergence, relationships, and structure of the superfamily Stichaeoidea of the suborder Zoarcoidei. The system of the superfamily based on morphological data that was offered by Makushok [6] is not confirmed by the molecular and genetic results. Our investigations suggest that the superfamily Stichaeoidea should include not only the families Stichaeidae, Pholidae, and Ptilichthyidae, but also the Zaproridae and Cryptacanthodidae, while the family Anarhichadidae should be excluded from it.
Analysis of sequence variation in the mitochondrial and nuclear genes in Azygopterus corallinus showed that this species was genetically close to the group uniting the representatives of the families Zoarcidae, Neozoarcidae, and Anarhichadidae. The considerable genetic differences between A. corallinus and the members of the family Stichaedae, to which it was assigned earlier, are consistent with the divergence estimates between the other families of the suborder Zoarcoidei (Zaproridae, Ptilichthyidae, Pholidae, Cryptacanthodidae, Bathymasteridae).
Анализ изменчивости генов митохондриальной и ядерной ДНК кораллового вьюна Azygopterus corallinus показал, что он генетически близок к группе, объединяющей представителей таксонов Zoarcidae, Neozoarcidae и Anarhichadidae. Значительные генетические отличия A. corallinus от представителей семейства Stichaeidae, к которому ранее был отнесен этот вид, соответствуют оценкам дивергенции между остальными семействами подотряда Zoarcoidei (Zaproridae, Ptilichthyidae, Pholidae, Cryptacanthodidae, Bathymasteridae).
Analysis of the nucleotide sequences of mitochondrial and nuclear DNA genes was used to examine the relationships and position of the subfamily Xiphisterinae in the system of the suborder Zoarcoidei. This study showed the genetic heterogeneity of Xiphisterinae and the propriety of its division into two subfamilies: Xiphisterinae with the genera Xiphister and Phytichthys and Cebidichthyinae with the genera Cebidichthys, Dictyosoma, Esselenichthys, and Nivchia. The genetic differences between the two subfamilies were not less, but in some cases even greater than the differences between families within the suborder; therefore, they should be raised to the rank of a family, Xiphisteridae and Cebidichthyidae, and classified not within the superfamily Stichaeoidae but rather as independent taxa of the suborder Zoarcoidei.
The first finding of an adult specimen (TL = 385 mm) of the Okhotsk atka mackerel Pleurogrammus azonus (Scorpaeniformes: Hexagrammidae) is reported for the northern coast of the Sea of Okhotsk (mouth of western Tauy Bay). This is the northernmost finding of this species in the Sea of Okhotsk. The detailed description of the external morphology of the specimen is given. The mtDNA COI gene fragment is compared to GenBank data, and the molecular genetic analysis justifies the species definition significantly.
Сообщается о первой поимке взрослого экземпляра (TL 385 мм) южного однопёрого терпуга Pleurogrammus azonus (Scorpaeniformes: Hexagrammidae) у северного побережья Охотского моря в районе входа в западную часть Тауйской губы. Приведено подробное внешнеморфологическое описание добытого экземпляра самой северной находки вида в Охотском море. Сравнение по нуклеотидной последовательности фрагмента гена COI митохондриальной ДНК с данными из генетического банка также однозначно свидетельствует о принадлежности изученного экземпляра к виду P. azonus.
Sequence variation ofthe mitochondrial COI, cytochrome b, and 16S RNA genes, as well as nuclear RNF213 gene was examined in the genera Lycenchelys and Lycodapus with the purpose of determination of their positions in the system of the family Zoarcidae. It was demonstrated that the genus Lycodapus was considerably closer to the generic group of Lycogramminae (Lycogrammoides, Bothrocara, Allolepis, Bothrocarhichthys) than the genus Lycenchelys. However, on the phylogenetic trees both of these genera were located in the clade of the subfamily Lycodinae. Genetic heterogeneity of the genus Lycenchelys, represented by two species groups differing in distribution patterns (northeastern Pacific and Antarctic) and showing more profound differences than the genera of subfamily Lycodinae, was demonstrated.
Впервые исследована изменчивость нуклеотидных последовательностей генов COI, цитохрома b, 16S рРНК митохондриальной ДНК и гена RNF213 ядерной ДНК родов Lycenchelys и Lycodapus с целью определения их положения в системе семейства Zoarcidae. Обнаружено, что род Lycodapus гораздо ближе к группе родов “Lycogramminae” (Lycogrammoides, Bothrocara, Allolepis, Bothrocarhichthys), чем род Lycenchelys, но оба они на филогенетических деревьях расположены в кладе подсемейства Lycodinae. Показана генетическая неоднородность рода Lycenchelys, представленного двумя группами видов по характеру распространения северо-восточной тихоокеанской и антарктической, которые различаются значительнее, чем роды подсемейства Lycodinae.
С целью определения положения в системе подотряда Zoarcoidei проведено молекулярно-генетическое и сравнительно-морфологическое изучение представителя криворотовых рыб семейства Cryptacanthodidae криворота Берга Cryptacanthodes bergi из зал. Петра Великого (Японское море). Молекулярно-генетический анализ с использованием генов митохондриальной и ядерной ДНК показал существенное сходство криворота Берга с представителями надсемейства Stichaeoidae, что не подтвердило мнение Макушка о филогенетической обособленности криворотов от стихеевых и близких к ним семейств рыб. Обнаружены анатомические особенности в строении черепа, подтверждающие молекулярно-генетические данные. Обсуждаются пути и время проникновения криворотов в северо-западную Атлантику через пролив на месте Панамского перешейка примерно в конце миоценового периода.
To determine the taxonomic position of wrymouths of the family Cryptacanthodidae in the system of the suborder Zoarcoidei, a study on molecular genetics and comparative morphology of Cryptacanthodes bergi from Peter the Great Bay (Sea of Japan) is conducted. Based on molecular genetic analysis using the genes of nuclear and mitochondrial DNA, Cryptacanthodes bergi is substantially similar to the representatives of the superfamily Stichaeoidae. Thus, the opinion of Makushok on a phylogenetically distinct position of wrymouths in relation to snake blennies and related families is not supported. The anatomical features of skull structure support the data of molecular genetics. The directions and time of distribution of wrymouths in the northwest Atlantic through the channel in the area of the Isthmus of Panama in approximately the late Miocene are discussed.
The taxonomic status and relationships of the Askoldia, Pholidapus , and Opisthocentrus genera of the subfamily Opisthocentrinae are discussed based on comparative morphological and molecular genetic analysis. Isolation of the Pholidapus from the Opisthocentrus and the greater similarity of the former with the Askoldia were revealed. Morphological and genetic differences could not allow one to consider the Pholidapus as being within the Opisthocentrus . O. ocellatus and O. tenuis were closer within the Opisthocentrus and O. zonope was significantly different from these two species.
Chum salmon populations in the Russian Far East have a complex multi-level genetic structure. A total of 53 samples (2446 fish) were grouped into five major regional clusters: the southern Kurils, eastern Sakhalin, southwestern Sakhalin, the Amur River, and a northern cluster. The northern cluster consists of chum salmon populations from a vast geographical region, including Chukotka, Kamchatka, and the continental coast of the Sea of Okhotsk. However, the degree of its genetic differentiation is low, 1.9%. In contrast, the southern population cluster exhibits much higher variation; for example, differentiation between chum salmon groups within Sakhalin Island reaches 4.6%, and the differentiation between Iturup Island and Sakhalin Island chum salmon is 7.7%. This suggests that southern populations of Asian chum salmon have a more ancient evolutionary history than northern populations. In contrast to the available data, our study indicates a great deviation of southwestern Sakhalin populations from other Sakhalin chum salmon. The Russian Far East chum salmon are genetically diverse and show statistically significant differentiation even within small geographic localities. This can be used to assign samples of unknown origins to definite local populations.
Методом молекулярно-генетического анализа изучен род Neozoarces (подсем. Neozoarcinae) с целью выяснения его родственных связей и положения в системе подотряда Zoarcoidei. Сравнение с представителями других семейств подотряда показало, что наименьший уровень различий наблюдается между Neozoarces и подсемействами сем. Zoarcidae (среднее значение генетической дивергенции 11.9%), с которыми он образует общий кластер на филогенетическом дереве. От представителей сем. Stichaeidae Neozoarces отличается на таком же уровне (13.9%), как и от семейств Bathymasteridae, Pholidae, Ptilichthyidae и Zaproridae (14.0%). Результаты исследований подтверждают точку зрения Макушка (1961), впервые включившего подсем. Neozoarcinae в состав сем. Zoarcidae на основании сравнительно-морфологического изучения этих групп.
Впервые проведено молекулярно-генетическое изучение маслюковых рыб семейства Pholidae подотряда Zoarcoidei. Анализ изменчивости генов COI, цитохрома b, 16S рРНК митохондриальной ДНК свидетельствует о различной филогенетической обособленности таксонов семейства. Показаны необоснованность выделения подродов (или родов) Enedrias и Allopholis и правомерность включения их в состав рода Pholis. Установлена генетическая близость родов Pholis и Rhodymenichthys и их отличия от рода Apodichthys. Полученные результаты согласуются с данными Макушка (1958), выделявшего в составе семейства два подсемейства Pholinae (с родами Pholis и Rhodymenichthys) и Apodichthyinae (с родами Apodichthys, Xererpes и Ulvicola). Приведена определительная таблица видов, родов и подсемейств маслюков северной части Тихого океана.
The results of long-term research on the biology of the viviparous Fedorov eelpout Zoarces fedorovi from the Tauiskaya Guba in the Sea of Okhotsk are generalized. It was determined that in winter and spring this species inhabits strongly freshened sea areas and in summer and fall it inhabits, as a rule, estuarine areas in the tide effect zone. Z. fedorovi did not leave the coastal zone, even during the ebb, and could remain in colder fresh water up to 12 h a day. Data on the age, sexual and size structure of the catches, character of linear growth, increase in body mass and fecundity, size, as well as the growth rates of the larvae and fry during prenatal development of Z. fedorovi are cited.