掌叶鱼黄草是一种药用植物,但其药用成分的合成途径和调控基因尚不明确.为了进一步了解掌叶鱼黄草的遗传信息,探寻次生代谢产物合成的分子基础,本研究通过PacBio平台对掌叶鱼黄草进行了全长转录组测序.组装测序结果获得17 339个Unigene,注释了 17 163个Unigene.有8 606个Unigene参与了156条代谢通路.其中包含18条次生代谢产物合成通路,相关Unigene有395个.在这些通路中,苯丙素类、三萜类和叶酸等合成产物可能与掌叶鱼黄草的药用活性有关.本研究为掌叶鱼黄草后续次生代谢产物合成和药理机制研究工作提供基础,全长转录组序列信息可以为后续二代转录组测序结果拼接提供参考模板.
附生维管植物是热带森林中重要的特征性组分,研究附生维管植物对宿主树的选择性对热带森林生物多样性及生态系统保护有重要意义。该研究以海南热带雨林国家公园霸王岭片区热带云雾林中的附生维管植物为研究对象,通过设置21个20 m×20 m的固定样地,调查样地内所有胸径>1 cm的乔、灌木的数量、种类、胸径、植株高、基质类型及其上生长的附生维管植物的数量、种类,用混合线性模型、单因素方差、附生选择性指数分析附生维管植物分布与宿主树种、胸径、高度、基质类型(裸树皮、苔藓、凋落物及土壤)的关系。结果表明:在热带云雾林8 400 m~2样地内,附生维管植物共计51种2 650株,附生兰科植物和附生蕨类植物为优势类群,附着在10.6%的个体木上;附生维管植物多度和丰富度与宿主树胸径显著正相关;多度较大的琼崖石韦(Pyrrosia eberhardtii)、流苏贝母兰(Coelogyne fimbriata)、阴石蕨(Davallia repens)、蔓九节(Psychotria serpens)对宿主树种表现出一定的选择性,显著偏好1–4个树种;附生维管植物对轻基质类型(苔藓植物)也存在显著偏好,70%以上的附生维管植物生存在苔藓基质上。
为了更好地了解金钟藤的扩散机制,本试验对金钟藤种子萌发的环境因素进行研究,以野外采集的金钟藤种子为试验材料,比较种皮切损、光照、温度、干旱、自化感作用等不同因素对种子萌发的影响.结果表明,切损种皮能够显著促进种子的萌发;光照不改变种子的萌发率,但会影响种子萌发后根和芽的长度;28℃时种子萌发率最高,随着温度升高萌发率降低;PEG-6000溶液模拟干旱胁迫使得种子萌发率显著下降;高浓度的金钟藤叶片提取液阻碍了金钟藤种子的萌发.
为了进一步了解桐花树耐盐的分子机制,本研究采用Illumina HiSeq 2000高通量测序平台对桐花树叶片转录组进行测序,经de novo组装后获得73 721个Unigenes,进一步利用7个公共数据库(NR,NT,GO,COG,KEGG,SwissProt和InterPro)进行比对,注释了50 338个Unigenes.结果 表明,有34 991个Unigenes参与到136条KEGG通路上,其中在花青素和类黄酮合成途径中的Unigenes分别有49个和176个,这些基因可能参与了桐花树应对逆境的调控过程;此外,从转录组序列中搜索到34 509个SSR位点,其中二碱基重复出现次数最多,出现频率为65.75%;从转录组的数据中预测到了2 255个转录因子,分属于58个家族.本研究结果为桐花树的基因功能分析、分子标记开发和遗传多样性研究提供一定的理论参考.