L’aspergillose aviaire est une affection respiratoire fongique fréquente et souvent mortelle, principalement due à Aspergillus fumigatus . Elle touche de nombreuses espèces, notamment les psittacidés. Le cas décrit concerne une amazone à front bleu ( Amazona aestiva ) femelle de 7 ans, présentée en urgence pour amaigrissement et abattement, décédée trois jours plus tard. L’autopsie a révélé une pleurésie fibreuse diffuse et une pneumonie granulomateuse nécrotique marquée et étendue. L’examen histologique a mis en évidence de nombreux hyphes mycéliens septés et branchés à angles aigus, compatibles avec Aspergillus spp. Cette observation illustre les difficultés rencontrées dans le diagnostic de l’aspergillose en pratique aviaire: signes cliniques peu spécifiques, examens complémentaires limités et confirmation souvent post-mortem. Le traitement repose sur une association d’antifongiques systémiques et locaux, mais le pronostic demeure sombre, notamment dans les formes chroniques. La prévention reste la clé du contrôle de la maladie et repose sur une hygiène stricte, une bonne ventilation, un stockage approprié des aliments et une gestion raisonnée des traitements antibiotiques et corticoïdes.

Les objets connectés sont largement utilisés pour collecter des données cruciales sur la santé animale. Les auteurs présentent brièvement le panorama des objets connectés en élevage bovin, avant d’illustrer l'utilité de ces données ainsi que leurs limites en termes de diagnostic dans le cadre de la gestion de la santé animale. Ces notions sont illustrées en présentant des projets de recherche axés sur l'utilisation d’objets connectés pour gérer les maladies respiratoires bovines. Le développement d’outils d’aide à la décision (OAD), s’appuyant sur les données collectées par des objets connectés, aide à optimiser la conduite d’élevage en matière de santé animale. Ces OAD peuvent prédire des évènements de santé en couplant la détection d’évènements par des objets connectés et la prédiction de futurs événements par des modèles statistiques et mécanistes. Les modèles mécanistes, plus avancés, simulent divers scénarii pour concevoir des stratégies d'intervention. Ainsi, ces OAD contribuent activement à la gestion à court, moyen et long terme de la santé des élevages, favorisant, par exemple, un usage raisonné des antibiotiques par la détection précoce et le choix raisonné des animaux à traiter. Néanmoins, ces outils ne visent pas à remplacer les compétences des éleveurs et des vétérinaires. De plus, leur utilisation représente des impacts financiers et environnementaux certains. Le numérique, au travers des objets connectés, des OAD mais aussi au travers de la télémédecine vétérinaire et du « télémentorat » des jeunes vétérinaires ruraux, apparaît comme l’une des réponses possibles au manque de disponibilités des compétences vétérinaires.

Les affections cutanées des bovins sont fréquentes et parfois spectaculaires, mais trop souvent sous-estimées. Elles peuvent affecter la santé, le bien-être, les performances zootechniques, la qualité des carcasses et la valeur des peaux. Certaines sont contagieuses, d’autres révélatrices de déséquilibres nutritionnels ou de maladies générales. Pour le praticien, il est essentiel de savoir identifier ces lésions et d’en comprendre les causes pour orienter le diagnostic, adapter le traitement et conseiller l’éleveur. Cet article propose un panorama pratique des dermatoses bovines rencontrées en France métropolitaine, organisé par grandes catégories : affections congénitales, parasitaires (gale, pédiculose, démodécie, etc.), bactériennes (dermatophilose, dermatite digitée), fongiques (teigne), protozoaires (besnoitiose), inflammatoires (photosensibilisation), vasculaires (ergotisme), carentielles (carence en zinc) et tumorales (papillomes, lymphome, etc.). L’examen rigoureux des lésions, complété si besoin par des prélèvements, est indispensable. La peau peut refléter un dysfonctionnement global du troupeau. Le rôle du vétérinaire va au-delà du traitement : il doit alerter, prévenir et accompagner l’éleveur dans une approche globale intégrant environnement, alimentation, immunité et conduite d’élevage.

Une tumeur est une masse de tissu néoformé résultant d’un trouble de la prolifération et de la différenciation cellulaires, pouvant être bénigne ou maligne. Chez les bovins, leur fréquence est estimée à 0,06 % chez les adultes et 0,006 % chez les jeunes, avec des variations selon la race et l’exposition à des éléments cancérigènes. Les tumeurs sont souvent découvertes lors de l’abattage et ont des conséquences économiques significatives (baisse de production laitière et condamnation des carcasses). L’examen post mortem est essentiel pour déterminer la localisation, la nature et l’étendue des tumeurs. Il inclut une inspection minutieuse des organes internes. Les principales tumeurs rencontrées ainsi que leurs caractéristiques sont abordées. L’histopathologie est cruciale pour déterminer le type cellulaire et classer la tumeur. L’immunohistochimie et la PCR sont utilisées pour identifier des marqueurs spécifiques et des agents pathogènes viraux. Les tumeurs chez les bovins, bien que rares, posent des défis économiques et diagnostiques importants, nécessitant une sensibilisation accrue des vétérinaires pour une détection précoce et une gestion efficace.

Cet article décrit un cas clinique de processus tumoral généralisé chez une vache Prim’Holstein de 8 ans, examinée à la Clinique des Animaux d’Élevage et de Basse-Cour du CHUV d’Oniris. L’animal présentait une diminution de la production laitière, un amaigrissement et un dos voussé. Malgré un traitement pour une péritonite suspectée, aucune amélioration n’a été constatée. L’examen clinique a révélé une tachycardie, une turgescence des jugulaires, une augmentation de la fréquence respiratoire et des nodules rectaux. Les examens complémentaires ont montré une hyperprotéinémie et un test au glutaraldéhyde positif. L’autopsie a révélé des exsudats thoracique et abdominal, une péritonite fibrineuse, une pleuro-péricardite, des lésions nodulaires sur divers organes et une adénomégalie mésentérique. L’examen histopathologique a conclu à un carcinome trabéculaire infiltrant de malignité élevée, probablement d’origine ovarienne. Le diagnostic différentiel inclut les tumeurs utérines, ovariennes, les mésothéliomes et les péritonites. Les tumeurs ovariennes et utérines sont fréquentes chez les bovins, avec une prédisposition pour les vaches âgées. Le mésothéliome péritonéal, bien que plus fréquent chez les veaux, doit également être considéré. Seul l’examen histologique permet un diagnostic de certitude. Ce cas souligne l’importance de l’examen post mortem pour établir un diagnostic précis face à des lésions tumorales généralisées.

Une vache Prim’Holstein de 9 ans, présentant des lésions ulcéreuses cutanéo-muqueuses, a été autopsiée. L’examen nécropsique a révélé une hépatite nécrosante multifocale extensive, une cholangite fibrineuse sévère et une cholécystite fibrineuse diffuse. Ces lésions hépatobiliaires sont compatibles avec une photosensibilisation hépatogène (type III), consécutive à une incapacité d’élimination de la phylloérythrine. Les lésions cutanées érythémateuses et ulcéreuses sévères, localisées aux jonctions cutanéo-muqueuses, en sont les conséquences visibles. L’analyse histologique a confirmé la nécrobacillose hépatique à Fusobacterium necrophorum , malgré l’absence de mise en évidence bactériologique. La liste du diagnostic différentiel est également discutée. Ce cas illustre l’importance de considérer la photosensibilisation hépatogène comme conséquence secondaire d’atteintes hépatiques infectieuses. Le retrait du pâturage, la photoprotection et le traitement des lésions cutanées sont essentiels pour limiter les complications.

Connected devices are widely used on farms to collect crucial data on animal health. The authors provide an inventory of existing connected devices in cattle farming, before illustrating the importance of the data provided by these devices and their limitations in terms of diagnosing animal health issues. These concepts are illustrated by presenting research projects focused on the use of connected objects to manage bovine respiratory diseases. The development of decision support tools (DST) based on data collected by connected objects is central to optimizing animal health management. These DSTcan predict health events by combining the detection of events by connected objects and the prediction of future events using statistical and mechanistic models. The more advanced mechanistic models simulate various scenarios to design intervention strategies. In this way, these DST make an active contribution to the short-, medium-and long-term management of farm animal health, promoting, for example, the rational use of antibiotics through early detection and the rational choice of animals to be treated. However, these tools are not intended to replace the skills of farmers and veterinarians. In addition, their use has a definite financial and environmental impact. Digital technology, in the form of connected objects and DST, as well as veterinary telemedicine and telementoring for young rural vets, appears to be one of the possible solutions to the shortage of veterinary skills.

A necropsy is the final medical diagnostic procedure performed on a deceased animal to determine the cause of death. The aim of a necropsy is to investigate and define as precisely as possible the cause of death of the animal, or to identify and confirm the suspected pathological process. It is a medical examination. It consists of several stages, and must be carried out in premises dedicated to this activity, in accordance with the regulations. A summary report must be drawn up and signed by the pathologist to record the observations made. The samples and analyses, if needed, must be taken as soon as possible after the body'arrival at the laboratory.

Summary Otitis media secondary to trigeminal nerve (CN‐V) paralysis is described in dogs and humans but not in horses. An 18‐month‐old Quarter Horse colt was presented with history of mastication difficulties and a nonhealing corneal ulcer. Clinical findings were consistent with paralysis of the right CN‐V. Computed tomography imaging showed otopathy media and a mass at the root of the CN‐V. The colt was euthanised due to poor prognosis. Post‐mortem magnetic resonance imaging showed enlargement of the right CN‐V which was slightly hyperintense on T2W. Histopathology of the mass revealed fusiform tumoural cells, positive on vimentin‐ and S100 immunohistochemistry, consistent with a schwannoma. Otitis media was presumed secondary to CN‐V paralysis and denervation of the right tensor veli palatini muscle involved in opening of the Eustachian tube. This is the first case of trigeminal schwannoma and secondary otopathy media described in a horse, which highlights the importance of imaging in investigating trigeminal nerve paralysis.

Background: Intussusception diagnosis and surgical management in axolotls (Ambystoma mexicanum) is poorly documented. Case Description: A client-owned, 5-year-old, sexually intact, female axolotl was presented for hyporexia of 4-week duration associated with regurgitation after feedings. Clinical examination showed lethargy, weight loss, and firm tissue at coelomic palpation. Coelomic ultrasonography was consistent with an intestinal intussusception. An exploratory coeliotomy was performed, followed by an intestinal resection and anastomosis of a thickened por-tion of intestinal loop. Following surgical excision of the invaginated intestinal loops, anorexia was not resolved, and the axolotl died 4 days later. A necropsy revealed a serofibrinous coelomitis. Histopathology confirmed the presence of an obstructive mass in the resected portion of the intestines. Conclusion and Case Relevance: This report describes an intussusception diagnosis and attempted treatment in an axolotl. Ultrasonography in axolotls with nonspecific gastrointestinal symptoms is recommended for evaluation of the coelomic organs.

Clostridial infections in goats have been associated frequently with enteric diseases or gas gangrene but very rarely with the reproductive system. We describe here 12 cases of fatal postpartum gangrenous metritis in does associated with infection by several clostridial species. Clinically, these cases were characterized by rapid onset of hyperthermia followed by death after kidding. On postmortem examination, the uteri appeared to be necrotic and were hemorrhagic and edematous. Microscopically, the uteri had diffuse coagulative necrosis, edema, hemorrhage, and fibrinous thrombi with intralesional gram-positive rods. Clostridium perfringens was isolated from 7 of 9 uterine samples cultured, and C. perfringens, C. septicum, C. novyi, or C. chauvoei were demonstrated by immunohistochemistry (IHC) in the 5 cases examined. IHC for Paeniclostridium sordellii was negative in all 5 cases. PCR performed on 3 of the C. perfringens isolates was positive for alpha toxin and perfringolysin, identifying these isolates as type A. Clostridial infection should be considered in cases of postpartum gangrenous metritis of does.

We analyzed juvenile mortality rates per sire family for four different periods in a population of Holstein heifers born between 2017 and 2020 in France and Wallony. The global mortality rate from birth to one year of life was 11.8% in the population of 1,001 sires, while it reached 30.6 and 19.9% in the progeny of two bulls, Mo and Pa, respectively. Various investigations were carried out on these two bulls and their progeny, including clinical examination, karyotyping, genetic mapping, and whole genome sequencing. Mo was found to carry a partial translocation from BTA29 to BTA26 while Pa was mosaic for a dominant nonsense mutation in the GATA6 gene causing cardiac outflow tract defect in its progeny.

Reducing juvenile mortality in cattle is important for both economic and animal welfare reasons. Previous studies have revealed a large variability in mortality rates between breeds and sire progeny groups, with some extreme cases due to dominant mutations causing various syndromes among the descendants of mosaic bulls. The purpose of this study was to monitor sire-family calf mortality within the French and Walloon Holstein populations, and to use this information to detect genetic defects that might have been overlooked by lack of specific symptoms. In a population of heifers born from 1,001 bulls between 2017 and 2020, the average sire-family mortality rates were of 11.8% from birth to 1 year of age and of 4.2, 2.9, 3.1, and 3.2% for the perinatal, postnatal, preweaning, and postweaning subperiods, respectively. After outlining the 5 worst bulls per category, we paid particular attention to the bulls Mo and Pa, because they were half-brothers. Using a battery of approaches, including necropsies, karyotyping, genetic mapping, and whole-genome sequencing, we described 2 new independent genetic defects in their progeny and their molecular etiology. Mo was found to carry a de novo reciprocal translocation between chromosomes BTA26 and BTA29, leading to increased embryonic and juvenile mortality because of aneuploidy. Clinical examination of 2 calves that were monosomic for a large proportion of BTA29, including an orthologous segment deleted in human Jacobsen syndrome, revealed symptoms shared between species. In contrast, Pa was found to be mosaic for a dominant de novo nonsense mutation of GATA 6 binding protein (GATA6), causing severe cardiac malformations. In conclusion, our results highlight the power of monitoring juvenile mortality to identify dominant genetic defects due to de novo mutation events.

Dans le cadre de ses activites de consultations, ONIRIS offre, via des lunettes connectees, une teleexpertise aupres des veterinaires ruraux. Ce service donne au veterinaire, lors de ses consultations, acces en temps reel voix et video a un expert situe dans son lieu de travail devant son ordinateur afin de guider le veterinaire dans son intervention. Le lieu d’exercice de ces praticiens se situe majoritairement dans les exploitations agricoles en milieu rural generalement caracterise par une couverture reseau tres aleatoire. De plus, dans les exploitations agricoles, les bâtiments d’elevage en tole metallique font souvent obstacle a la propagation radio. Un tel contexte geographique et architectural peut devenir redhibitoire pour le deploiement, l’usage effectif et l’adoption par les veterinaires, de services comme la teleexpertise. Dans ce travail, une solution simple d’utilisation necessitant un minimum de manipulations par les veterinaires, est proposee pour permettre a ces derniers, de pouvoir communiquer sans interruption et avec une qualite de son et d’image nettement amelioree lors de leurs interventions en milieu rural. Dans un premier temps, une etude en laboratoire est menee pour etudier les differentes situations de pertes de connectivite. Differentes solutions techniques sont developpees en prenant en compte les differents cas de figure que peuvent rencontrer les veterinaires lors de leurs interventions en milieu rural. Ces solutions sont evaluees par des series de tests en situation operationnelle, obeissant au format de l’epidemiologie descriptive dans des exploitations en Loire Atlantique et dans le Maine et Loire, selectionnees pour leurs connectivites reseaux defaillantes. Les experimentations montrent que dans toutes les exploitations visitees, quel que soit le niveau de couverture de la zone, quel que soit le type de bâtiment ou se fait le test, les solutions proposees compensent la mauvaise connectivite et permettent au praticien de realiser correctement ses operations.

The amyloidoses constitute a group of diseases occurring in humans and animals that are characterized by abnormal deposits of aggregated proteins in organs, affecting their structure and function. In the Abyssinian cat breed, a familial form of renal amyloidosis has been described. In this study, multi-omics analyses were applied and integrated to explore some aspects of the unknown pathogenetic processes in cats. Whole-genome sequences of two affected Abyssinians and 195 controls of other breeds (part of the 99 Lives initiative) were screened to prioritize potential disease-associated variants. Proteome and miRNAome from formalin-fixed paraffin-embedded kidney specimens of fully necropsied Abyssinian cats, three affected and three non-amyloidosis-affected were characterized. While the trigger of the disorder remains unclear, overall, (i) 35,960 genomic variants were detected; (ii) 215 and 56 proteins were identified as exclusive or overexpressed in the affected and control kidneys, respectively; (iii) 60 miRNAs were differentially expressed, 20 of which are newly described. With omics data integration, the general conclusions are: (i) the familial amyloid renal form in Abyssinians is not a simple monogenic trait; (ii) amyloid deposition is not triggered by mutated amyloidogenic proteins but is a mix of proteins codified by wild-type genes; (iii) the form is biochemically classifiable as AA amyloidosis.

Circulating tumor DNA (ctDNA) has become an attractive biomarker in human oncology, and its use may be informative in canine cancer. Thus, we used droplet digital PCR or PCR for antigen receptor rearrangement, to explore tumor-specific point mutations, copy number alterations, and chromosomal rearrangements in the plasma of cancer-affected dogs. We detected ctDNA in 21/23 (91.3%) of histiocytic sarcoma (HS), 2/8 (25%) of oral melanoma, and 12/13 (92.3%) of lymphoma cases. The utility of ctDNA in diagnosing HS was explored in 133 dogs, including 49 with HS, and the screening of recurrent PTPN11 mutations in plasma had a specificity of 98.8% and a sensitivity between 42.8 and 77% according to the clinical presentation of HS. Sensitivity was greater in visceral forms and especially related to pulmonary location. Follow-up of four dogs by targeting lymphoma-specific antigen receptor rearrangement in plasma showed that minimal residual disease detection was concordant with clinical evaluation and treatment response. Thus, our study shows that ctDNA is detectable in the plasma of cancer-affected dogs and is a promising biomarker for diagnosis and clinical follow-up. ctDNA detection appears to be useful in comparative oncology research due to growing interest in the study of natural canine tumors and exploration of new therapies.

Veterinary autopsy requires a high level of expertise and skills that not all veterinarians necessarily master, especially in the context of the desertification of rural areas.The development of support systems is a challenging issue, since such a tool, to be considered relevant and accepted by practitioners in their diagnosis process, must avoid any black box effect.The diagnosis support system we introduce here, IVAN ("Innovative Veterinary Assisted Necropsy"), aims to engage the user in an explicit, understandable, validable and reviewable process, able to cope with the specific issues of cattle necropsy.Besides, it provides uncertainty management to deal with approximate lesion descriptions.IVAN relies on a Bayesian network to infer relevant proposals at each step of the diagnostic process.IVAN was trained on a set of real autopsy cases from autopsy reports, and its performance was assessed using another set of reports.In addition, the tool had to provide results in short response time and be able to run the application on mobile device and web server.In addition to demonstrating the feasibility of the approach, IVAN is a first step towards other support systems in other species and in broader contexts than autopsy.

In young cattle, bovine respiratory disease (BRD) is a major cause of death and Mannheimia haemolytica is a frequent pathogen. Knowledge of fatal BRD in adult cattle is more limited. We assessed the importance of infectious BRD as a cause of death in adult cattle and determined the associated pathogens. We analyzed data from 737 adult cattle necropsies at the Pathology Unit for Large Animals at Oniris, Nantes, France over a 6 year period (2013–2019). Each carcass was subjected to a complete necropsy. Lungs showing macroscopic lesions were classified into three categories: infectious primary pulmonary (IPP) lesions, thromboembolic pneumonia (TEP) and others (aspiration pneumonia, verminous pneumonia, and local extension of an extra-pulmonary inflammatory process). Half of the lungs with IPP macroscopic lesions were sampled for histology and submitted for polymerase chain reaction. BRD was the second leading cause of death (15.7%) after digestive diseases (32.2%). A strong predominance of IPP lesions (42.3%) and TEP lesions (39.6%) was also demonstrated. In IPP macroscopic lesions, fibrinous, hemorrhagic and/or hecrotic (FHN) bronchopneumonia accounted for 77.6% of macroscopic lesions. Mannheimia haemolytica was significantly associated with FHN bronchopneumonia macroscopic lesions. This study suggests that Mannheimia haemolytica should be included in the differential diagnosis of BRD in adult cattle.