Meta: La tuberculosis (TB) constituye uno de los principales problemas de salud pública a nivel mundial, con 10,6 millones de casos y 1,4 millones de muertes en 2021. Nuestro objetivo fue describir los parámetros citoquímicos y resultados microbiológicos del líquido cefalorraquídeo (LCR) analizado en casos de tuberculosis meníngea (TBM) entre 2017 y 2022. Método: Estudio descriptivo, observacional y retrospectivo. Se incluyeron muestras de LCR de pacientes con TBM. En el laboratorio de referencia para micobacterias (CHLA) se realizó estudio citoquímico, baciloscopia post citocentrifugación (desde 2020), Xpert MTB/ RIF y cultivo. Conclusión: En el período analizado se confirmaron 12 casos de TBM: 2017 (2), 2018 (1), 2019 (0), 2020 (4), 2021 (4) y 2022 (1). Predominó el sexo masculino con 11 casos. La edad promedio fue de 42.8 (DS 10.9) Un caso solo correspondió al sexo femenino, solo fallecidas. En cuanto a los parámetros citoquímicos obtenidos: la glucorracia tuvo una media de 0,34 g/l (DS 0,17), proteinorraquia 1,65 g/l (DS 1,46), lactato 62 mg/dl (DS 24), leucocitos 143 mm3 (DS 123), mononucleares 66% (DS 33) y polimorfonucleares 34% (DS 27). En relación con la microbiología, 3/12 (25%) baciloscopía positiva, 10/12 (83%) Xpert MTB/RIF positivo, 2/10 positivo, 11/12 cultivo confirmado (92%). El caso no fue confirmado por cultivo con Xpert MTB/ RIF positivo y cambios citoquímicos característicos de TBM. Un único caso fue resistente a rifampicina por Xpert MTB/RIF, confirmado fenotípicamente, siendo el resto sensibles a rifampicina e isoniacida. Nuestras características citoquímicas en el LCR analizado mostraron valores esperados para TBM, lo que indica que este estudio es fundamental de cara al espéculo clínico. El cultivo de micobacterias sigue siendo el estándar de oro para el diagnóstico de TBM.
Meta: Las infecciones por micobacterias no tuberculosas (NTM) han aumentado en todo el mundo, son de naturaleza ubicua y se encuentran en el agua, el suelo y los animales. En Uruguay, las infecciones de piel y tejidos blandos (TBPI) por MNT son raramente descritas. El objetivo es reportar tres casos de IPTB por M. chelonae en pacientes que desarrollaron lesiones cutáneas granulomatosas crónicas en los sitios de inyección de apiterapia, aplicada en la misma clínica privada. Método: El primer y segundo paciente consultaron al dermatólogo en noviembre de 2022 y el tercero en marzo de 2023. El paciente recibió 1 tratamiento antibiótico sin mejoría previa en el estudio micobacteriano. Debido a los datos clínicos y epidemiológicos, también se enviarán muestras de biopsias de piel de otros pacientes. Conclusión: En los tres casos se realizó tinción alcohol ácido resistente con Ziehl Neelsen, siendo negativa en el caso 1 y positiva en los casos 2 y 3, el Xpert MTB/RIF Ultra, realizado solo en el caso 2, resultó negativa para complejo M. tuberculosis. Las tres muestras fueron cultivadas en agar sangre e incubadas durante suete a 10 días a 28°C en atmósfera aerobia, creciendo en menos de 10 días una micobacteria de crecimiento rápido (RGM), identificada como Mycobacterium chelonae por análisis proteómico (Maldi-Tof) en el caso 1 y 2. Las tres cepas fueron confirmadas a nivel genotípico por GenoType Mycobacterium CM/AS. Las pacientes recibieron tratamiento antibiótico combinado con macrólidos/ fluoroquinolonas y lincosamidas/fluoroquinolonas con mejoría de las lesiones cutáneas. Todas las cepas fueron sensibles a macrólidos y aminoglucósidos por pruebas genotípicas, mostrando sensibilidad a amikacina, claritromicina y tobramicina y resistencia a ciprofloxacina/moxifloxacina, trimetoprim/sulfa y doxiciclina por método fenotípico (cepa 1 y 2). Este es el primer reporte de infección por M. chelonae posterior a apiterapia en América Latina, lo que debe alertar a los médicos sobre esta posible infección.
Whole-genome characterisation in clinical microbiology enables to detect trends in infection dynamics and disease transmission. Here, we report a case of bacteraemia due to Campylobacter fetus subsp. fetus in a rural worker under cancer treatment that was diagnosed with cellulitis; the patient was treated with antibiotics and recovered. The routine typing methods were not able to identify the microorganism causing the infection, so it was further analysed by molecular methods and whole-genome sequencing. The multi-locus sequence typing (MLST) revealed the presence of the bovine-associated ST-4 genotype. Whole-genome comparisons with other C. fetus strains revealed an inconsistent phylogenetic position based on the core genome, discordant with previous ST-4 strains. To the best of our knowledge, this is the first C. fetus subsp. fetus carrying the ST-4 isolated from humans and represents a probable case of zoonotic transmission from cattle.
We have assessed the frequency of Shiga toxin-producing Escherichia coil (STEC) in clinical and food samples as well as studied the genotypic and phenotypic characteristics of the recovered strains. One hundred ninety eight fecal samples from children with bloody diarrhea (BD), 14 from children with hemolytic uremic syndrome (HUS), 220 ground beef samples and 4 STEC isolates from other beef-derived products were analyzed. The STEC strains were isolated from 3 (1.5%) children with bloody diarrhea, 1 (7%) from a child with HUS and 4 (1.8%) from ground beef samples. All strains were eae and ehxA positive. The serotypes found were: O157:H7 (9 strains), O26:H11 (2), O111: NM (1) and O145:HNT (1). All O157:H7 STEC strains harbored the eae subtype gamma1, O26:H11 and O145:HNT strains, subtype beta1 and O111:NM strain, subtype gamma2/theta. The STEC strains of the same serogroup showed high genetic diversity. In Uruguay, STEC is not frequently isolated from cases of bloody diarrhea in children. However, all the recovered STEC strains carried the genes associated with severe disease and 2 out of 3 children infected with STEC developed HUS. Ground beef and other food products might be important vehicles for O157:H7 strains.
We studied 13 extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing enteropathogenic Escherichia coli isolates from children suffering acute diarrhea in Uruguay. ESBL characterization in crude extracts showed a single band at pI 5.4. PCR amplification and sequencing data allowed identification of blaPER-2 and blaTEM-116. Retrospective analysis suggests that these strains were disseminated in the community, even if unnoticed, prior to their access to the hospital environment more than a decade ago.
Strains of Mycobacterium tuberculosis were compared using two DNA fingerprinting techniques: Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) and Double-Repetitive-Element-PCR (DRE-PCR). Two of these strains: IH1 (susceptible to isoniazid) and IH2 (resistant to isoniazid) were recovered from cases of pulmonary tuberculosis which occurred in two brothers who lived together. The first one was recognized on July 1999, and the second was diagnosed one year later. IH1 and IH2 showed the same pattern of bands with both molecular tests. These results suggest that single drug chemoprophylaxis may occasionally select resistant strains for that drug, which can eventually cause disease and be recognized through these tests. Strains IH3, IH4 and IH5 were obtained from sputum samples of 3 different patients, and intra-laboratory cross-contamination was suspected when it was realized that the 3 positive materials had been consecutively processed the same day by the same worker in the same biological safety cabinet. Again, the 3 strains revealed identical band patterns with RFLP and DRE-PCR, confirming the posed suspicion. The results with DRE-PCR were obtained after only 8 hours of work, without the need for subcultures. This procedure allows quick correction of treatment conducts, avoiding unnecessary exposure of people and bacteria to antimicrobial drugs.