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长期致力于科技进步、生产率、经济形势分析与预测、工程项目技术经济评估、资源与环境、可持续发展和区域规划等领域的研究。他较早提出了符合中国实际的工程技术经济论证理论与方法,采用科学方法对中国经济作年度与长期预测和产业结构与地区发展的研究,曾主持多项国家重大工程项目论证和环渤海经济圈、中部五省、海南、深圳等地区经济发展战略规划等项目;曾担任三峡工程、南水北调工程、京沪高速铁路等重大工程项目技术经济论证专家组负责人。主持国家重大课题《技术进步与产业结构》、《中国经济形势分析与预测》、《1996~2010年中国经济发展预测》、《1998~2050年中国经济发展与预测》、《生产率与中国经济增长》、《经济增长方式转变综合研究》、《北京市经济增长与产业结构优化 (1996~2010)》等项目的研究工作,近年主持研究的重大项目有:《矿产资源可持续发展战略的经济分析与宏观政策》、《城市化中的经济问题》、《中国油气资源可持续发展战略的立法与政策措施研究》、《区域经济问题研究》、《技术标准与科技研发协调发展战略理论研究》《振兴我国老工业基地-可持续发展研究》、《青藏铁路运营效益及政策支持研究》,以及国家“863”重大攻关课题《高速磁浮交通系统在长大干线适用性-宏观技术经济问题》等重大课题的研究工作。2005年以来,以李京文院士为首在北工大组建了“北京重大经济社会问题研究”创新团队,每年为北京市政府提供《北京经济形势分析预测》、《北京现代制造业发展研究报告》、《艾滋病对我国经济和社会影响的分析及其控制机制》等研究报告,为政府部门提供决策参考。同时李京文院士参与了中国工程院《三峡水利枢纽工程阶段性评估》的研究工作,并主持了《中国铁路技术创新模式研究》、《高速磁浮交通技术创新及产业化研究》以及《“十二五”规划政策支撑研究》等国家重大课题的研究工作,且同时担任国家中长期科技规划总体组顾问委员会顾问等重要社会职务。

2001年,李京文当选中国工程院院士。2002年当选为中国工程院工程管理学部常委。