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已完成的包括:1)用于双样本ChIP-Seq数据定量比较和差异结合分析的计算模型MAnorm(Genome Biology 2012),以及它的后续版本MAnorm2用于多样本ChIP-Seq数据定量比较;2)转录因子结合motif分析包Motif-Scan,以及它与MAnorm结合用于寻找细胞类型特异性调控因子的分析工具MAmotif;3)用于统计比较分析基于同位素标记技术生成的定量蛋白组数据的MAP模型。同时,通过应用所开发的新计算工具,我们希望能够更深入地发掘:1)生物分子之间相互作用的机制,如PRC2在长非编码RNA上结合的序列依赖性(Scientific Reports 2017);2)基因组元件的未知功能和结构特征,如一些特殊增强子元件的功能和结构特征。
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论文共 65 篇作者统计合作学者相似作者
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Yingying Chen, Fengxiang Tan,Xianfa Yang, Qing Fang, Lin Zhang,Jiaoyang Liao, Penglei Shen, Yun Qian, Mingzhu Wen, Rui Song, Yonggao Fu, He Jax Xu,
biorxiv(2024)
Haojie Chen,Tao Huang, Zhijie Guo, Anqin Zheng,Weiran Chen,Liangxiao Ma,Shiqi Tu,Guangyong Zheng,Yixue Li,Zhen Shao
crossref(2024)
Science Advancesno. 21 (2023)
The journal of pathology. Clinical researchno. 5 (2023): 409-422
引用0浏览0WOS引用
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Fei Yuan,Yana Li,Rui Hu, Mengting Gong,Mengyao Chai, Xuefei Ma,Jiaxue Cha, Pan Guo,Kaijiang Yang,Mushan Li,Minglu Xu,Qing Ma,
biorxiv(2021)
Genomics, proteomics & bioinformaticsno. 3 (2021): 408-422
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