全基因组选择是通过覆盖全基因组的分子标记获取遗传信息,以目标性状基因组育种值作为个体选择依据的策略,该技术使遗传评定准确性得到明显的提升,有利于加快育种进展.随着全基因组选择技术在种猪育种实践中不断地推广应用,该技术已成为我国种猪遗传改良的关键技术.本文综述了全基因组选择涉及的分型技术、应用策略、统计模型的发展现状,并探讨猪遗传育种中的全基因组选择技术的发展方向和应用前景.

为探讨大白母猪在不同妊娠阶段的背膘厚对繁殖性能的影响,在妊娠前期、中期、后期对怀孕母猪进行背膘测定,根据测定的背膘厚将每个阶段的母猪分为3组,同时记录母猪窝总产仔数、窝产活仔数、产死胎数、初生窝重和仔猪平均初生重.结果表明,在妊娠前期,1组(背膘厚<14 mm)、2组(背膘厚介于14～19 mm)的窝总产仔数分别为13.54头、13.35头,显著高于3组(背膘厚>19 mm)的12头(P<0.05);1组、2组的窝产活仔数分别为12.95头、12.86头,显著高于3组的11.35头(P<0.05);1组的初生窝重为20.31 kg,极显著高于3组的17.18 kg(P<0.01),显著高于2组的19.46 kg(P<0.05);1组的平均初生重为1.58 kg,显著高于2组的1.53 kg(P<0.05).在妊娠中期,在母猪的窝总产仔数、窝产活仔数、死胎数和平均初生重上3个组均无显著差异;1组的初生窝重为19.71 kg,显著高于3组的18.20 kg(P<0.05).妊娠后期母猪在窝总产仔数、窝产活仔数和死胎数上3个组均无显著差异;1组的初生窝重为19.23 kg,显著高于3组的18.24 kg(P<0.05),1组、2组仔猪的平均初生重分别为1.56 kg、1.53 kg,显著高于3组的1.49 kg(P<0.05).本研究表明,妊娠前期母猪膘情适中对提高窝总产仔数、窝产活仔数和仔猪初生重有积极作用,妊娠中后期背膘厚对窝产仔数没有太大影响,对仔猪初生重影响较大.

[Objective]Exploring the difference in prediction accuracy between genome selection(GS)and traditional BLUP methods in the presence of a large number of non-genotype reference populations.Assessing the application effect of GBLUP and ssGBLUP in the joint evaluation to provide recommendations for joint evaluation.[Method]Two straits of days to reach 100 kg(DAYS_100)and the average backfat thickness at 100 kg(BFT_100)were analyzed in six Yorkshire populations,and the heritability and genetic correlation of the two traits were estimated.Exploring the prediction accuracy of BLUP,GBLUP and ssGBLUP models in different populations and combined populations.[Result](1)In F population,the heritability of BFT_100 was only 0.071,while in other populations it was between 0.205 and 0.383.The heritability of DAYS_100 in six populations ranged from 0.258 to 0.598.(2)The genetic correlation between the two traits in D population was 0.211,however,in other populations,the genetic correlations were negative,ranging from-0.462 to-0.200.(3)For DAYS_100 trait,the GBLUP model showed the best prediction accuracy in B,C,E,and F populations.For BFT_100 trait,the ssGBLUP model had the best prediction accuracy in populations A,B,and C,while the GBLUP model performed better in populations D and E.(4)The connectedness rating(CR)between F and A population was 3.096%.In F population,single-step genomic selection using combined reference populations can improve the prediction accuracy of BFT_100 trait.[Conclusion]When the number of genotyped individuals in the population exceeds 500 and the proportion is above 7%,the prediction accuracy of GBLUP or ssGBLUP model will be higher than that of BLUP model.ssGBLUP model can be used to improve the prediction accuracy of low heritability traits in joint population that the CR reaches 3%between population.

该研究旨通过全基因组关联分析定位影响长白母猪断奶至配种间隔的候选基因,以期为我国种猪育种工作提供理论参考.本研究以国家某核心育种场1 063头长白母猪的断奶至配种间隔记录和50K基因数据为研究材料,利用GEMMA软件的混合线性模型进行全基因组关联分析(GWAS),鉴定关联分析显著位点.结果表明,长白母猪第一胎次和第三胎次共存在5个显著SNPs.对5个显著位点进行单倍型分析,获得4个单倍型块.筛选到的BTG1、FUT1、FUT2、SCNN1G和CBLB基因可能是影响断奶至配种间隔性状的重要基因,该研究结果可作为以后种猪育种实践提供参考.

生猪产业是关乎国计民生的重要产业,种猪是生猪产业发展的基础和关键,要想加快种猪性能改良进展,需要基因组选择技术的应用.本文从现场实际育种工作出发,介绍一款种猪育种分析平台.该平台是在Linux系统下,基于C#语言和.net语言共同开发完成,可在Windows10 系统下运行.该平台可以大幅度降低现场育种人员的工作量,使其可以更加便捷地使用基因组选择技术进行育种,加快推进种猪育种工作.另外,在未来的发展中,平台还会根据不同企业或者实际情况整合更多的理论成果,比如:系谱校正、全基因组关联分析等.

基因组选择作为我国种猪遗传评估的一项实用技术已在全国推广应用,近年来国家和区域种猪基因组联合育种平台相继建立,作为该技术落地应用的技术支撑.在企业层面,需要根据自身育种工作基础和育种目标等情况,合理制定本企业的种猪基因组选育方案,利用好种猪基因组育种平台,通过该技术的落地应用来加速育种进展,更快更好地达到既定的育种目标.本文根据基因组选择技术基本原理和种猪育种的特殊情况,对集团化种猪企业基因组选择技术方案制定关键环节进行总结;此外,基于杜洛克种猪群体数据,系统分析了基因组早期选择的准确性和种猪选留效果.结果表明,通过基因组早期选择,断奶时提前阉割排名靠后的45％小公猪的情况下,依然能准确选出top5％和top10％的优秀公猪,表明可以通过基因组早期选择,同时达到准确选出优秀公猪和降低测定量的双重目标.

研究旨在揭示不同初配日龄对美系大白种猪产仔数、初生窝重、初生仔猪平均个体重、初生仔猪均匀度、校正21日龄窝重及母猪使用寿命的影响程度及变化规律,挖掘大白母猪的适宜初配日龄,以期为更好地利用初配日龄来辅助种猪选育及现场生产实践工作提供理论依据.选取华东某国家核心育种场717头母猪的2 167条繁殖数据及23 710条后裔信息数据,初配日龄划分为220 d及以下、221～240 d、241～260 d、260 d以上4个阶段进行单因素方差分析.结果表明,不同初配日龄对美系大白母猪产仔数、初生窝重及校正21日龄窝重影响不显著,对初生仔猪平均个体重、初生仔猪均匀度和母猪使用寿命有显著影响.初配日龄越小,初生仔猪平均个体重越大、均匀度越好、母猪使用寿命越长.因此,美系大白种猪适宜的初配日龄为210～240 d阶段.

本研究旨在揭示固定效应(产活仔数、分娩胎次、配种季节以及妊娠天数)对初生仔猪均匀度和窝内平均重的影响程度和变化规律,为种猪的生产和选育提供数据支撑和理论依据.选取华东某国家生猪核心育种场3663条大白猪繁殖数据进行分析.结果表明:产活仔数、分娩胎次和配种季节对初生仔猪的均匀度和窝内平均重均有显著影响,妊娠天数只对窝内平均重有显著影响,而对初生仔猪均匀度影响不显著;产活仔数越多,2胎后分娩胎次越多,初生仔猪均匀度越差、窝内平均重越小;秋季配种的母猪其出生仔猪均匀度最好但窝内平均重最小;妊娠天数越长的仔猪窝内平均重越大,但过长和过短的妊娠天数都不利于初生仔猪的均匀度.

在规模化猪场生产中,母猪淘汰、后备猪发情、肥育猪生长速度等直接影响猪场的生产成绩.笔者就亲身经历,总结几点在生产中容易被忽视的问题,一是产活仔数经常受到人为因素的干扰,存在漏报现象,造成母猪由于产仔数低而出现误淘;二是在后备母猪发情方面,由于密度和光照差异造成后备母猪不发情而出现大量淘汰现象;三是栏舍结构等环境因素严重影响肥育猪的生长速度,导致养殖成本的增加.文章将讨论如何杜绝这3个方面因素,来提高猪场生产成绩.

为研究种公猪精液远距离运输的效果，分别统计了两个场引进种公猪精液的运输、精液品质检测、配种分娩和后代生长性能测定数据。采用方差分析来比较引进精液和场内精液在精液活力、配种分娩率、总仔数、活仔数、畸形仔数、初生窝重、后裔生长性能等。结果表明：1）引进精液和场内精液相比较，精液活力差异不显著，配种分娩率、产仔性能、生长性能3方面差异也均不显著；2）配种分娩率和产仔性能在场间的差异也不显著，校正100 kg体重日龄和背膘厚两个场之间的差异显著，可能是因为遗传背景和饲养管理不同。结论是，种猪精液远距离运输对精液的正常使用没有影响。