为探究一个受低温诱导的香蕉MaTIFY9基因的序列特征及在不同激素和逆境胁迫处理下的表达模式,分别使用PCR和反转录PCR (RT-PCR)技术克隆该基因的gDNA和cDNA序列,分析其核苷酸和编码蛋白序列特性,利用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术研究其在不同器官和不同激素、逆境胁迫处理下的表达情况.结果 显示:MaTIFY9编码了一个分子式为C841H1346N236O249S7,氨基酸大小为172 aa,分子量为18989.93,等电点为9.55的不稳定亲水性蛋白.MaTIFY9无信号肽和跨膜结构,具有TIFY和Jas (CCT-2)两个保守结构域,属于JAZ亚家族,与小果野蕉TIFY9亲缘关系最近.亚细胞定位预测结果显示MaTIFY9主要定位于细胞核.MaTIFY9启动子含有大量的光响应相关元件,此外还含有许多防御及应激、SA和ABA响应元件.qRT-PCR结果显示MaTIFY9在根中表达量最高,其次是假茎和球茎,叶最低;其表达受脱落酸ABA、水杨酸SA和枯萎病显著诱导,受高温抑制.本研究表明,与其他植物TIFy类似,MaTIFY表达受多种激素和逆境调控,可能在香蕉响应非生物和生物逆境胁迫过程中发挥重要作用.

[目的]研究香蕉水通道蛋白(AQP)基因家族密码子使用特点,为其基因编码规律及功能和分子进化研究提供依据.[方法]采用CodonW、SPSS、Origin等软件分析香蕉AQP基因家族密码子偏好性.[结果]从香蕉基因组中鉴定获得54条香蕉AQP基因,其中包括9条NIPs、21条PIPs、4条SIPs和20条TIPs.香蕉AQP基因家族A、T、C、G出现频率平均值分别为12.0％、15.9％、52.3％和37.4％,平均GC3s含量为75.8％,ENc值在31.0～60.7,平均值为42.9;SIPs、NIPs、PIPs和TIPs分别有2、5、7和6个最优密码子,且多以C结尾,少数以G结尾;ENc和CAI呈极显著负相关,说明密码子第3位碱基会影响基因表达能力.[结论]香蕉AQP家族基因密码子偏好性较弱,偏好使用G和C且以G/C结尾的密码子,PIPs和TIPs密码子偏好性受自然选择的影响较大,而NIPs和SIPs受碱基突变的影响较大.