It is difficult to distinguish the sexes of Trachinotus ovatus based on appearance, and little data about sex-determining genes are available for this species. Here, we generated 200 F2 individuals using the parents R404 and R403. DNA samples were collected from 50 individuals of each sex and aggregated into sex-specific DNA pools. Specific-locus amplified fragment sequencing was integrated with bulked segregant analysis to detect candidate sex-associated genes. Approximately 3,153,153 high-quality single-nucleotide polymorphism (SNP) markers and 135,363 high-quality insertion-deletion (Indel) markers were generated. Six candidate regions within chromosome 14, encompassing 132 candidate genes, were identified as closely related to sex. Based on annotations, six genes (EVM0019817, EVM0004192, EVM0001445, EVM0005260, EVM0014734, and EVM0009626) were predicted to be closely associated with sex. These results present an efficient genetic mapping approach that lays a foundation for molecular sex discrimination in T. ovatus.
[目的]鉴定筛选出与卵形鲳鲹卵巢发育相关的候选基因及信号通路,为揭示其卵巢性成熟过程的分子机制打下基础.[方法]挑选卵巢发育处于?期和Ш期的雌性卵形鲳鲹,分别构建卵形鲳鲹卵巢?期和Ш期的cDNA文库,采用Illumina HiSeqTM 2500进行转录组测序,经过滤、质量控制及拼接组装后获得的Unigenes在七大数据库(Nr、Nt、Pfam、KOG/COG、Swiss-Prot、KEGG和GO)中进行比对;通过FPKM及DEGseq筛选出差异表达基因,以GOseq和KOBAS对差异表达基因分别进行功能注释及信号通路富集分析,并采用MISA和GATK3进行SSR鉴定及SNP分析.[结果]卵形鲳鲹卵巢组织转录组测序获得的325156432条Raw reads,经过滤筛选得到317206752条Clean reads,拼接组装后得到59554条Unigenes;69.65%的Unigenes在Nr、Nt、Pfam、KOG/COG、Swiss-Prot、KEGG和GO等七大数据库中注释成功,其中有24599条Unigenes被注释到GO数据库,15997条Unigenes被注释到KEGG数据库.在卵形鲳鲹卵巢组织的2个发育时期共鉴定获得56115个基因,经差异表达分析后获得17737个差异基因,其中8169个基因在卵巢Ш期上调表达、9568个基因在卵巢Ш期下调表达.GO功能注释分析发现,卵形鲳鲹卵巢差异表达基因主要注释在细胞过程、氮化合物代谢过程、初级代谢过程、核、核部分、离子结合及水解酶活性等条目上;而KEGG信号通路富集分析结果显示,17737个差异表达基因显著富集在318条代谢途径上,其中前20条KEGG信号通路包括2-氧代羧酸代谢、PI3K-Akt信号通路、甲状腺激素信号通路、磷脂酶D信号通路、FcεRI信号通路和细胞周期等.卵形鲳鲹卵巢转录组(59554条Unigenes)中共存在30133个SSRs和82490个SNPs.[结论]GnRHR、FSHR、FSHβ、CYP11A、SIRT3和PEG3等差异表达基因及PI3K-Akt信号通路和VEGF信号通路等与卵形鲳鲹卵巢的发育密切相关,共同调节卵巢的发育与成熟,在卵巢性成熟过程中发挥重要作用.
[目的]明确巴马拟缨鱼暴发性死亡的原因,为该病的临床诊断和科学防治提供参考依据,进而为巴马拟缨鱼健康养殖提供保障.[方法]从病源地采集患病巴马拟缨鱼样本,采用常规的细菌分离纯化方法从心脏、肝脏和脾脏等组织病料中分离优势菌株,经形态特征观察、API 20NE生理生化鉴定及16S rRNA序列和gyrB基因PCR扩增分析后,进行人工感染试验及毒力基因检测以确定其致病力,最后采用K-B药敏纸片扩散法检测其药敏性.[结果]从患病巴马拟缨鱼的心脏、肝脏和脾脏等组织中分离获得1株优势菌株(命名为BM178),综合其形态特征、API 20NE生理生化鉴定谱及分子生物学鉴定结果,可确定为嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila).经腹腔注射感染BM178菌株后,巴马拟缨鱼的胸鳍、腹鳍和臀鳍基部不同程度出血,肛门红肿,剖检可观察到内脏团有点状出血、肝脏充血、脾脏肿大和肠道充血等症状,与自然发病巴马拟缨鱼的症状基本一致;BM178菌株对健康巴马拟缨鱼的半数致死剂量(LD50)为1.26×102 CFU/g.在BM178菌株中6种常见毒力基因(hly、aer、act、alt、ahp和ahal)的检出率为100.0%,即毒力基因型为hly+aer+act+alt+ahp+ahal+.药敏试验结果显示,BM178菌株对头孢曲松、头孢哌酮、庆大霉素、多西环素、诺氟沙星、复方磺胺甲噁唑和氟苯尼考等7种抗菌药物高度敏感,而对青霉素G已产生较强的耐药性.[结论]嗜水气单胞菌是引起巴马拟缨鱼暴发性死亡的主要病原菌,具有较强的致病性,实际生产中可选用多西环素、复方磺胺甲噁唑或氟苯尼考进行防治.
利用地膜塘进行卵形鲳鲹大规格鱼苗培育的试验,从育苗环境与设备、鱼苗放养、饲料投喂、日常管理、病害防治及育苗关键点等几方面进行了详细分析,放养平均体重1.2g,平均体长2.5cm的鱼苗,经过45d左右的精心培育,大规格鱼苗可以达到平均体长9.8cm,平均体重24.6g.
2019年9月12日,广西北海市铁山港出现深水网箱养殖卵形鲳鲹大量发病,经检查,是小瓜虫暴发.海水小瓜虫学名刺激隐核虫,在海水鱼养殖生产中,每年均有养殖鱼类感染,给渔业生产带来重大损失.经过了多种治疗手段的尝试,目前没有特别有效的治疗手段.一般在连续低气压、海水溶氧不足、水体有机质含量上升的环境条件下鱼体更容易感染小瓜虫病.小瓜虫一般附着在养殖鱼体的鳃(图1)和皮肤上,大量增值后会形成小白点(俗称“白点虫病”),导致摄食量减少甚至不摄食、鱼鳃和皮肤黏液增多、形体消瘦等症状,体色呈现应激色(灰黑色).小瓜虫会给鱼体造成创伤,从而引起烂身、出血、细菌感染等并发症,导致死亡率居高不下.
以人工养殖的多鳞鱚作为亲鱼进行鱼苗人工繁殖,从培育池的选择,鱼苗孵化、饵料投喂以及日常管理等几个方面对多鳞鱚鱼苗培育的注意事项进行了详细分析.
本实验采用油脂、裂壶藻粉、小球藻对褶皱臂尾轮虫进行营养强化,强化20 h后,轮虫的密度小球藻强化组效果最好,强化初始密度均为300 Ind/mL,小球藻、裂壶藻粉、油脂强化组的轮虫密度分别为701 Ind/mL、596 Ind/mL、500 Ind/mL;轮虫的怀卵率亦是小球藻强化组效果最好,小球藻、裂壶藻粉、油脂各强化组的轮虫怀卵率分别为65.5%、43.6%、30.1%.三种不同的强化剂对轮虫强化后,测量其脂肪酸的组成,结果表明,油脂强化组轮虫体内的EPA、DHA及其所占脂肪酸比重都较高,小球藻次之,裂壶藻粉最差.