大约2％的人类基因组被转录为RNA编码蛋白,被转录为非编码RNA的基因组为大多数(ncRNAs)[1]. 因为一直以来人们发现非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)没有编码的能力,所以认为它对转录来说是无意义的[2].

细胞焦亡是一种半胱氨酸蛋白酶(caspase)依赖性的炎症性程序性细胞死亡形式,其特征主要表现为细胞肿胀、细胞膜穿孔、细胞内容物及炎性因子的释放.焦亡包括典型和非典型通路,典型通路在病原体相关分子模式或损伤相关分子模式作用下识别并激活caspase 1,非典型通路由细胞内脂多糖识别并激活caspase 4/5/11,进而切割焦孔素D(GSDMD)产生N末端和C末端.GSDMD-N端介导质膜穿孔,促进炎性因子如白细胞介素-1β、白细胞介素-18等的释放,诱导细胞焦亡.GSDMD是焦孔素(GSDM)家族的主要成员之一,研究表明细胞焦亡相关分子如GSDMD等的异常表达与肿瘤的发生、发展及患者的预后具有显著相关性.子宫内膜癌(EC)是妇科常见的恶性肿瘤之一,GSDMD高表达可能影响EC的发生、发展及患者的预后.近年来,GSDMD介导的细胞焦亡在肿瘤中的研究不断深入,为EC的研究提供了理论基础.故本文就GSDMD在EC中的研究进展进行综述.

目的:基于生物信息学方法构建多囊卵巢综合征(PCOS)表达的miRNA及miRNA靶基因的调控网络.方法:从GEO数据库的GPL16543 平台下载miRNA基因芯片数据集GSE72274,用GEO2R筛选差异表达的miRNA,应用在线数据库miRWalk分析预测miRNA差异表达的靶基因.对靶基因进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析.应用Cy-toscape软件绘制miRNA及其相关靶基因调控图.通过STRING网站对靶基因进行PPI网络构建,并使用CytoHubba插件进行Hub基因分析.结果:共筛选出差异miRNA一共38 个,其中32 个上调,6 个下调.预测差异miRNA的靶基因得到 393个,GO分析发现差异的靶基因主要参与RNA聚合酶Ⅱ启动子对转录的调节、RNA聚合酶Ⅱ启动子对转录的正调节、蛋白结合、金属离子结合、D等生物学过程.KEEG分析表明其主要参与TGF-β信号通路和Hedgehog信号通路.成功构建miR-NA相关靶基因调控网络,调控网络中的 miRNA包括:hsa-miR-135b-5p、hsa-miR-199a-3p、hsa-miR-32-5p.通过 CytoHubba插件得到10 个关键基因分别为ESR1、SMAD2、SP1、KIT、ETS1、MEF2C、DICER1、FMR1、RPS6KB1、NCOR2.结论:基于生物信息学已构PCOS miRNA和其靶基因调控网,了解PCOS相关的miRNA及其靶基因,有助于明确PCOS的发生发展机制,为临床提供新的诊治思路.

由成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)及其相关蛋白9(CRISPR associated nuclease,Cas9)介导的基因编辑技术已被广泛用于探究癌症相关基因的功能、建立癌症动物模型和探测物药靶点,是一种高效、快速和位点特异性的工具.近年来,卵巢癌发病率逐年增加,严重威胁女性健康.目前多采用手术、放疗、化疗或联合治疗等方法延缓疾病的进展,但效果不佳,是临床迫切需要解决的一大问题.因此,利用CRISPR/Cas9技术靶向致病基因、筛选相关功能基因及寻找新的药物靶点为卵巢癌的治疗带来了希望.本研究对既往CRISPR/Cas9技术在卵巢癌转移中的研究应用进行综述,希望对该领域未来的研究奠定理论基础,也为肿瘤特别是卵巢癌的治疗提供新的参考.

目的 通过生物信息学方法,分析E2F转录因子在子宫内膜癌中的表达及意义.结合表达差异基因和富集通路,预测子宫内膜癌的潜在生物标志物.方法 使用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)、共表达网络,分析E2F在子宫内膜癌中的表达.筛选癌组织和癌旁组织差异表达的E2F基因,对差异基因进行生物过程(GO)分析和KEGG富集分析.单因素Cox分析筛选预后相关的E2F基因.结果 本研究筛选了6个差异基因及2个预后基因,差异基因主要参与细胞周期调节、癌症相关信号通路.有助于理解E2F在子宫内膜癌中的发病机制及作用,为寻找子宫内膜癌的治疗靶点提供思路.结论 E2F与子宫内膜癌发生、发展密切相关.E2F1/E2F2/E2F3/E2F5/E2F7/E2F8是子宫内膜癌诊断的候选分子标志物.E2F1/E2F3是子宫内膜癌潜在的预后生物标志物.