试验以东农46和L-100杂交构建的包含127个家系F2:10、F2:11、F2:12代重组自交系群体为试验材料,结合三年五点以及4个浸种时间段,调查大豆硬实率和种子吸水量两个表型性状,采用QTL IciMapping 4.1完备区间作图法,作QTL定位和加性效应分析.结果共检测到26个与大豆硬实性相关QTLs,分布于10条染色体,贡献率5.29%~47.31%,有8个位点在两个性状QTL定位中发生标记区间重叠,分别为qHS-2-1和qWAS-2-1、qHS-2-2和qWAS-2-2、qHS-4-2和qWAS-4-1、qHS-13-1和qWAS-13-3,其中,qHS-2-2和qWAS-2-2贡献率平均值最大,>25%.共检测到51对加性×加性上位互作QTL,贡献率为1.01%~8.40%.
研究以150份大豆种质为试验材料开展2年3点试验,在收获期测定抗倒伏相关性状,并利用RTM-GWAS方法作关联分析,共检测到99个显著关联SNP位点,其中48个效应显著位点,解释0.28%~3.38%表型变异;89个与环境互作显著位点,解释0.53%~7.04%表型变异;其中,21个位点主效表型变异解释率高于1%;与6个倒伏相关性状显著关联SNP位点中,与茎粗显著关联SNP位点最多,与抗倒指数显著关联SNP位点最少;获得22个有功能注释基因,根据基因表达量和基因功能注释,推测3个基因(Glyma.18G149700、Glyma.04G244100、Glyma.18G011400)可作为与大豆抗倒伏相关候选基因.
文章选用母本东农46和父本L-100构建重组自交群体127个家系为试验材料,利用全基因组重测序技术构建高密度遗传连锁图谱,结合群体豆荚长、宽、厚性状R3~R8时期表型数据,利用QTL IciMapping4.1.0.0软件完备区间作图法分析非条件和条件QTL加性和上位性效应.结果 表明,在豆荚3个性状发育过程中,共检测到40个非条件加性效应QTL,贡献率为4.35%~25.52%;检测到12个条件加性效应QTL,贡献率为3.80%~23.32%.同时检测到多个QTL位点在不同性状或不同生育时期表达,如QPL-7-1、QPL-12-2和QPL-20-1(QPW-20-1)等.通过上位性分析检测到豆荚长度143对、宽度185对和厚度34对QTL位点,贡献率最高分别迭29.69%、24.73%和25.17%,表明多基因效应在豆荚生长发育过程中发挥重要作用.