Два штамма (В7-4 и B8-2) алкалофильных несерных пурпурных бактерий (НПБ) выделены из умеренно соленых степных содовых озер Забайкалья с рН выше 9.0. Бактерии были подвижны, имели полиморфные клетки (от коротких палочек до длинных веретенообразных клеток) размером 2.0 3.2 ? 9.620.0 мкм. Внутриклеточные мембраны везикулярного типа располагались преимущественно по периферии клеток. Микроорганизмы содержали бактериохлорофилл а и каротиноиды как сфероиденовой, так и спириллоксантиновой серий. Фотосинтетический аппарат был представлен светособирающими комплексами LH2 и LH1. Рост штаммов происходил в присутствии органических соединений в аэробных условиях в темноте или в анаэробных условиях на свету. Способность к фото- и хемоавтотрофному росту не выявлена. Ген cbbl, участвующий в синтезе РуБисКО, не обнаружен. Оптимальный рост обоих штаммов происходил при концентрации NaCl 2% (диапазон роста 0.54%), рН 8.08.8 (диапазон 7.59.7) и температуре 2535°С. Содержание Г + Ц в ДНК новых штаммов было 67.669.8 мол. %. Парное сравнение последовательностей нуклеотидов гена 16S рРНК штаммов В7-4 и B8-2 выявило, что они принадлежали к одному виду (99.9% сходства) и были наиболее близки к алкалофильной аэробной бактериохлорофилл а содержащей аноксигенной фототрофной бактерии (АФБ) Roseibacula alcaliphilum De (95.2%), а также к штаммам НПБ Rhodobaca barguzinensis VKM B-2406T (94.2%) и Rbc. bogoriensis LBB1T (93.9%). Близкий уровень сходства новых штаммов установлен также с видом НПБ Rhodobacter veldkampii DSM 11550Т (94.8%) и аэробными бактериохлорофилл а содержащими бактериями Roseinatronobacter monicus ROS 35Т и Roseicitreum antarcticum ZS2-28Т (93.5 и 93.9% соответственно). Новые штаммы описаны как новый род и новый вид НПБ Rhodobaculum claviforme gen. nov., sp. nov. с типовым штаммом В7-4T (ВКМ В-2708, LMG 28126) семейства Rhodobacteriaceae.
В 1979 г. был описан род галофильных пурпурных серобактерий (ПСБ) Lamprobacter с единственным видом Lpb. modestohalophilus. Для палочковидных бактерий рода Lamprobacter характерно присутствие в клетках газовых вакуолей в неподвижной стадии роста культуры, а также изредка возникающие подвижные клетки, лишенные газовых везикул. Бактерии содержали бактериохлорофилл а и каротиноид окенон. Названия этого рода и вида в 1988 г. включены в список одобренных названий микроорганизмов. Типовой штамм Lpb. modestohalophilus RO1T был утрачен, и, как следствие, данных анализа нуклеотидных последовательностей гена 16S рРНК этого вида не было получено. В 1998 г. на основании анализа гена 16S рРНК, был создан новый род Halochromatium, объединивший подвижные экстремально галофильные виды Chromatium-подобных бактерий. Представители этого рода не содержат в клетках газовые вакуоли. Несмотря на фенотипические отличия родов ПСБ Lamprobacter и Halochromatium филогенетические границы для этих таксонов не были определены. Таксономическая ситуация осложнилась после того как морская бактерия, по морфофизиологическим признакам принадлежащая к роду Lamprobacter, была описана как новый вид рода Halochromatium с видовым названием Hch. roseum. В нашей работе приводятся аргументы в пользу сохранения двух фенотипически и филогенетически различных родов Lamprobacter и Halochromatium. Предлагается считать Lpb. modestohalophilus типовым видом рода Lamprobacter. На современном уровне исследованы свойства двух штаммов Lamprobacter modestohalophilus, один из которых (штамм Sivash) предложен в качестве неотипового штамма данного вида. Предлагается также сохранить род Halochromatium, оставив в нем экстремально-галофильные виды Hch. salexigens и Hch. glycolicum, в то время как слабо галофильный Halochromatium roseum предложено перенести в род Lamprobacter, создав новую комбинацию Lamprobacter roseus comb. nov.
Два штамма (В7-4 и B8-2) алкалофильных несерных пурпурных бактерий (НПБ) выделены из умеренно соленых степных содовых озер Забайкалья с рН выше 9.0. Бактерии были подвижны, имели полиморфные клетки (от коротких палочек до длинных веретенообразных клеток) размером 2.0 3.2 ? 9.620.0 мкм. Внутриклеточные мембраны везикулярного типа располагались преимущественно по периферии клеток. Микроорганизмы содержали бактериохлорофилл а и каротиноиды как сфероиденовой, так и спириллоксантиновой серий. Фотосинтетический аппарат был представлен светособирающими комплексами LH2 и LH1. Рост штаммов происходил в присутствии органических соединений в аэробных условиях в темноте или в анаэробных условиях на свету. Способность к фото- и хемоавтотрофному росту не выявлена. Ген cbbl, участвующий в синтезе РуБисКО, не обнаружен. Оптимальный рост обоих штаммов происходил при концентрации NaCl 2% (диапазон роста 0.54%), рН 8.08.8 (диапазон 7.59.7) и температуре 2535°С. Содержание Г + Ц в ДНК новых штаммов было 67.669.8 мол. %. Парное сравнение последовательностей нуклеотидов гена 16S рРНК штаммов В7-4 и B8-2 выявило, что они принадлежали к одному виду (99.9% сходства) и были наиболее близки к алкалофильной аэробной бактериохлорофилл а содержащей аноксигенной фототрофной бактерии (АФБ) Roseibacula alcaliphilum De (95.2%), а также к штаммам НПБ Rhodobaca barguzinensis VKM B-2406T (94.2%) и Rbc. bogoriensis LBB1T (93.9%). Близкий уровень сходства новых штаммов установлен также с видом НПБ Rhodobacter veldkampii DSM 11550Т (94.8%) и аэробными бактериохлорофилл а содержащими бактериями Roseinatronobacter monicus ROS 35Т и Roseicitreum antarcticum ZS2-28Т (93.5 и 93.9% соответственно). Новые штаммы описаны как новый род и новый вид НПБ Rhodobaculum claviforme gen. nov., sp. nov. с типовым штаммом В7-4T (ВКМ В-2708, LMG 28126) семейства Rhodobacteriaceae.
В сентябре 2007 г. исследовали физико-химические характеристики, видовой состав и вертикальное распределение микроорганизмов в воде, в прибрежном микробном мате и в прибрежных грязевых вулканчиках стратифицированного содового озера Доронинское. Озеро находится в Забайкальском крае в зоне многолетней мерзлоты (N 51°25; E 112°28). Максимальная глубина современного озера около 6 м, рН воды 9.72, минерализация воды у дна 32.3 г/л. В летний период верхняя кислородсодержащая зона водной толщи распреснена до 26.5 г/л и простирается до 3.54.0 м, после чего резко переходит в анаэробную зону, содержащую гидросульфид (до 12.56 г/л). В следовых количествах гидросульфид обнаружен также в верхних водных горизонтах. Плотностное расслоение водной толщи обычно обеспечивает стабильность анаэробных условий вплоть до периода ледостава (ноябрь декабрь). Первичная продукция оксигенных фототрофов достигала 176230 мкг/л. Зарегистрирован высокий уровень темновой фиксации углекислоты (61240 мкг/л) в зоне хемоклина. В этой зоне обнаружен алкалофильный вид сероокисляющих бактерий Thioalkalivibrio sp. в количестве свыше 104 кл/мл. Из аэробной зоны (03 м) выделены в культуру литогетеротрофные Halomonas spp., а также аэробные бактериохлорофилл-а-содержащие бактерии (АБХ) Roseinatronobacter sp., способные к окислению тиосульфата. Прозрачность водоема в сентябре была крайне низка, поэтому на границе сероводородного слоя не было отмечено заметного скопления аноксигенных фототрофных бактерий (АФБ). Однако из проб глубинного ила удалось выделить пурпурные серобактерии, идентифицированные по данным анализа нуклеотидов гена 16S рРНК, как Thioalkalicoccus limnaeus, Ectothiorhodospira variabilis, “Ect. magna” и Ect. shaposhnikovii. В прибрежном альгобактериальном мате основными видами АФБ были Ect. variabilis и Ect. shaposhnikovii. Из проб грязевых вулканчиков изолированы галотолерантные Ect. shaposhnikovii, несерные пурпурные бактерии рода Rhodobacter и АБХ Roseococcus sp. Все перечисленные виды являются алкалофилами, умеренными галофилами или галотолерантами.
A new purple sulfur bacterium (strain M9) was isolated from the steppe soda Lake Dzun Uldziin Nur (pH 9.4; mineralization, 3.3%) situated in southeastern Mongolia. Individual cells appear as vibrios 0.3-0.5 x 0.7-1 micron in size. The dividing cells often do not separate from each other, forming an almost closed ring. The internal photosynthetic membranes are represented by concentric lamellae lining the cell wall. Photosynthetic pigments are bacteriochlorophyll a and carotenoids of the spirilloxanthin series. The main carotenoid (> 96%) is spirilloxanthin. Two typical light-harvesting complexes (LH1 and LH2) are present in the membranes in a 1:1 ratio. The bacterium is an anaerobe and facultative photoorganoheterotroph. Photolithoautotrophic growth on sulfide is scarce. Thiosulfate is utilized as an electron donor only in the presence of organic matter. Globules of elemental sulfur are formed as an intermediary product of sulfide and thiosulfate oxidation and are deposited outside the cells. The end product of oxidation is sulfate. In the presence of sulfide and carbonates, acetate, lactate, malate, pyruvate, propionate, succinate, and fumarate are used as the additional sources of carbon in anoxygenic photosynthesis. Vitamin are not required. The bacterium is an alkaliphile the pH optimum is at 8.3-9.1, the pH range is 7.6-10.1. The optimum NaCl concentration in the medium is 1 to 7%; the range is 0.5 to 0.9%. The optimum carbonate content in the medium is 2%; the range is 1 to 10%. The best growth occurs at 30-35 degrees C. The DNA G + C content is 57.5 mol%. According to the results of analysis of the 16S rRNA gene sequences, the new isolate M9 belongs to the phylogenetic cluster containing representatives of the family Ectothiorhodospiraceae within the class "Gammaproteobacteria." In this class, the new isolate forms a new branch, which occupies an intermediate position between the representatives of the genera Ectothiorhodospira and Thiorhodospira. Based on the phenotypic and genetic characteristics, the new purple sulfurbacterium was assigned to a new species of a new genus of the family Ectothiorhodospiraceae, Ectothiorhodosinus mongolicum gen. nov., sp. nov.