Актуальность. Нарушения системы гемостаза занимают одно из ведущих мест в структуре причин бесплодия, невынашивания беременности, ассоциированы с репродуктивными потерями и являются значимым звеном в патогенезе плацента-ассоциированных осложнений беременности. Потребление тромбоцитов и факторов свертывания крови могут быть следствием генетической тромбофилии и причиной развития неблагоприятных клинических исходов беременности. Женщины с врожденной и приобретенной тромбофилией составляют группу высокого риска по развитию как тромботических, так и гестационных осложнений беременности. Цель — оценить частоту встречаемости генетических маркеров тромбофилии у беременных с тромбоцитопенией, определить риск развития акушерских осложнений в зависимости от характера полиморфизмов генов тромбофилии у обследованных женщин. Материалы и методы исследования. Проведено многоцентровое проспективное исследование с включением 299 женщин в III триместре беременности. Выделено две группы. Основную группу ( n = 249) составили пациентки с тромбоцитопенией, контрольную группу ( n = 50) — женщины с нормальными показателями тромбоцитов при физиологически протекающей беременности. Всем женщинам проведено полное клинико-анамнестическое и лабораторное обследование. Молекулярно-генетическое исследование крови с целью выявления полиморфизмов генов тромбофилии осуществляли с помощью биочипа, разработанного лабораторией пренатальной диагностики врожденных и наследственных болезней ФГБНУ «НИИ АГиР им. Д.О. Отта» совместно с ФГБУН «Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта» РАН. Результаты исследования. Данные сравнительного анализа генетических маркеров тромбофилии свидетельствуют о том, что частота встречаемости мутации генов тромбоцитарных рецепторов GPIa у беременных с тромбоцитопенией статистически значимо превышала таковую у беременных с нормальным уровнем тромбоцитов и физиологически протекающей беременностью (42,5 и 14,7 %; р = 0,003). Частота встречаемости полиморфизмов генов, отвечающих за нарушения в системе фибринолиза ( PAI-1, FGB ), также значимо превышала значения в контрольной группе (76,4 % и 47,0; 45,7 и 23,5 % соответственно; p = 0,001 и р = 0,030). Заключение. Высокая частота встречаемости полиморфизмов генов тромбоцитарных рецепторов и генов, отвечающих за нарушения в системе фибринолиза у беременных с тромбоцитопенией, может служить причиной гиперагрегации тромбоцитов, гиперкоагуляции и выступать значимым фактором риска развития плацента-ассоциированных осложнений при беременности. Многообразие вариантов генетических дефектов, способных привести к неблагоприятному клиническому исходу беременности, определяет необходимость их дальнейшего исследования.
Актуальность. Наружный генитальный эндометриоз является одной из самых актуальных проблем гинекологии. Уточнение особенностей экспрессии генов ESR1 , PGR и CYP19A1 при НГЭ даст возможность расширить представление о патогенезе заболевания и причинах резистентности к его терапевтическому лечению. Цель — провести сравнительный анализ экспрессии мРНК генов рецептора прогестерона PGR , рецептора эстрогена ESR1 и гена ароматазы CYP19A1 в парных образцах эутопического эндометрия и перитонеальных эндометриоидных гетеротопий, располагающихся на брюшине, в рамках поиска предиктивных маркеров ответа на гормональную терапию, что в перспективе может позволить персонализировать подбор гормономодулирующей терапии наружного генитального эндометриоза. Материал и методы исследования. С использованием метода ПЦР в реальном времени с обратной транскрипцией был оценен уровень экспрессии генов CYP19A1 , PGR и ESR1 в образцах исследуемых тканей от 22 пациенток с наружным генитальным эндометриозом и у 9 женщин группы сравнения. Результаты исследования. С помощью количественного анализа была установлена высокая гетерогенность в уровне экспрессии исследованных генов как в эндометрии, так и в гетеротопиях больных наружным генитальным эндометриозом. В эндометрии пациенток группы сравнения гетерогенность уровня экспрессии наблюдалась только для гена ESR1. Заключение. Полученные данные свидетельствуют о высокой вариабельности уровня экспрессии генов CYP19A1 , ESR1 и PGR в эндометрии и перитонеальных эндометриоидных гетеротопиях у пациенток с наружным генитальным эндометриозом. В связи с этим необходим индивидуальный подход к назначению терапии, поскольку очевидно, что эффект от лечения будет зависеть в первую очередь от наличия терапевтической мишени у конкретной пациентки. Отсутствие типичной картины экспрессии для каждого из генов у пациенток с наружным генитальным эндометриозом подтверждает гетерогенность данного заболевания и определяет необходимость разработки молекулярной классификации этой распространенной патологии.
The paper gives an example of «dyagnostic Odyssee» of the patient with rare hereditary condition, Neu-Laxova syndrome. This case report emphasizes the role of Next Generation Sequencing in establishing the difficult diagnosis; also it demonstrates modern approaches to prenatal DNA analysis and obstetric care in pregnancy.
В обзоре суммированы данные исследований 5-гидроксиметилцитозина, 5-формилцитозина и 5-карбоксилцитозина - модификаций цитозина, образующихся в результате последовательного ферментативного окисления 5-метилцитозина в ДНК. Рассмотрены механизмы биохимических превращений модифицированных форм цитозина и приведены способы анализа их качественного и количественного содержания в ДНК. Выделены основные этапы в развитии представлений о биологическом значении 5-гидроксиметилцитозина, 5-формилцитозина, 5-карбоксилцитозина в геноме млекопитающих с момента идентификации путей их образования в 2009 г. до настоящего времени.
Цель исследования : определить характер генетических изменений, вызывающих изолированную соматотропную недостаточность у пациентов с врожденным гипопитуитаризмом. Материалы и методы : Методом секвенирования нового поколения (NGS) с помощью технологии «Амплисек» проведено исследование кодирующих регионов генов GH1, GHRH, GHRHR, BTK, GHSR, PROP1, POU1F1, HESX1, LHX3, LHX4, SOX3, SOX2, OTX2, GLI2, ARNT2, ARPC5L, DLK1, DRD2, PAX6, RNPC3, SHH, SPCS2, SPCS3, ассоциированных с гипопитуитаризмом проведено генетическое обследование с целью верификации генеза врожденного гипопитуитаризма двум пациентам . Две сестры (двойня) наблюдаются эндокринологом с 10 лет по поводу изолированной соматотропной недостаточности. На момент постановки диагноза дефицит роста составлял -2,6 SDS и -2,4 SDS. Недостаточность гормона роста подтверждена проведением диагностических стимуляционных тестов. Максимальные пиковые значения концентрации гормона роста при проведении проб - 6,94 нг/мл у первой сестры и 6,84 нг/мл у второй. У обеих пациенток при проведении магнитно-резонансной томографии патологических изменений в гипоталамо-гипофизарной области выявлено не было. Обе сестры получали лечение гормоном роста в дозе 0,033 мг/кг/сут. Наблюдался выраженный ростовой эффект у обеих больных. В первый год терапии гормоном роста прибавка составила 10 см и 9 см соответственно. Общая прибавка в росте - 30 см за 4 года у каждой из сестер. В процессе динамического наблюдения отмечались симптомы, связанные с возможным развитием анорексии: низкий аппетит, избирательное пищевое поведение, в связи с чем ставился вопрос о продолжения лечения гормоном роста. В настоящий момент обе сестры получают гормон роста в метаболической дозе в связи с достижением костного возраста 14 лет (определен по атласу Грейлиха). Результаты : у обеих сестер выявлена функционально значимая замена c.837С>А в гене GHSR в гетерозиготном состоянии, являющаяся молекулярно-генетическим маркером, ассоциированным с изолированной недостаточностью гормона роста (OMIM:615925). Рецептор грелина, или гормон роста секретагог рецептор 1а,- это рецептор для анаболического гормона грелина. Грелин участвует в секреции гормона роста, регуляции аппетита, накоплении жировой ткани. Также он оказывает влияние на пищевое поведение, настроение. Грелин, взаимодействуя со своими рецепторами на соматотрофах гипофиза и гормон роста рилизинг-гормон положительных клетках гипоталамуса, способствует секреции гормона роста. Выводы : Выявление мутации в гене GHSR у пациентов позволяет прогнозировать дальнейшее развитие заболевания без присоединения недостаточности других гормонов гипофиза. Наличие данной мутации объясняет пищевое поведение при некоторых вариантах врожденного гипопитуитаризма.
Modern molecular approaches to prenatal diagnostic of inherited diseases are briefly reviewed. Advantages and limitations of molecular methods for analysis of chromosomal anomalies (QF-PCR, aCGH, NGS) are considered in line with conventional prenatal karyotyping. The special attention is paid to efficacy, limitations and diagnostic options of noninvasive prenatal genetic testing (NIPT). Some particular problems of its widespread implication into routine clinical practice are discussed. State of art in preimplantation genetic diagnostics (PGD) and obvious great opportunities of preconceptional genetic testing are highlighted.
Analysis of ABCB4 gene in young women with cholelithiasis and relative story of gallstone disease was performed by NGS sequencing. The discovered “risk alleles” of this gene and their adverse haplotypes testify to ABCB4 participation in the development of cholelithiasis.
Using PCR-RFLP analysis of the frequencies of gene variants, CYP2J2,CYP4A11, and PTGIS, involved in the metabolism of arachidonic acid, were investigated in a group of children with fundamental arterial hypertension and a control group of children in Northwestern Russia. Also, alleles and genotype frequencies of gene variants CDH13, MTHFR, and CDKN2DAS, as well as the locus rs11191548, which were selected earlier due to their association with the development of arterial hypertension by GWAS in Europe and the United States in 2009, were analyzed. No association of any of the investigated markers with the development of arterial hypertension was confirmed.
Analysis of ABCB4 gene in young women with cholelithiasis and relative story of gallstone disease was performed by NGS sequencing. The discovered “risk alleles” of this gene and their adverse haplotypes testify to ABCB4 participation in the development of cholelithiasis.
Введение: Ген HLA-G относится к неклассическим генам системы HLA и экспрессируется тканеспецифично клетками трофобласта, клетками тимуса и стволовыми клетками. Полиморфные изменения гена HLA-G, часть из которых является функционально значимыми, затрагивают как кодирующие, так и некодирующие области гена. Материалы и методы: Используя метод полимеразной цепной реакции мы изучили полиморфизм гена HLA-G (аллели G*0101-G0107, -725C/G, 3741del/ins14.) у 118 человек в возрасте от 20 до 40 лет в Северо-Западном регионе РФ (Санкт-Петербург). Результаты: Разработана система праймеров для мультиплексной аллельспецифической ПЦР, позволяющей определять основные аллели гена HLA-G. Определены особенности распределения аллелей гена HLA-G у жителей Северо-Западного региона РФ. Сравнительный анализ распределения частот аллелей между популяционной выборкой Северо-Западного региона РФ и популяциями других стран показал сходство между популяциями Дании, Германии и Северо-Запада РФ по аллелям G*0101-G0107 и полиморфизму 3741del14/ins14. Проведен кластерный анализ и рассчитаны генетические расстояния между популяциями Испании, Китая, Японии, Дании, Индии, Африканских Шона, Бразилии, Германии, Польши и популяцией Северо-Запада РФ. Заключение: Показано сходство распределения частот аллелей G*0101-G0107 и полиморфизма 3741del/ins14 популяции Северо-Запада РФ и популяцией Дании и Германии.
We used high-density microarrays to investigate polymorphisms in more than 1500 genetic markers, associated with risks for a wide range of multifactorial diseases. We identified a set of 31 genes, whose products are associated with the risk of preeclampsia, based on the functional annotations of the genes in the bioinformatics resources, DAVID and GFINDer. We determined the population frequencies of alleles and genotypes for these 31 genes: ACE, ADIPOQ, ADRB2, ADRB3, AGT, APOE, CRP, CTLA4, CYP1A1, CYP2D6, CYP2E1, EDNRA, ESR1, ESR2, F5, HLA-DQA1, HSPA1A, IL1A, IL1RN, IL6, IL6R, LEP, LEPR, LPL, MTHFR, NOS3, PON1, TAP2, TGFB1, TNFA, and VEGFA. Comparative analysis between the Russian and Central European study groups revealed statistically significant differences in the allelic and genotypic frequencies for six genes: CYP2D6, CTLA4, AGT, NOS3, PON1 and ADRB2. The obtained data points to a similar genetic basis for the risk of vascular diseases, associated with pregnancy, in the Russian and European populations, and these results can be used for further genetic and epidemiological studies.
Current data contributing to the origin and development of endometriosis (E) — sever common disease of reproductive age women are reviewed. Numerous theories and hypothesis as well as basic pathological mechanisms underlying E are briefly outlined. Whole gene-net and particular groups of candidate genes involved in E are presented. The later include genes of detoxification system, sex hormones and their receptors, cytokines gene, oncosuppressors the genes contributing to embryonic development of female reproductive organs and cell proliferation Major molecular genetic data imply epigenetic impact in the origin of disease which results from progressive disregulation of endometrium genome functions provoked by unfavorable combinations of candidate genes of some signaling pathways and defects in their expression due to abnormal methylation pattern. Histone modifications and the faults of miRNA content. In line with systemic genetic concept initial stages of E could be provoked by different genetic, epigenetic and even external factors which outcome is the same pathophysiological and pathomorphological damages clinically classified as E. Two feasible molecular genetic routs of E. are suggested. Both are relying on unscheduled expression of early embryonic genes such as WNT4, HOX10, HOX11, GALT provoking the changes in genetic program of endometriotic cells (metaplasia) and their subsequent progression as the lesions of ectopic endometrium
Aim. To investigate polymorphic variants of TNF-α and NOD2/CARD15 genes in patients with ulcerative colitis (UC) living in Ryazan region and their association with clinical picture of UC and response to treatment. Material and methods. 50 patients were tested, polymorphic variants of TNF-α (-238G/A и-308G/A) and NOD2/CARD15 (Arg702Trp, Gly908Arg, Leu3020insC) genes were analyzed. Results. Frequency of genotypes and alleles of the genes don’t differ significantly in UC patients and population study. An earlier onset ( р =0,01) and more frequent UC exacerbations (in 1,63) is revealed in -308 А allele TNF-α gene carriers. Conclusion. Allele -308А of TNF-α gene is associated with a more severe course of the disease so a more intensive basic treatment and a thorough monitoring of patients’ condition is required.
Метод сравнительной геномной гибридизации на микроматрицах — современный высокоэффективный подход, позволяющий осуществлять полногеномное сканирование хромосомного дисбаласа. В статье описаны возможности метода и приведены примеры диагностики наследственной патологии с его использованием.