It was first shown that DNA damage induction in mitomycin C-treated HeLa cells leads to a change in the selection of 5p and 3p microRNA duplex strands in the formation of the RNA-induced silencing complex (RISC).
Впервые показано, что индукция повреждений ДНК при обработке клеток HeLa митомицином C приводит к изменению селекции нитей 5р и 3р дуплекса микроРНК при формировании комплекса RISC (RNA-induced silencing complex).
С помощью параллельного множественного секвенирования нуклеотидной последовательности проведен сравнительный анализ экспрессии микроРНК в клетках опухолевой и нормальной ткани толстой кишки и выявлено 40 микроРНК, аберрантно экспрессирующихся при развитии рака. Обнаружено увеличение экспрессии для 15 микроРНК и уменьшение экспрессии для 25 микроРНК. Идентифицировано 16 кластеров микроРНК с координированной или неполностью координированной аберрантной экспрессией в клетках опухоли толстой кишки. В двух (miR-183/182, miR-106b/25) и четырех (miR-143/145, miR-497/195, miR-30e/30c-1, miR-30a/30c-2) кластерах наблюдалось статистически значимое координированное увеличение и уменьшение экспрессии соответственно для всех микроРНК, входящих в кластер. Выявлено три аберрантно экспрессирующихся микроРНК (miR-100-5p, miR-30d-5p, miR-204-5p), для которых, однако, ранее не была показана связь с развитием рака толстой кишки. Полученные в работе результаты указывают на возможность использования шести координированно экспрессирующихся кластеров микроРНК в качестве маркеров развития рака толстой кишки.
С помощью метода множественного параллельного секвенирования идентифицированы микроРНК с наследуемыми изменениями уровня экспрессии в клетках HeLa после действия -квантов или митомицина С. Обнаружено снижение экспрессии 22 микроРНК и повышение экспрессии 15 микроРНК. Для трех микроРНК (miR-10b-5p, miR-148a-3p, miR-340-5p) выявлено повышение экспрессии при действии -квантов и уменьшение после действия митомицина С. Спектр аберрантно экспрессирующихся микроРНК при действии -квантов и митомицина С различается, за исключением трех микроРНК (mir-100-5p, miR-99b-5p, miR-501-3p), наследуемая экспрессия которых уменьшается как после -облучения, так и после обработки клеток митоцином С. В случае пяти микроРНК (miR-21-3p, miR-182-5p, miR-19b-3p, miR-30a-3p и miR-30e-3p) с увеличенной наследуемой экспрессией мишенями являются гены-супрессоры опухоли. Для девяти микроРНК (miR-99b-5p, miR-148a-3p, miR-365a-3p, miR-193a-3p, miR-100-5p, miR-99a-5p, miR-29b-3p, miR-340-5p и miR-23b-3p) с пониженной наследуемой экспрессией мишенями являются онкогены. Полученные результаты являются еще одним свидетельством того, что при оценке отдаленных генетических последствий эффектов ионизирующей радиации и химических соединений необходимо учитывать индуцированные эпигенетические изменения, связанные с функционированием микроРНК.