Исследования полиморфизма в генe ESR1 представляют интерес в связи с ассоциацией с хозяйственно-полезными признаками свиней. Целью данной работы явилось исследование влияния полиморфизма гена ESR1 на изменчивость воспроизводительных качеств свиней пород крупная белая и ландрас. Studies of polymorphism in the ESR1 gene are of interest in connection with the association with economically useful traits of pigs. The purpose of this work was to study the effect of ESR1 gene polymorphism on the variability of the reproductive qualities of Large White and Landrace pigs.

Выявление областей генома, прямо или опосредованно связанных с признаками пороков развития у домашних свиней, может способствовать идентификации генетических мишеней, используемых в качестве биомаркеров индивидуальных особенностей формирования экстерьера, их метаболического статуса, а также подверженности генетическим заболеваниям. Такие исследования напрямую связаны с повышением экономической эффективности, поскольку позволяют выявлять и исключать из селекционного процесса животных-носителей нежелательных генов, фенотип которых может не проявляться. В данной работе проведен поиск подобных целевых генов и геномных регионов с помощью полногеномных ассоциативных исследований (GWAS) с использованием ДНК-чипов PorcineSNP60K BeadChips (Illumina, San Diego, USA). Проанализировано 48 хряков свиней крупной белой породы селекционно-гибридного центра «Знаменский» Орловской области по 21 недостатку экстерьера и дефектам развития у 39 153 их потомков. Расчеты производили по линейной модели смешанного типа в программном пакете GEMMA. Из изначального сета в 61 000 SNP были отобраны 36 704 полиморфных SNP, в которых найдены 24 полиморфизма, входящих в 11 генов (P < 0.1), статистически значимо коррелирующих с признаками аномалий развития в геноме свиней, такими как атрезия анального отверстия (ARMC7, FANCC, RND3, ENSSSCG00000017216), проблемы с конечностями (PAWR, NTM, OPCML, ENSSSCG00000040250, ENSSSCG00000017018) и тремор поросят (RIC3, ENSSSCG00000032665). Также была выявлена коэкспрессия генов NTM, OPCML и RND3, участвующих в регуляции клеточной адгезии. Проведенная работа подтвердила актуальность применения подобного подхода в полногеномно-ассоциативных исследованиях для детектирования единичных SNP, связанных с отдельными признаками, даже для небольших выборок.

ПОИСК ГЕНОМНЫХ ОБЛАСТЕЙ, НЕСУЩИХ ЛЕТАЛЬНЫЕ РЕЦЕССИВНЫЕ ВАРИАНТЫ У СВИНЕЙ ПОРОДЫ ДЮРОК * О.В.КОСТЮНИНА 1 , А.С.АБДЕЛЬМАНОВА 1 , Е.У.МАРТЫНОВА 2 , Н.А

АССОЦИАЦИИ ПОЛИМОРФИЗМА WUR10000125 С

В ходе молекулярно-генетических исследований полиморфизма микросателлитных локусов (S0155, SW951, S0386, S0355, SW240, SW857, S0101) в популяциях свиней пород ливенская (LIVold, n = 30 и LIVnew, n = 68), крупная белая (LW, n = 23), ландрас (LAN, n = 40) и беркширкая (BER, n = 29) было выявлено снижение генетического разнообразия в современной популяции ливенской по сравнению с популяцией 2008 года и сокращение генетических различий с промышленными популяциями крупной белой и ландрас. Несмотря на это было установлено, что современная ливенская порода продолжает сохранять высокий уровень генетического разнообразия и уникальность. In the course of molecular genetic studies of polymorphism of microsatellite loci (S0155, SW951, S0386, S0355, SW240, SW857, S0101) in populations of pigs of breeds Livenskaya (LIVold, n = 30 and LIVnew, n = 68), Large White (LW, n = 23), Landrace (LAN, n = 40) and Berkshire (BER, n = 29) revealed a reduced genetic diversity in existing population of Livenskaya compared to the population of 2008 and the reduction of genetic differences with the industrial populations of Large White and Landrace. At the same time, it was found that the existing Livenskaya breed save a high level of genetic diversity and uniqueness.

ИЗУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ АРХИТЕКТУРЫ КОНВЕРСИИ КОРМА У ХРЯКОВ (Sus scrofa) ПОРОДЫ ДЮРОК НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО АНАЛИЗА SNP А.А

Скорость генетического прогресса по низконаследуемым признакам воспроизводства у свиней может быть увеличена за счет интеграции в селекционные программы ДНК-маркеров, ассоциированных с локусами количественных признаков (QTL) репродуктивных качеств (маркерная селекция, marker-assisted selection, MAS).В представленной работе впервые получены результаты, указывающие на отсутствие значимого влияния гена IGF2 на фертильность свиноматок.Сопряженность генов ECR F18/FUT1, ESR и MUC4 с оценками племенной ценности по собственной продуктивности свиноматок оказалась значимой и подтверждала взаимосвязь генетических и физиологических механизмов формирования репродуктивных особенностей свиней.Целью настоящих исследований была оценка влияния ДНК-маркеров IGF2 (инсулиноподобный фактор роста 2), ECR F18/FUT1 (рецептор Escherichia coli F18), ESR (эстрогеновый рецептор) и MUC4 (муцин 4) на признаки фертильности свиноматок пород крупная белая и ландрас.Материалом служили данные первичного учета показателей воспроизводительных качеств по результатам первых трех опоросов свиноматок (Sus scrofa) пород крупная белая (n = 894) и ландрас (n = 513) в ООО «Селекционно-гибридный центр» (Воронежская обл.).Были проанализированы абсолютные значения и скорректированные фенотипические показатели, а также проведена оценка племенной ценности особей (Estimated Breeding Value, EBV) по следующим признакам: число рожденных поросят в гнезде за один опорос (TNB), число живорожденных поросят за один опорос (NBA), средняя масса поросенка в гнезде при рождении (BW), скорректированная масса поросенка в гнезде при рождении (BW adj ), молочность свиноматки (масса гнезда при отъеме на 21-е сут) (WW), скорректированная молочность свиноматки (скорректированная масса гнезда при отъеме на 21-е сут) (WW adj ).Геномную ДНК выделяли из проб ткани (ушной выщип) с использованием набора реагентов ДНК-Экстран-2 (ООО «НПФ Синтол», Россия).Были определены частоты встречаемости генотипов по анализируемым маркерам и выявлены их достоверные отклонения от состояния популяционного равновесия для животных крупной белой породы по гену IGF2 (p < 0,01) и породы ландрас по генам IGF2 (p < 0,01), ECR F18/FUT1 (p < 0,01) и MUC4 (p < 0,001).Значение коэффициента гомозиготности по Робертсону (Ca) было наибольшим для генотипов по генам IGF2 и ECR F18/FUT1, при этом для особей крупной белой породы показатель достигал соответственно 0,76 и 0,65 против 0,60 и 0,72 для породы ландрас.Коэффициенты наследуемости анализируемых признаков для двух пород варьировали в следующих пределах: TNB -0,165-0,179, NBA -0,100-0,155, BW -0,232-0,338, WW -0,010-0,115.На основе разработанных уравнений были определены значения племенной ценности свиней по методу BLUP AM.По маркеру IGF2 установлено достоверное влияние (p < 0,05) на показатели молочности свиноматок породы ландрас (PHE WW , PHE WWadj , EBV WW ), лучшими оказались особи с генотипами AA и AG.Генотип по маркеру ECR F18/FUT1 достоверно влиял (p < 0,05) на фенотип и племенную ценность свиней по числу рожденных поросят и по средней массе поросят при рождении.Свиноматки с генотипом AA характеризовались меньшим числом рождаемых поросят (на 8,0-8,5 %) и более высокой их средней массой при рождении (на 2,0-3,0 %).Выявлено достоверное влияние маркера ESR на TNB и NBA и на значения EBV для признака «средняя масса поросят при рождении» (p < 0,05).По признаку «средняя масса поросенка при рождении» лучшими показателями характеризовались свиноматки обеих пород с генотипом СС.Маркер MUC4 оказался значимыми фактором для признака «средняя масса поросят при рождении» для животных обеих пород (Fкритерий достоверен при p < 0,05).Свиноматки с генотипами СС и CG превосходили особей, гомозиготных по аллелю G. Таким образом, использование подходов маркерной селекции наряду с традиционными методами оценки генетического потенциала свиней позволит существенно повысить эффективность селекции по признакам фертильности.Ключевые слова: