INTRODUCTION:The hollow-fibre infection model (HFIM) is an in vitro model used to study pharmacokinetic/pharmacodynamic (PK/PD) interactions between antibiotics and bacteria. However, its external validity remains poorly assessed. This study aimed to identify PK/PD targets and experimental variables associated with bacterial killing and prevention of resistance emergence during β-lactam treatment in HFIM. METHODS:Systematic review of studies using HFIM and β-lactams, with literature search conducted in 4 databases, following PRISMA guidelines. After a quality assessment (modified ToxRtools scale) of the included studies, univariate and multivariate analyses identified factors associated with the prevention of resistance emergence. CART analysis determined values of PK/PD indices best predicting this outcome. RESULTS:Of the 497 screened studies, 41 were included. A total of 367 experiments were analysed, mainly involving Pseudomonas aeruginosa (51%) and carbapenems (46%). Antibiotic exposure through minimal or steady-state free concentrations (fCmin,ss/MIC) (OR 0.78, 95% CI [0.70-0.85], P < 0.001), the initial inoculum size (OR 1.48, 95% CI [1.08-2.06], P = 0.017) and the use of a combination therapy (OR 0.33, CI [0.17-0.64], P = 0.001) remained significantly associated with resistance emergence in multivariate analysis. For carbapenems in monotherapy, the prevention of resistance emergence was likely with fCmin,ss/MIC > 5.7. CONCLUSIONS:Stringent PK/PD indices thresholds were necessary to prevent resistance emergence in HFIM experiments.

Specific determinants associated with Uropathogenic Escherichia coli (UPEC) causing recurrent cystitis are still poorly characterized. Using strains from a previous clinical study (Vitale study, clinicaltrials.gov, identifier NCT02292160) the aims of this study were (i) to describe genomic and phenotypic traits associated with recurrence using a large collection of recurrent and paired sporadic UPEC isolates and (ii) to explore within-host genomic adaptation associated with recurrence using series of 2 to 5 sequential UPEC isolates. Whole genome comparative analyses between 24 recurrent cystitis isolates (RCIs) and 24 phylogenetically paired sporadic cystitis isolates (SCIs) suggested a lower prevalence of putative mobile genetic elements (MGE) in RCIs, such as plasmids and prophages. The intra-patient evolution of the 24 RCI series over time was characterized by SNP occurrence in genes involved in metabolism or membrane transport and by plasmid loss in 5 out of the 24 RCI series. Genomic evolution occurred early in the course of recurrence, suggesting rapid adaptation to strong selection pressure in the urinary tract. However, RCIs did not exhibit specific virulence factor determinants and could not be distinguished from SCIs by their fitness, biofilm formation, or ability to invade HTB-9 bladder epithelial cells. Taken together, these results suggest a rapid but not convergent adaptation of RCIs that involves both strain- and host-specific characteristics.

BACKGROUND AND OBJECTIVES:Temocillin is a carbapenem-sparing β-lactam antibiotic used to treat infections caused by third-generation cephalosporin-resistant (3GC-R) Enterobacterales, although its use is not universally recommended. The aim of this study was to compare the efficacy of temocillin with that of other parenteral beta-lactams in the treatment of febrile urinary tract infections (UTIs) caused by 3GC-R Enterobacterales. PATIENTS AND METHODS:We conducted a multicentre, retrospective, propensity score-matched cohort study including patients treated between January 2017 and December 2021. Patients who received temocillin were matched 1:1 with patients who received carbapenems, cefepime or piperacillin/tazobactam. The primary outcome was early clinical failure, defined as a composite of persistent symptoms leading to a switch in antibiotics or death within 10 days after treatment completion. RESULTS:A total of 180 patients were included, with a high percentage of complicated UTIs (89%) but a low percentage of severe infections (21%). Early clinical failure occurred in 12% of patients overall, with no significant difference between the temocillin group (9%) and the comparator group (14%) (OR 0.58, 95% CI [0.23-1.48], P = 0.26). The rates of late clinical failure, late microbiological failure and all-cause mortality within 3 months were similar between the groups. CONCLUSION:In this study, compared with other beta-lactams, temocillin was not associated with an increased risk of early clinical failure in the treatment of 3GC-R Enterobacterales UTIs.

Background: Two pathophysiological concepts may explain recurrent UTI: a reinfection by a bacterial strain from the digestive microbiota or a relapse from Escherichia coli persisting within the superficial urothelial cells as intracellular bacterial communities (IBC). Hydroxychloroquine (HCQ)-antibiotic combination is effective against intracellular adherent-invasive E. coli isolated from patients with Crohn's disease. We hypothesized that HCQ may enhanced antibiotic efficacy against E. coli IBC. Methods: UTI89 reference strain and two clinical E. coli strains forming IBCs (VITALE#2157, VITALE#2206) were used in this study. MIC, MBC and time killing curves (4xMIC) were performed for AZYTHROMYCIN (AZT), CIPROFLOXACIN (CIP), DOXYCYCLINE (DC), FOSFMOMYCIN (FF) and HCQ. In vitro activity of antibiotics alone and combined with HCQ was evaluated on intracellular bacterial survival assay using a model of urothelium cells (HTB-9). Results: Time-killing curves showed that CIP has a bactericidal activity at H6 (-4.6 log10 CFU/mL) with regrowth at H24 against 2157, and a bactericidal activity at H6 without regrowth at H24 against 2206 (-3.3 log10 CFU/mL) and UTI89 (-3.4 log10 CFU/mL); DC, AZT and FF demonstrated bacteriostatic activity at H24 regardless of the strain. We observed a significant decrease in the number of intracellular bacteria at H42 with CIP (-1.83 log10 / 106 cells). DC, FF, and AZT exposure did not reduce IBC formation at H42 (P>0.05). IBC formation after HCQ-antibiotic combination exposure was not significantly different (P>0.05) from antibiotic exposure alone, regardless of the antibiotic or strain studied. Conclusions: In conclusion, HCQ exposure does not enhance antibiotics activity against intracellular uropathogenic E. coli. ### Competing Interest Statement The authors have declared no competing interest.

1er examen microbiologique en France entière, l'ECBU est un outil précieux de médecine personnalisée, déterminant pour le diagnostic et l'antibiothérapie ciblée, ceci sous réserve d'être bien prélévé et bien analysé. Le but fut d'engager un état des lieux des pratiques dans un CHU avant un plan d'action sur la base de constats ponctuels insatisfaisants. Constitution d'un groupe multidisciplinaire (infectiologie et bactériologie) et multiprofessionnel (médico-soignant) dont des binômes infirmier-technicien de laboratoire afin d'auditer les pratiques des soignants et des patients. Ciblage de 10 des 40 services : les 3 plus forts consommateurs d'ECBU et 7 reflétant les différentes disciplines et sites du CHU. Parallèlement « audits flash » au sein du laboratoire sur l'exploitabilité des prélèvements et le rendu au clinicien. Synthèse par une approche « SWOT » avant de dégager collégialement des priorités d'action. Dynamique microbio-clinique très bénéfique, en particulier pour les soignants (IDE et technicien) ne connaissant pas bien « l'autre métier » et ses contraintes et ravis de la découverte de l'autre équipe. Audit de 118 infirmiers (IDE), 41 aides-soignants (AS) et 31 patients. Maintes faiblesses ("weakness" : W) : formation institutionnelle à l'ECBU pour seulement 18% des AS (versus 100% pour les IDE) ; 74% des IDE et 50% des AS réalisant parfois des ECBU sans prescription médicale ni délégation formalisée ; 50% des IDE et 90% des AS ignorant le rationnel du 1er jet ; 98% donnant des consignes pour la toilette urogénitale mais sans précision pour le 1er jet à éliminer ; 38% d'ECBU en doublon d'un jour à l'autre faute d'avoir vérifié dans le dossier informatisé avant de prélever et parfois aussi doublement analysés au laboratoire ; 42% des patients ne connaissant pas la raison de l'analyse, et 63% prélevant d'emblée leurs urines, les autres après un 1er jet le plus souvent de très faible volume; au laboratoire 36% d'ECBU rendus ininterprétables (multimicrobisme), d'où des errances diagnostiques (infection ou non) et thérapeutiques (pas d'aide pour adapter l'antibiothérapie) ; absence d'analyse des ECBU au laboratoire à flux tendu, avec stop les dimanches/jours fériés, ralentissant les adaptations même si l'ECBU a été bien prélevé. Des menaces ( "threats" : T) : « habitudes » très ancrées et transmises par les pairs ; 5000 agents à (re)former au total des médecins, IDE et AS, diplômés ou en cursus. Mais aussi des forces ("stenghts" : S) : très bon accueil des auditeurs ; perception très partagée que « l'ECBU est moins simple qu'il n'y parait » ; difficultés en tous services et au laboratoire aidant à une mobilisation collective. Et des opportunités ("opportunities" : O) : appui de l'institution, désormais démarche d'habilitation « officielle » des AS à ce geste. L'avant s'avère préoccupent, le CHU étant à l'ère 1.0 pour l'ECBU ! L'après est en chemin avec déjà la révision du protocole institutionnel et la réalisation de capsules vidéo pour les formations initiales et continues, soignantes et médicales. Reste à cibler des actions pour les usagers. Aucun lien d'intérêt

Introduction 1er examen microbiologique en France entière, l'ECBU est un outil précieux de médecine personnalisée, déterminant pour le diagnostic et l'antibiothérapie ciblée, ceci sous réserve d'être bien prélévé et bien analysé. Le but fut d'engager un état des lieux des pratiques dans un CHU avant un plan d'action sur la base de constats ponctuels insatisfaisants. Matériels et méthodes Constitution d'un groupe multidisciplinaire (infectiologie et bactériologie) et multiprofessionnel (médico-soignant) dont des binômes infirmier-technicien de laboratoire afin d'auditer les pratiques des soignants et des patients. Ciblage de 10 des 40 services : les 3 plus forts consommateurs d'ECBU et 7 reflétant les différentes disciplines et sites du CHU. Parallèlement « audits flash » au sein du laboratoire sur l'exploitabilité des prélèvements et le rendu au clinicien. Synthèse par une approche « SWOT » avant de dégager collégialement des priorités d'action. Résultats Dynamique microbio-clinique très bénéfique, en particulier pour les soignants (IDE et technicien) ne connaissant pas bien « l'autre métier » et ses contraintes et ravis de la découverte de l'autre équipe. Audit de 118 infirmiers (IDE), 41 aides-soignants (AS) et 31 patients. Maintes faiblesses ("weakness" : W) : formation institutionnelle à l'ECBU pour seulement 18% des AS (versus 100% pour les IDE) ; 74% des IDE et 50% des AS réalisant parfois des ECBU sans prescription médicale ni délégation formalisée ; 50% des IDE et 90% des AS ignorant le rationnel du 1er jet ; 98% donnant des consignes pour la toilette urogénitale mais sans précision pour le 1er jet à éliminer ; 38% d'ECBU en doublon d'un jour à l'autre faute d'avoir vérifié dans le dossier informatisé avant de prélever et parfois aussi doublement analysés au laboratoire ; 42% des patients ne connaissant pas la raison de l'analyse, et 63% prélevant d'emblée leurs urines, les autres après un 1er jet le plus souvent de très faible volume; au laboratoire 36% d'ECBU rendus ininterprétables (multimicrobisme), d'où des errances diagnostiques (infection ou non) et thérapeutiques (pas d'aide pour adapter l'antibiothérapie) ; absence d'analyse des ECBU au laboratoire à flux tendu, avec stop les dimanches/jours fériés, ralentissant les adaptations même si l'ECBU a été bien prélevé. Des menaces ( "threats" : T) : « habitudes » très ancrées et transmises par les pairs ; 5000 agents à (re)former au total des médecins, IDE et AS, diplômés ou en cursus. Mais aussi des forces ("stenghts" : S) : très bon accueil des auditeurs ; perception très partagée que « l'ECBU est moins simple qu'il n'y parait » ; difficultés en tous services et au laboratoire aidant à une mobilisation collective. Et des opportunités ("opportunities" : O) : appui de l'institution, désormais démarche d'habilitation « officielle » des AS à ce geste. Conclusion L'avant s'avère préoccupent, le CHU étant à l'ère 1.0 pour l'ECBU ! L'après est en chemin avec déjà la révision du protocole institutionnel et la réalisation de capsules vidéo pour les formations initiales et continues, soignantes et médicales. Reste à cibler des actions pour les usagers.Aucun lien d'intérêt

OBJECTIVES:We aimed to quantify the individual risk of antimicrobial resistance among patients with community-acquired Escherichia coli urinary tract infection (UTI) according to their antibiotic exposure over the previous 18 months. PATIENTS AND METHODS:French patients were prospectively recruited in two centers in 2015-2017. Resistance of isolates to amoxicillin (AMX), amoxicillin-clavulanate (AMC), third-generation cephalosporins (3GC), trimethoprim-sulfamethoxazole (TMP-SMX), fluoroquinolones (FQ) and fosfomycin (FOS) was analysed according to previous intra-class and inter-class antibiotic exposure documented in health insurance files. RESULTS:Previous antibiotic exposure was found in 588 (81.4 %) of the 722 UTI cases analysed (564 patients). Recent exposure (three months before UTI) was associated with stronger intra-class impact on E. coli resistance compared to remote exposure (18 months before UTI) for AMX, AMC, FQ and TMP-SMX, with respective adjusted odds ratios [95 % confidence interval] of 1.63 [1.20-2.21], 1.59 [1.02-2.48], 3.01 [1.90-4.77], and 2.60 [1.75-3.87]. AMX, FQ, and TMP-SMX also showed significant inter-class impact. Resistance to 3GC was not significantly associated with intraclass exposure (adjusted OR: 0.88 [0.41-1.90]). FOS resistance was remarkably low (0.4 %). Duration of the antibiotic-free period required for resistance risk to drop below 10 %, the threshold for empirical use in UTI, was modelled as < 1 month for 3GC, >18 months for AMX and TMP-SMX and uncertain for AMC (5.2 months [2.3 to > 18]) and FQ (17.4 months [7.4 to > 18]). CONCLUSIONS:Resistance of E. coli causing UTI is partially predicted by previous personal antibiotic delivery.

More than half of women will experience cystitis during their lifetime. Among these women, 25% will experience a second episode within the following 6 months.

AbstractSpecific determinants associated with UropathogenicEscherichia coli(UPEC) causing recurrent cystitis are still poorly characterized. The aims of this study were (i) to describe genomic and phenotypic traits associated with recurrence using a large collection of recurrent and paired sporadic UPEC isolates, and (ii) to explore within-host genomic adaptation associated with recurrence using series of 2 to 5 sequential UPEC isolates. Whole genome comparative analyses between 24 recurrent cystitis isolates (RCIs) and 24 phylogenetically paired sporadic cystitis isolates (SCIs) suggested a lower prevalence of putative mobile genetic elements (MGE) in RCIs, such as plasmids and prophages. The intra-patient evolution of the 24 RCI series over time was characterized by SNP occurrence in genes involved in metabolism or membrane transport, and by plasmid loss in 5 out of the 24 RCI series. Genomic evolution occurred early in the course of recurrence, suggesting rapid adaptation to strong selection pressure in the urinary tract.However, RCIs did not exhibit specific virulence factor determinants and could not be distinguished from SCIs by their fitness, biofilm formation, or ability to invade HTB-9 bladder epithelial cells. Taken together, these results suggest a rapid but not convergent adaptation of RCIs that involves both strain- and host-specific characteristics.Author summaryThe recurrence of cystitis is a frequent but poorly understood phenomenon. There are currently many hypotheses trying to explain recurrence, but data on large collections of well-characterized clinical isolates are lacking. In order to identify specific recurrence-associated markers, we conducted a large genomic and phenotypic study involving 48 well-characterized cystitis isolates: 24 recurrent cystitis isolates (RCIs) and 24 pairs of isolates causing sporadic cystitis (SCIs). Moreover, we were able to explore intra-host overtime RCI evolution, by analyzing up to 5 sequential UPEC isolates per RCI series. Our results suggest that RCI rapidly adapt to their host through mobile genetic elements loss and SNP accumulation in genes involved in metabolism and membrane transport. However, no convergent genomic nor phenotypic evolution was observed between isolates collected from distinct patients. Taken together, these results suggest a host-shaped evolution of RCIs, highlighting a need for future studies focused on the host-pathogen relationships.

Les recommandations européennes dans le traitement de l'endocardite infectieuse à Enterococcus faecalis (EIEF) ne prévoient pas d'ajustement posologique en fonction de la clairance de la créatinine (ClCr): AMX 200 mg/kg/j et CRO 2g x 2/j. Néanmoins les β-lactamines peuvent avoir une toxicité neurologique et rénale. Actuellement, Les objectifs de concentrations résiduelles plasmatiques (C0) d'AMX et de CRO ne sont pas définies. L'objectif de l'étude était d'analyser la mortalité et la survenue d'effet indésirable en fonction de la première C0 d'AMX et de CRO chez les patients traités pour une EIEF. Nous avons réalisé une analyse rétrospective de 2016 à 2021 des données de surveillance thérapeutique pharmacologique (STP) des patients traités par AMX+CRO pour une EIEF. Les seuils de toxicité de l'AMX et de CRO ont été définis respectivement à 80 mg/L et 100 mg/L selon les recommandations françaises. Constitution de deux groupes en fonction du premier C0 d'AMX et/ou de CRO: groupe A pas de surdosage, groupe B présence d'un surdosage à l'une des deux molécules. Le critère de jugement principal était la mortalité toutes causes confondues 30 jours de l'arrêt du traitement. Les critères de jugements secondaires étaient l'apparition d'une l'insuffisance rénale aiguë (IRA) durant le traitement selon les éléments de définition du KDIGO, la durée de la bactériémie et la mortalité toutes causes à 3 mois (M-3) et un an (M-12). Au total, 72 patients dont 73% (53/72) de sexe masculin ont été analysés. La moyenne d'âge était de 79 ans (± 6), 71% (51/72) avait un matériel intracardiaque (pacemaker ou valve prothétique). Le diagnostic d'endocardite était certain chez 83% (60/72) des patients. Concernant la posologie initiale de CRO, parmi les 72 patients, 44 avaient reçu 2g x 2/j, 21 1g x 2/j et 7 <1g x2/j. Au total, 194 C0 d'AMX et 147 C0 de CRO ont été recueillis. Selon le premier C0, 30 (42%) patients ont été classés dans le groupe A et 42 (58%) dans le groupe B. Les patients dans le groupe B étaient plus âgés (79,8 vs. 77,1 ans, P<0,05) et présentaient une ClCr au diagnostic plus faible (45,1 vs. 69,1 mL/min, P<0,05). Dans le groupe A, la posologie en CRO de 2g x2/j était administrée chez 56% (17/30) et chez 62% (26/42) dans le groupe B. La mortalité à J-30 n'était pas différente (P=0,39) entre le groupe A (0%, 0/30) et le groupe B (0,23%, 1/42), de même que la mortalité à M-3 (3,3% 1/30 vs. 4,8% 2/42, P= 0,76) et à M-12 (13,3% - 4/30 vs. 24% - 10/42, P=0.26). La survenue d'une IRA était plus fréquente dans le groupe B (55% - 22/42 vs. 17,2% 5/30, P<0,005). La moyenne des C0 en CRO chez les patients ayant développés une IRA au cours du traitement était de 127,6 mg/L (+/- 45,9) contre 92,3 mg/L (+/- 37,3) chez les patients n'ayant pas développé d'IRA (P<0,05). À ce jour, Les recommandations européennes pour la prise en charge de l'endocardite ne prévoient pas d'adaptation posologique au poids (pour la CRO) ou la fonction rénale (AMX et CRO). Néanmoins, le surdosage semble fréquent et associé à une survenue d'évènements indésirables comme l'IRA. Un STP est important et pourrait permettre de mieux définir les objectifs des concentrations résiduelles de ces deux antibiotiques. Aucun lien d'intérêt

Les cathéters intra veineux de longue durée (CIVLD) sont des dispositifs fréquents. Les bactériémies liées aux CIVLD sont une des principales complications. L'objectif principal de cette étude est de mesurer l'efficacité des verrous antibiotiques pour le traitement des bactériémies liées aux CIVLD. Les objectifs secondaires sont d'estimer la mortalité liée à l'infection de CIVLD, la mortalité toute cause et de trouver d'éventuels facteurs pronostics. Il s'agit d'une étude rétrospective incluant l'ensemble des patients traités dans notre centre hospitalo-universitaire pour une bactériémie liée aux CIVLD entre 2014 et 2022. Les critères diagnostics ont été défini selon les dernières recommandations de la Société de Pathologie Infectieuse de Langue Française (SPILF). L'ensemble des patients ont été traité et suivi selon un protocole standardisé locale. La guérison était définie par la stérilité des hémocultures de contrôle associée à l'amendement des signes cliniques et à l'absence de rechute ou du retrait du cathéter à cause d'une infection à 1 mois de la fin du traitement. Les décès non liés au traitement étaient censurés. Un total de 60 épisodes concernant 58 patients ont été inclus dont 51 ont pu être suivi jusqu'à M1. Les CIVLD étaient utilisés pour l'administration de chimiothérapie (44/60 épisodes, 73%, d'alimentation parentérale (6/60, 10%), pour un usage mixte (7/60, 12%) ou pour un autre usage (3/60, 5%). La culture microbiologique mettait en évidence un Staphylocoque à coagulase-négative dans 43% des cas (26/60), une enterobactérie dans 37% des cas (22/60 épisodes), un Pseumononas. aeruginosa dans 8% des cas (5/60), ou une infection polymicrobienne dans 8% des cas (5/60). Le taux d'échec de traitement était de 37% (19/51) parmi les patients ayant complété le suivi. La mortalité toute cause était de 23%(9/51), la mortalité liée à l'infection de CIVLD était de 3%(2/51). Les patients traités pour un cancer solide ou ceux en traitement palliatif avaient un taux d'échec significativement plus élevé (respectivement, p=0,037, p=0,026). Les autres facteurs de fragilité comme la neutropénie ou un score OMS >2 n'étaient pas significativement associés à un plus fort taux d'échec. Par ailleurs, le risque d'échec du verrous ne semblait pas lié à la bactérie. Parmi les patients ayant complété leur traitement, une durée plus courte de verrou antibiotique était significativement associée à un taux de rechute plus élevé (9 vs 14 jours, p=0,033). Le traitement conservateur des bactériémies liées aux CIVLD semble être efficace avec néanmoins un taux d'échec plus élevé que ceux précédemment rapportés dans la littérature. Être traité pour un cancer solide et être traité moins longtemps semble être associé à un taux d'échec plus élevé. Il serait intéressant d'inclure les infections liées aux cathéters d'hémodialyse de même que les patients d'oncohématologie qui sont pris en charge dans un autre centre hospitalier. Aucun lien d'intérêt

Abstract Background Optimal duration of antimicrobial therapy (AT) for catheter-related septic deep venous thrombosis (DVT) is unknown. We aimed to compare the outcomes of patients receiving short-course AT (≤21 days) versus prolonged-course AT (>21 days). Methods This was a monocentric retrospective study comparing adults with catheter-related septic DVT from 2015 to 2020 treated with short- or prolonged-course AT. A propensity score–weighted analysis was used to mitigate potential bias. The primary outcome was a composite of all-cause mortality or recurrent bloodstream infection 30 days after AT discontinuation. Results Of 172 patients with catheter-related septic DVT, 104 were treated with prolonged-course AT and 68 with short-course AT. In the propensity score analysis, we found no significant difference in 30-day all-cause mortality or relapse between the 2 groups (inverse probability of treatment weighted hazard ratio [wHR], 2.16 [95% confidence interval {CI}, .68–6.88]; P = .192). No differences in 90-day all-cause mortality and 90-day relapse were observed between the treatment groups (wHR, 1.01 [95% CI, .49–2.05], P = .987 and 1.13 [95% CI, .08–15.62], P = .928, respectively). Conclusions A 21-day AT could be an effective and safe option to treat catheter-related septic DVT. Further randomized studies are needed to establish the optimal duration of AT for patients with catheter-related septic DVT.

We read with interest the article by Sumi et al.1 about the pharmacodynamic evaluation of intermittent versus extended and continuous infusions of piperacillin/tazobactam in a hollow-fibre infection model (HFIM) against Klebsiella pneumoniae. Using an HFIM, the authors simulated six different piperacillin/tazobactam dosing regimens, ranging from a 4/0.5 g 8 hourly intermittent infusion to a 16/2 g 24 h continuous infusion, to assess the in vitro efficacy of piperacillin/tazobactam against two clinical K. pneumoniae isolates producing ESBLs (SHV-106, CTX-M14) and/or an AmpC plasmid-mediated β-lactamase (DHA-1) with piperacillin/tazobactam MICs of 8 mg/L (Kp68 isolate) and 1 mg/L (Kp69 isolate), respectively. Of note, while fT>MIC were above 100% for almost all regimens/MIC pairings, only 12/1.5 g piperacillin/tazobactam continuous infusion against the Kp69 isolate (piperacillin/tazobactam MIC = 1 mg/L) prevented regrowth and suppressed emergence of resistance. Regrowth with emergence of resistance was observed after 24 h for Kp68 (piperacillin/tazobactam MIC = 8 mg/L) regardless of dosing regimen.

This study aimed to assess phenotypic and molecular inter-patient and within-host diversity of Pseudomonas aeruginosa isolates responsible for urinary tract infection (UTI) or asymptomatic bacteriuria (AB). Clinical data of 120 consecutive P. aeruginosa UTI (n = 40) and AB (n = 80) were prospectively analyzed. Up to five P. aeruginosa isolates per sample were collected. Antimicrobial susceptibility testing (AST) was determined for all isolates (n = 591); a subset of 358 was characterized by multilocus sequence typing. 444 isolates (75%) were non-multidrug resistant (MDR), 113 (19%) were MDR, and 34 (6%) were extensively drug resistant. A genetically highly diverse population was observed (64 sequence types [STs]), without strict correlation between genotypes and clinical settings. 35 patients (28%; 12 UTIs and 23 ABs) presented distinct antimicrobial resistance (AMR) profiles within a given urine sample, significantly associated with previous carbapenem and fluroquinolones exposure; five of them also exhibited polyclonal UTI or AB (with isolates belonging to two STs). P. aeruginosa urinary isolates of these 120 patients were highly diverse, in terms of AMR as well as genetic background. Both within-host AMR and molecular diversity can complicate AST, treatment and control of P. aeruginosa UTI.

INTRODUCTION:The COVID-19 pandemic is associated with a high incidence of venous thromboembolism questioning the utility of a systematic screening for deep venous thrombosis (DVT) in hospitalised patients. METHODS:In this prospective bicentric controlled study, 4-point ultrasound using a pocket device was used to screen for DVT, in patients with SARS-CoV-2 infection and controls admitted for acute medical illness not related to COVID-19 hospitalised in general ward, in order to assess the utility of a routine screening and to estimate the prevalence of VTE among those patients. RESULTS:Between April and May 2020, 135 patients were screened, 69 in the COVID+ group and 66 in the control one. There was no significant difference in the rate of proximal DVT between the two groups (2.2% vs. 1.5%; P=0.52), despite the high rate of PE diagnosed among COVID-19 infected patients (10.1% vs. 1.5%, P=0.063). No isolated DVT was detected, 37.5% of PE was associated with DVT. Mortality (7.2% vs. 1.5%) was not different (P=0.21) between COVID-19 patients and controls. CONCLUSION:The systematic screening for proximal DVT was not found to be relevant among COVID-19 patients hospitalized in general ward despite the increase of VTE among this population. Further studies are needed to confirm the hypothesis of a local pulmonary thrombosis which may lead to new therapeutic targets.

Sir, We thank Giske et al.1 for their response on behalf of the EUCAST Steering Committee to our temocillin cohort study supporting a susceptibility breakpoint at 8 mg/L.2 We are grateful to the JAC Editorial Board for providing us with the opportunity to clarify certain points in this debate, which have important practical consequences. Giske et al.1 state that the current French recommendation is to use EUCAST methodology and breakpoints for all antibiotics (i.e. for temocillin S ≤ 0.001 mg/L and R > 16 mg/L). In fact, while the French committee (CA-SFM) generally endorses EUCAST rules, some of them are modified or not immediately translated into French. For temocillin the last CA-SFM guidelines (V.12 October 2020) still present the breakpoint established at country level in 2014 and used in our study (S ≤ 8 mg/L and R > 8 mg/L). The EUCAST Steering Committee also...

Since December 2019, a pandemic caused by a new coronavirus has spread to more than 170 countries around the world. Worsening infected patients requiring intensive care unit (ICU) admission associated with 30% of mortality. A part of worsening is induced by hemostasis deregulation. The aim of this study was to investigate the association of coagulation activation in COVID-19 progression. Thirty-five of the 99 patients got clinically worse. The final model of the logistic regression analysis revealed that O2 requirement (RR = 7.27 [1.50–19.31]), monocytes below 0.2G/L (RR = 2.88 [1.67–3.19]), fibrinogen levels (RR = 1.45 [1.17–1.82] per g/L increase), prothrombin fragments 1+2 higher than 290 pM (RR = 2.39 [1.20–3.30]), and thrombin peak (RR = 1.28 [1.03–1.59] per 50 nM increase) were associated with an increased risk of clinical worsening. A fibrinogen level threshold of 5.5 g/L, a thrombin peak measurement threshold of 99 pM, and O2 requirement associated with clinical outcome in more than 80% of our cohort. In conclusion, we identified fibrinogen and thrombin peak at admission as coagulation biomarkers associated with an increased risk of ICU admission or death. This finding allows initiating steroids and triage for worsening patients. Our results should therefore be considered as exploratory and deserve confirmation.

Objective. The aim of this pilot study was to assess physical fitness and its relationship with functional dyspnea in survivors of COVID-19 6 months after their discharge from the hospital. Methods. Data collected routinely from people referred for cardiopulmonary exercise testing (CPET) following hospitalization for COVID-19 were retrospectively analyzed. Persistent dyspnea was assessed using the modified Medical Research Council dyspnea scale. Results. Twenty-three people with persistent symptoms were referred for CPET. Mean modified Medical Research Council dyspnea score was 1 (SD = 1) and was significantly associated with peak oxygen uptake (VO(2)peak; %) (rho = -0.49). At 6 months, those hospitalized in the general ward had a relatively preserved VO(2)peak (87% [SD = 20]), whereas those who had been in the intensive care unit had a moderately reduced VO(2)peak (77% [SD = 15]). Of note, the results of the CPET revealed that, in all individuals, respiratory equivalents were high, power-to-weight ratios were low, and those who had been in the intensive care unit had a relatively low ventilatory efficiency (mean VE/VCO2 slope = 34 [SD = 5]). Analysis of each individual showed that none had a breathing reserve <15% or 11 L/min, all had a normal exercise electrocardiogram, and 4 had a heart rate >90%. Conclusion. At 6 months, persistent dyspnea was associated with reduced physical fitness. This study offers initial insights into the mid-term physical fitness of people who required hospitalization for COVID-19. It also provides novel pathophysiological clues about the underlaying mechanism of the physical limitations associated with persistent dyspnea. Those with persistent dyspnea should be offered a tailored rehabilitation intervention, which should probably include muscle reconditioning, breathing retraining, and perhaps respiratory muscle training. Impact. This study is the first, to our knowledge, to show that a persistent breathing disorder (in addition to muscle deconditioning) can explain persistent symptoms 6 months after hospitalization for COVID-19 infection and suggests that a specific rehabilitation intervention is warranted.