目的:基于免疫基因集的生物信息学方法,鉴定和识别软组织肉瘤的免疫特征亚型.方法:从TCGA数据库和GE O数据库下载软组织肉瘤基因表达谱数据,分别对两个数据集进行单样本基因集富集分析及层次聚类分析,鉴定软组织肉瘤的免疫分型.使用ESTIMITE方法评估和定量软组织肉瘤的肿瘤微环境评分.CIBERSOFT反卷积算法计算软组织肉瘤免疫细胞亚群占比.对高和低免疫亚型进行生存分析.最后,通过GS E A算法,对高免疫亚型和低免疫亚型进行京都基因与基因组百科全书数据库通路富集分析.结果:基于单样本基因集富集分析及层次聚类分析,鉴别了两种新的软组织肉瘤免疫亚型.肿瘤微环境分析结果显示高和低免疫亚型具有不同的免疫微环境.CIBERSORT反卷积算法证实了高和低免疫亚型具有不同的免疫细胞亚群比例.生存分析曲线能较好的区分两种不同免疫亚型的患者.京都基因与基因组百科全书数据库通路富集分析结果显示,高免疫亚型富集了大量与免疫相关的通路.结论:本研究鉴定的两种免疫亚型可指导软组织肉瘤患者进行分型,并帮助识别对免疫治疗有反应的患者,具有一定的临床应用价值.

目的 探讨血小板反应蛋白提取整合素金属肽酶7(ADAMTS7)基因表达水平对神经胶质瘤患者预后作用及临床病理特征的关联性.方法 在中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库(http://www.cgga.org.cn)下载mRNAseq 693和mRNAseq 325两个转录组测序数据集,以mRNAseq 693作为探索数据集,mRNAseq 325作为验证数据集.提取数据集病例的ADAMTS7基因表达量,以ADAMTS7的中位值作为截断阈值将患者分为高表达组和低表达组.分析ADAMTS7基因表达水平与患者临床病理特征的关联性及对患者生存预后的影响,并以美国癌症基因组图谱数据库(TCGA)胶质瘤队列作为外部数据集再次验证ADAMTS7基因表达水平与胶质瘤患者预后的关系.结果 无论是在探索数据集还是在验证数据集中,ADAMTS7基因高表达组与低表达组在发生状态、组织学类型、WHO分级、化疗状态、异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变状态和1号染色体短臂和19号染色体长臂(1p19q)共缺失状态方面比较差异均有统计学意义(P<0.05).对于探索数据集,多因素Cox回归分析结果显示,较高的ADAMTS7基因表达水平、疾病复发、WHO分级为Ⅳ级和年龄>43岁是影响患者术后生存预后的危险因素,而接受化疗、IDH突变和1p19q共缺失是影响患者术后生存预后的保护因素(P<0.05).对于验证数据集,多因素Cox回归分析结果显示,较高的ADAMTS7基因表达水平、疾病复发、WHO分级为Ⅳ级是影响患者术后生存预后的危险因素,而组织学类型为多形胶质母细胞瘤(GBM)、接受化疗和1p19q共缺失是影响患者术后生存预后的保护因素(P<0.05).Kaplan-Meier生存分析结果显示,无论是对于探索数据集还是验证数据集,ADAMTS7基因低表达组的术后生存预后均显著优于高表达组(P<0.001).以TCGA胶质瘤数据作为外部数据集验证,结果显示,ADAMTS7基因高表达组的总生存期(OS)和无进展间期(PFI)优于低表达组,差异有统计学意义(P<0.001).结论 ADAMTS7基因表达水平可作为评估神经胶质瘤患者预后的预测因子,具有潜在的临床应用价值.

目的:研究柴胡疏肝散辅助治疗重度抑郁症(MDD)的潜在分子机制.方法:采用网络药理学方法.利用基因表达综合数据库(GEO)下载MDD患者基因芯片数据集GSE76826,再利用R语言软件中的limma包筛选出MDD患者样本中的差异基因.利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选柴胡疏肝散的活性成分及其对应的靶标.通过在线软件venny 2.1.0对MDD的差异基因和柴胡疏肝散的靶标取交集,获取柴胡疏肝散治疗MDD的共同靶标基因,然后将共同靶标基因导入Cytoscape 3.6.1软件构建"柴胡疏肝散活性成分-MDD靶标基因"关系网络.利用BisoGenet插件构建蛋白互作(PPI)网络,并对其进行拓扑结构分析,筛选核心靶标基因,进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析.结果:柴胡疏肝散治疗MDD的活性成分有139种,包括槲皮素、山柰酚、木犀草素、豆甾醇等;其作用的核心靶点基因共有8个,包括NR3C2、DPP4、ALOX5、GSTM1、CCND1、IGFBP3等;其主要通过调节细胞受体、嘌呤代谢、类固醇生物合成、氨酰生物合成等信号通路发挥治疗MDD的作用.结论:柴胡疏肝散可通过多个靶标、多个途径发挥辅助治疗MDD的作用,可为后续研究其作用机制提供理论基础.

目的:观察胫骨横向骨搬移术治疗下肢血栓闭塞性脉管炎的临床疗效及安全性.方法:2014年2月至2018年9月,采用胫骨横向骨搬移术治疗下肢血栓闭塞性脉管炎患者20例,均为男性.年龄31～56岁,中位数38岁.左侧12例,右侧8例.均有吸烟史,吸烟时间5～33年,中位数21年;吸烟量每日5～60支,中位数35支.均经正规非手术或其他手术治疗无效.均有下肢静息痛和间歇性跛行.下肢单纯溃疡6例,单纯坏疽9例,溃疡和坏疽5例.病程1～7年,中位数3年.记录创面愈合时间,测量跛行距离、足趾皮肤温度及踝肱指数,采用疼痛视觉模拟量表(visual analogue scale,VAS)评分评价患者平卧位休息1 h后患肢静息痛程度,术后随访观察并发症发生情况.结果:所有患者均获随访,随访时间14～69个月,中位数40个月.术后1个月,患者的跛行距离较术前增加[(120±20)m,(1320±531)m,t=10.053,P=0.001]、足趾皮肤温度较术前增高[(28.79±0.58)℃,(32.22±1.01)℃,t=15.188,P=0.001]、踝肱指数较术前增大(0.44±0.03,0.84±0.09,t=23.150,P=0.001)、患肢静息痛VAS评分较术前降低[(5.30±1.78)分,(1.30±1.21)分,t=10.066,P=0.001].20例患者中17例创面愈合,愈合时间(3.6±2.7)个月;3例创面未愈合,其中1例经加强换药后创面最终愈合,1例术后3个月因足部缺血症状加重行小腿中上段截肢术,1例因截骨块感染自行在其他医院摘除骨块后行截肢术.至末次随访时,所有已愈合的溃疡或坏疽均未复发,均未出现胫骨骨折、钉道感染、截骨块延迟愈合、下肢深静脉血栓等并发症.结论:胫骨横向骨搬移术治疗下肢血栓闭塞性脉管炎,可以减轻患肢疼痛症状、增加跛行距离、提高足趾皮肤温度及踝肱指数,有利于创面愈合,且安全性较高.

目的 探讨STK3与神经胶质瘤患者的预后作用以及临床变量的相关性.方法 在中国脑胶质瘤癌症基因组图谱计划的1个神经胶质瘤患者独立队列研究STK3 mRNA的表达与预后的关系,并使用该数据库中另外一个独立队列进行验证.结果 STK3 mRNA高表达与神经胶质瘤患者的不良预后相关.STK3在发现队列中与放疗、化疗、IDH突变情况、1p19q丢失状态、WHO分级、组织学类型共6个临床病理特征相关(P <0.05).在验证队列中与年龄、化疗、IDH突变情况、1p19q丢失状态、WHO分级、组织学类型共6个临床病理特征相关(P <0.05).单因素及多因素COX回归分析确定了STK3是独立的预后因素.ROC曲线分析表明STK3对预测病人预后有着较好的特异性和敏感性.基因集富集分析表明,STK3高表型主要富集了癌症相关通路.结论 结果 表明,STK3可作为神经胶质瘤不良预后的生物标志物,值得进一步研究.

目的:探讨重度糖尿病足胫骨横向骨搬移术治疗后创面愈合方式及机制.方法:2014年12月至2018年6月收治136例重度糖尿病足患者.按照Wagner分级标准,3级66例、4级60例、5级10例.按照TEXAS分级标准,2B级32例、2C级2例、2D级11例、3B级13例、3D级78例.均采用胫骨横向骨搬移术治疗.对创面愈合过程进行大体观察,同时分别于术前及术后1个月复诊时切取创面边缘组织,HE染色观察创面组织形态,免疫组织化学染色观察Ki-67、CD31和血管内皮生长因子(vascular en-dothelial growth factor,VEGF)表达情况.结果:①创面大体观察结果.术后初期创面处于炎性期,有炎性细胞浸润,创面黄白;随后有新鲜肉芽组织形成,肉芽组织由创面周围向创面中心移行,创面红润,进入增生期;肉芽组织覆盖创面的过程中,上皮组织逐渐由创面四周向中心移行,1～3个月时创面愈合50%左右,上皮组织最终覆盖创面,仅留线性瘢痕.②创面组织形态观察结果.术前创面边缘组织表皮结构不完整,坏死结构较多.术后1个月创面边缘组织可清晰地观察到完整表皮结构,分为角质层、颗粒层、棘层和基底层;真皮层结缔组织中可观察到血管及胶原纤维,纤维结构少见.术前、术后创面边缘组织表皮均有大量炎性细胞浸润.③术后1个月时,创面边缘组织中 Ki -67、CD31、VEGF染色阳性细胞面积百分比均大于术前[(1.850 ± 1.287)%, (7.480 ± 5.272)%,Z＝3.292,P＝0.001;(0.395 ± 0.139)%,(1.082 ± 0.636)%,Z＝3.403,P＝0.001;(0.341 ± 0.217)%,(2.428 ± 1.502)%,Z＝3.780,P＝0.000].结论:胫骨横向骨搬移术能有效促进重度糖尿病足创面愈合,治疗后创面愈合方式为再生愈合,其机制可能是该手术能促进创面组织细胞增殖与毛细血管再生.

目的:分析重度糖尿病足(diabetic foot,DF)胫骨横向骨搬移术治疗后创面愈合的规律.方法:回顾性分析接受过胫骨横向骨搬移术治疗的重度(Wagner分级3级以上)DF患者的病例资料.统计患者的Wagner分级和创面类型.创面类型分为足趾创面、足背创面、足底创面、足跟创面、踝部以上创面、巨大创面及复杂创面,各类别不重复统计.以骨搬移开始后第1天为创面观察的起始点,从患者的病例资料中提取信息统计创面愈合时间及创面愈合过程中炎症期结束时间、增殖期开始时间、成熟期开始时间.结果:纳入研究的患者共96例.男72例,女24例;年龄32～86岁,中位数61岁;糖尿病病程1～28年,中位数8年;糖尿病足病程1～132个月,中位数2个月;Wagner 3级47例,Wagner 4级40例,Wagner 5级9例;足趾创面39例,足背创面14例,足底创面10例,足跟创面4例,踝部以上创面4例,巨大创面29例,复杂创面17例.96例DF患者的创面均愈合,其中75例可确定准确的创面愈合时间,创面愈合时间为(4.1±2.6)个月.不同Wagner分级DF创面愈合时间比较,差异有统计学意义[(3.3±2.7)个月,(4.5±2.6)个月,(7.3±1.3)个月,F=7.514,P=0.001];Wagner 3级和Wagner 4级DF创面的愈合时间比较,差异无统计学意义(P=0.068);Wagner 3级、Wagner 4级DF创面的愈合时间均比Wagner 5级短(P=0.000,P=0.010).不同类型DF创面愈合时间比较,差异有统计学意义[(3.3±1.8)个月,(4.0±3.9)个月,(2.8±1.0)个月,(5.5±2.8)个月,(4.1±2.5)个月,(5.4±2.9)个月,(5.3±2.3)个月,F=2.423,P=0.033];巨大创面和复杂创面的愈合时间均比足趾创面和足底创面的愈合时间长(P=0.005,P=0.017;P=0.021,P=0.036),其余各种类型的创面愈合时间两两比较,组间差异均无统计学意义.96例DF患者的创面生长方式大致相同,炎症期在骨搬移开始后(32.2±28.9)d结束,增殖期在骨搬移开始后(10.9±6.5)d开始,成熟期在骨搬移开始后(20.3±13.9)d开始.结论:采用胫骨横向骨搬移术治疗重度DF,Wagner 5级DF创面愈合时间长,巨大创面和复杂创面愈合时间长,但各级各类重度DF创面的生长方式大致相同.