بیماری اسهال در گوساله‌های شیری یکی از مشکلات عمده در صنعت دامپروری است که اغلب استفاده از آنتی‌بیوتیک‌ها برای درمان آن کارآمد نیستند و نیز ممکن است باعث ایجاد مشکلاتی نظیر مقاومت به آنتی‌بیوتیک شوند، در نتیجه استفاده از جایگزینی طبیعی برای آن‌ها همانند ایمونوگلوبولین (Y (IgY زرده‌ی تخم مرغ ممکن است راه حل مناسبی باشد. هدف از تحقیق حاضر، تولید ایمونوگلوبولین‌های اختصاصی Y علیه پاتوژن‌های مهم اسهال گوساله از قبیل کروناویروس، روتاویروس، اشریشیا کلی و کلستریدیوم پرفرجنس در زرده تخم مرغ بود. این آزمایش بر روی مرغان تخم‌گذار نژاد‌های لاین W36 با دو تیمار (گروه شاهد و گروه واکسینه شده با واکسن سه گانه‌ی کروناویروس، روتاویروس، اشرشیا کلی و همچنین واکسن کلستریدیوم پرفرجنس) و هفت تکرار در هر گروه انجام شد. از SDS-PAGE جهت بررسی کیفی و از روش بردفورد به منظور بررسی کمی ایمونوگلوبولین Y استفاده گردید. نتایج نشان داد، باندهای مربوط به زنجیره‌ی سبک و سنگین IgY در گروه تیمار نسبت به گروه شاهد اختلاف قابل مشاهده‌ای داشت. بررسی با روش بردفورد نشان داد که غلظت IgY ترشح شده در زرده‌ی تخم‌مرغ گروه تیمار mg/mL 4.729 بود. نتایج مربوط به روش‌های پودر کردن نیز نشان داد که خشک نمودن پاششی موجب تخریب ولی خشک نمودن انجمادی باعث حفظ IgY زرده‌ی تخم‌مرغ شد. مطالعات تکمیلی در مورد سنجش فعالیت زیستی IgY اختصاصی تولید شده در این تحقیق ضروری است.

متاسفانه استفاده از آنتی‌بیوتیک‌ها برای درمان بیماری ورم پستان دام منجر به ایجاد اثرات جانبی نامطلوبی شده است. از جایگزین‌های آنتی‌بیوتیک می‌توان به پروتئین‌های ضد میکروبی نظیر لاکتوپراکسیداز اشاره کرد. هدف از این پژوهش پیش‌بینی پپتیدهای پروتئین لاکتوپراکسیداز و مقایسه‌ی آن‌ها در گونه‌های انسان، شتر، گوسفند، بز، گاومیش و گاو و بررسی خواص ضد باکتریایی آن در برابر باکتری‌های Staphylococcus aureus و Escherichia coli مولد ورم پستان از طریق داکینگ مولکولی است. از این رو، خواص فیزیکوشیمیایی پروتئین لاکتوپراکسیداز و پپتیدهای زیست‌فعال حاصل از آن با استفاده از نرم‌افزار CLC Main Workbench 5 بررسی و سپس ساختار سوم آن برای شتر و انسان از طریق نرم‌افزار Swiss-Model پیش‌بینی شد. در ادامه پپتیدهای این پروتئین پیش‌بینی و در نهایت برهمکنش‌های پروتئین لاکتوپراکسیداز و پپتیدهای حاصل از آن با پروتئین‌های سطحی دو باکتری مذکور با استفاده از نرم‌افزار آنلاین ClusPro2.0 صورت گرفت. نتایج داکینگ مولکولی نشان داد که مناسب‌ترین موقعیت اتصال که در آن پروتئین لاکتوپراکسیداز حاصله با منفی‌ترین انرژی به پروتئین سطحی غشاء این دو باکتری متصل شده است، به ترتیب مربوط به گاو و بز می‌باشد. بررسی بیوانفورماتیکی هفت پپتید حاصل از این پروتئین نیز نشان داد که پپتید شماره‌ی سه مربوط به گاو، بز، گاومیش، گوسفند عملکرد بهتری در اتصال و تخریب پروتئین سطحی غشاء این دو باکتری داشته و با انرژی اتصال منفی تری نسبت به فرم کامل پروتئین لاکتوپراکسیداز به این باکتری‌ها متصل شده است. امید است بتوان در آینده از این پپتیدها به‌عنوان جایگزینی مناسب برای آنتی‌بیوتیک‌ها در بخش درمان بیماری ورم پستان استفاده کرد.

نآ نامرد یارب اه کیتویب یتنآ زا هدافتسا بلغا هک تسا یرورپماد تعنص رد هدمع تلاكشم زا یكی یریش یاه هلاسوگ رد لاهسا یرمایب یارب یعیبط ینیزگیاج زا هدافتسا هجیتن رد ،دنوش کیتویب یتنآ هب تمواقم ریظن یتلاکشم داجیا ثعاب تسا نکمم زین و دنتسین دمآراک یاه نیلوبولگونومیا دیلوت ،ضراح قیقحت زا فده .دشاب یبسانم لح هار تسا نکمم غرم مخت ی هدرز Y (IgY( نیلوبولگونومیا دننماه اه نآ مخت هدرز رد سنجرفرپ مویدیترسلک و یلک ایشیشرا ،سوریواتور ،سوریوانورک لیبق زا هلاسوگ لاهسا مهم یاه نژوتاپ هیلع Y یصاصتخا ی هناگ هس نسکاو اب هدش هنیسکاو هورگ و دهاش هورگ( رمایت ود اب W36 نیلا یاه داژن راذگ مخت ناغرم یور رب شیامزآ نیا .دوب غرم SDS-PAGE زا .دش ماجنا هورگ ره رد رارکت تفه و )سنجرفرپ مویدیترسلک نسکاو نینچمه و یلک ایششرا ،سوریواتور ،سوریوانورک هب طوبرم یاهدناب ،داد ناشن جیاتن .دیدرگ هدافتسا Y نیلوبولگونومیا یمک یسررب روظنم هب دروفدرب شور زا و یفیک یسررب تهج هک داد ناشن دروفدرب شور اب یسررب .تشاد یا هدهاشم لباق فلاتخا دهاش هورگ هب تبسن رمایت هورگ رد IgY نیگنس و کبس ی هریجنز کشخ هک داد ناشن زین ندرک ردوپ یاه شور هب طوبرم جیاتن .دوب 4.729 mg/mL رمایت هورگ غرم مخت ی هدرز رد هدش حشرت IgY تظلغ تیلاعف شجنس دروم رد یلیمکت تاعلاطم .دش غرم مخت ی هدرز IgY ظفح ثعاب یدماجنا ندونم کشخ یلو بیرخت بجوم یششاپ ندونم .تسا یروضر قیقحت نیا رد هدش دیلوت یصاصتخا IgY یتسیز

مقدمه:فشارخون بالا یک عامل خطرناک برای بیماریهای قلبی-عروقی از جمله بیماری عروق کرونر قلب و سکته های مغزی محسوب می شود. دربدن انسان سیستمی بانام سیستم رنین-آنژیوتنسین تنظیم فشارخون را برعهده دارد که آنزیم مبدل آنژیوتنسینACEنقش مهمی درافزایش فشارخون دارد. پپتید کازئوکینین از پروتئین آلفاS1کازئین شیر مشتق شده است و دارای خاصیت مهار آنزیم ACE و کاهش فشار خون می باشد. هدف از انجام این پژوهش،شناسائی پروتئین آلفاs1 کازئین و پپتیدهای زیست فعال مهارکننده آنزیم ACEدر شیر انسان و همچنین مقایسه آن با گونه های مختلف از پستانداران می باشد. مواد و روش:ابتدا جمع آوری داده های ژنومی و پروتئینی برای هشت گونه مختلف پستانداران(گاو،گوسفند،شتر،اسب،انسان،گاومیش و خوک) از سایت مرکز ملی اطلاعات زیست‌فناوری(NCBI) صورت گرفت و پس از آن پیش بینی پپتیدهای زیست فعال پروتئین آلفاs1کازئین و ساختار سه بعدی آن ها با کمک نرم افزارهای آنلاینACCLUSTERServer،I-TASSER و GalaxyWEB انجام شد. شبیه سازی برهمکنش(داکینگ) پروتئین های آلفاs1کازئین و پپتیدهای زیست فعال ایزراکیدین با باکتری های مولد ورم پستان در درون سلول با استفاده از نرم افزار آنلاینClusPro2.0 انجام شد. نتایج و بحث:نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی پروتئین شیر انسان با سایر پستانداران نشان داد که شیر "شتر" از لحاظ خواص فیزیکوشیمیائی شبیه ترین شیر به انسان را دارد.همچنین در بررسی برهمکنش مولکولی این پروتئین و پپتیدهای زیست فعال آن درهشت گونه مختلف از پستانداران مشخص شد که شیر "شتر" بعد از شیر انسان بیشترین عملکرد در مهار آنزیم ACE و کاهش فشار خون را دارد. نتیجه گیری:پپتید زیست فعال کازئوکینین دارای ترکیبات داروئی می باشد که می تواند در درمان فشارخون و بیماری های قلبی مورد استفاده قرارگیرد. بنابراین از این پپتید می توان به عنوان افزودنی های غذایی فراسودمند و طبیعی،جایگزین مناسب برای داروهای سنتزی ضدفشارخون استفاده کرد.

سابقه و هدف: اسهال یک بیماری رایج میان گوساله ها بوده که سبب زیان اقتصادی چشمگیر در صنعت گاوهای شیری و گوشتی به علت افزایش میزان مرگ و میر، هزینه‌های درمان و کاهش نرخ رشد و افزایش سن اولین زایمان می‌گردد. روتاویروس گاوی یکی از عوامل اصلی ابتلا به اسهال در گوساله ها در سن یک تا دوهفتگی است. دو پروتئین vp4 و vp7 کپسید خارجی ویروس را ساخته و سبب تولید آنتی بادی و تحریک سیستم ایمنی می‌شوند. لاکتوفرامپین-لاکتوفریسین شتری یک ضد ویروس قوی است که با اتصال به هپارین سولفات پروتئوگلایسین مانع ورود ویروس به سلول میزبان شده و می‌تواند جایگزین داروهای ضد ویروسی شود. هدف از این پژوهش بررسی امکان جایگزینی پپتید لاکتوفرین شتری با داروهای ضد ویروسی می باشد.مواد و روش ها: در این مطالعه امکان جایگزینی شش پپتید نوترکیب لاکتوفرین شتری به نام‌های clf36-1، clf36-2، 12A-36F+BC، A_Scaning، AF، Arm با داروهای ضدویروسی و اتصال کارآمد این پپتیدها با پروتئین‌های سطحی روتاویروس گاوی(vp4 و vp7) با استفاده از روش شبیه‌سازی دینامیک مولکولی و با استفاده از نرم افزار گرومکس بررسی و با توجه به انرژی آزاد پیوند شدن لیگاند-پروتئین در مرحله داکینگ و میزان بار الکتریکی سیستم پیش از خنثی سازی بار در دینامیک مولکولی مورد مقایسه قرار گرفته و در نهایت بهترین پپتید جایگزین با توجه به نمودارهای شعاع چرخشی که مهم ترین عامل تعیین کننده در کارآمدی سیستم‌ها در شرایط درون تنی و همچنین نشان دهنده‌ی امکان اتصال پایدار پپتید نوترکیب لاکتوفرین با پروتئین سطحی ویروس است؛ از میان شش پپتید مورد مطالعه، انتخاب گردید. یافته ها: نتایج حاصل از این پژوهش نشان می دهد پپتید لاکتوفرین به خوبی با پروتئین های سطحی روتاویروس اتصال برقرار کرده و به این وسیله می تواند مانع ورود ویروس به درون سلول‌ها گردد. با این حال از میان شش پپتید مورد بررسی، پپتید 12A-36F+BC در دو سیستم vp4 و vp7 علی رغم داشتن بیشترین انرژی آزاد پیوند شدن لیگاند-پروتئین در بین مدل‌های مورد بررسی در مرحله داکینگ و مثبت‌ترین بار الکتریکی پیش از خنثی سازی بار در دینامیک مولکولی، به دلیل unfold بودن و تغییرات زیاد Rg آنها در طول زمانِ شبیه سازی به نظر می رسد در شرایط بدن اتصال کارآمدی نداشته باشند؛ از این رو با توجه به نمودارهای شعاع چرخشی از مطالعه حاضر انتظار می‌رود سیستم پروتئین سطحی vp4 و پپتید نوترکیب clf36-1 دارای بهترین اتصال باشد.نتیجه گیری: نتایج حاصل از این تحقیق نشان می‌دهد پپتید clf36-1 از میان شش پپتید مورد بررسی طی زمان شبیه سازی پایدار و دارای اتصال کارآمد و مناسب با پروتئین سطحی vp4 بوده، ضمن اینکه طی زمان شبیه سازی ساختار خود را حفظ کرده و از این طریق میتواند مانع ورود ویروس به درون سلول‌ها شده و جایگزین مناسبی برای داروهای ضد ویروسی باشد. با این حال انجام آزمایشات در شرایط in vivo به منظور اثبات اثربخشی این پپتید ضروری می نماید.

سابقه و هدف: به‌طورکلی عوامل ایجادکننده‌ی ورم پستان به دو دسته‌ی عوامل واگیردار (نظیر: استافیلوکوکوس اورئوس) و عوامل محیطی نظیر (اشرشیاکلای) تقسیم‌بندی می‌‌شود. راه رایج درمان این بیماری استفاده از آنتی بیوتیک هاست که می‌تواند موجب بروز مشکلاتی مرتبط با سلامت شود. پپتیدهایی که در محیط آزمایشگاهی یا در موجودات زنده از هضم ناقص پروتئین ها ایجاد و دارای عملکرد زیستی خاص باشند را اصطلاحا پپتیدهای زیست فعال نامیده می‌شوند. کازئین حاوی پپتیدهای ضد باکتریایی به نام ایزراکیدین می‌باشد که از طریق تخریب غشای سلولی یا غشای میتوکندری باعث نابودی سلول‌های باکتریایی می‌شود. هدف از انجام این پژوهش، شناسائی پروتئین و پپتیدهای زیست فعال ضدباکتریائی پروتئین آلفا s1 کازئین در هشت گونه مختلف از پستانداران و مقایسه خاصیت ضدباکتریائی این پپتید ها در این هشت گونه از پستاندران در مقابله با دو باکتر مهم مولد ورم پستان استافیلوکوکوس اورئوس و اشرشیاکلای می باشد. مواد و روش: ابتدا جمع آوری داده‌های ژنومی و پروتئینی برای هشت گونه مختلف پستانداران(گاو، گوسفند، شتر، اسب، انسان، گاو و خوک) از سایت مرکز ملی اطلاعات زیست‌فناوری(NCBI) صورت گرفت و پس از آن پیش بینی پپتیدهای زیست فعال پروتئین آلفا s1 کازئین و ساختار سه بعدی آن ها با کمک نرم افزارهای آنلاین ACCLUSTERServer ، I-TASSER و GalaxyWEB انجام شد. برای بررسی پایداری پروتئین و پپتیدها در شرایط دینامیکی (شرایط درون سلول) از نرم افزار های آنلاین 3Drefine و YASARA استفاده گردید. در نهایت شبیه سازی برهمکنش(داکینگ) پروتئین‌های آلفا s1 کازئین و پپتیدهای زیست فعال ایزراکیدین با باکتری‌های مولد ورم پستان در درون سلول با استفاده از نرم افزار آنلاینClusPro2.0 انجام شد. یافته ها: نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی برهمکنش مولکولی این پروتئین و پپتیدهای زیست فعال آن در هشت گونه مختلف از پستانداران با پروتئین های سطحی غشاء دو باکتری مهم مولد ورم پستان نشان می دهد که شیر گوسفند و خوک دارای بالاترین عملکرد در در نابودی باکتری استافیلوکوکوس ، شیر انسان و گاو میش نیز بهترین عملکرد در مقابله با باکتری اشرشیا کلای و جلوگیری از بیماری ماستیت (ورم پستان) را دارا هستند. نتیجه گیری : بنابراین به نظر می رسد که می توان از پپتیدهای ایزراکیدین به عنوان عامل طبیعی و مواد جایگزین آنتی بیوتیک برای کاهش اثرات مخرب بیماری ورم پستان بر سلامت از طریق امکان انتقال سویه‌های باکتریایی مقاوم شده به آنتی‌بیوتیک از دام به و همچنین افزایش کیفیت شیر مصرفی (کاهش تعداد سلول‌های بدنی در شیر، افزایش تولید شیر و آسیب کمتر به بافت پستانی) استفاده کرد.

سابقه و هدف: به‌طورکلی عوامل ایجادکننده‌ی ورم پستان به دو دسته‌ی عوامل واگیردار (نظیر: استافیلوکوکوس اورئوس) و عوامل محیطی نظیر (اشرشیاکلای) تقسیم‌بندی می‌‌شود. راه رایج درمان این بیماری استفاده از آنتی بیوتیک هاست که می‌تواند موجب بروز مشکلاتی مرتبط با سلامت انسان شود. پپتیدهایی که در محیط آزمایشگاهی یا در موجودات زنده از هضم ناقص پروتئین ها ایجاد و دارای عملکرد زیستی خاص باشند را اصطلاحا پپتیدهای زیست فعال نامیده می‌شوند. کازئین حاوی پپتیدهای ضد باکتریایی به نام ایزراکیدین می‌باشد که از طریق تخریب غشای سلولی یا غشای میتوکندری باعث نابودی سلول‌های باکتریایی می‌شود. هدف از انجام این پژوهش، شناسائی پروتئین و پپتیدهای زیست فعال ضدباکتریائی پروتئین آلفا s1 کازئین در هشت گونه مختلف از پستانداران و مقایسه خاصیت ضدباکتریائی این پپتید ها در این هشت گونه از پستاندران در مقابله با دو باکتر مهم مولد ورم پستان استافیلوکوکوس اورئوس و اشرشیاکلای می باشد. مواد و روش: ابتدا جمع آوری داده‌های ژنومی و پروتئینی برای هشت گونه مختلف پستانداران(گاو، گوسفند، شتر، اسب، انسان، گاو میش و خوک) از سایت مرکز ملی اطلاعات زیست‌فناوری(NCBI) صورت گرفت و پس از آن پیش بینی پپتیدهای زیست فعال پروتئین آلفا s1 کازئین و ساختار سه بعدی آن ها با کمک نرم افزارهای آنلاین ACCLUSTERServer ، I-TASSER و GalaxyWEB انجام شد. برای بررسی پایداری پروتئین و پپتیدها در شرایط دینامیکی (شرایط درون سلول) از نرم افزار های آنلاین 3Drefine و YASARA استفاده گردید. در نهایت شبیه سازی برهمکنش(داکینگ) پروتئین‌های آلفا s1 کازئین و پپتیدهای زیست فعال ایزراکیدین با باکتری‌های مولد ورم پستان در درون سلول با استفاده از نرم افزار آنلاینClusPro2.0 انجام شد. یافته ها: نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی برهمکنش مولکولی این پروتئین و پپتیدهای زیست فعال آن در هشت گونه مختلف از پستانداران با پروتئین های سطحی غشاء دو باکتری مهم مولد ورم پستان نشان می دهد که شیر "گوسفند و خوک" دارای بالاترین عملکرد در در نابودی باکتری استافیلوکوکوس ، شیر "انسان و گاو میش" نیز بهترین عملکرد در مقابله با باکتری اشرشیا کلای و جلوگیری از بیماری ماستیت (ورم پستان) را دارا هستند. نتیجه گیری : بنابراین به نظر می رسد که می توان از پپتیدهای ایزراکیدین به عنوان عامل طبیعی و مواد جایگزین آنتی بیوتیک برای کاهش اثرات مخرب بیماری ورم پستان بر سلامت انسان از طریق امکان انتقال سویه‌های باکتریایی مقاوم شده به آنتی‌بیوتیک از دام به انسان و همچنین افزایش کیفیت شیر مصرفی (کاهش تعداد سلول‌های بدنی در شیر، افزایش تولید شیر و آسیب کمتر به بافت پستانی) استفاده کرد.

هدف از این مطالعه توالی­یابی برخی از ژن­های میتوکندریایی دخیل در زنجیرة انتقال الکترون شامل: NADH دهیدروژناز با زیرواحدهای 1، 5 و 6، زیرواحد 1 سیتوکرم­اکسیداز C و زیرواحد 6 ATP سنتاز در شتر تک­کوهانه و دوکوهانة ایرانی بود. برای انجام این پژوهش ده و پانزده نمونة خون به ترتیب از شترهای تک­کوهانه و دوکوهانه و به‌طور جداگانه از کشتارگاه مشهد و مرکز اصلاح نژاد مشکین­شهر گرد­آوری شد. پس از استخراج DNA، قطعه‌های مورد نظر به روش PCR افزایش و توالی­یابی شدند. نتایج بررسی تغییرپذیری اسیدآمینه­ای بین دو گونه شتر تک­کوهانه و دوکوهانة ایرانی نشان داد که بیشترین تغییرپذیری مشاهده‌شده مربوط به ژن ATP6 بود.کمترین تغییرپذیری مشاهده‌شده نیز مربوط به ژن سیتوکرم­اکسیداز C بود. نتایج درخت تبارزایی (فیلوژنی) نشان داد، گونة شتر ایرانی، در میان گونه­های شترسانان دارای توالی ثبت‌شده، بیشترین همانندی را با شترهای عربی دارد. با توجه به درخت­های ترسیم‌شده برای هر یک از ژن­ها به­طور جداگانه و پیوسته (مجموعة این ژن­ها) می­توان نتیجه‌گیری کرد که برای انجام بررسی‌های تبارزایی، استفاده از هر یک از این ژن­ها به‌صورت جداگانه و یا استفاده از مجموعة آن‌ها نتیجة همسانی دارد. بنابراین می‌توان پیشنهاد کرد که با استفاده از یکی از این ژن­ها نیز می­توان بررسی‌های تبارزایی شایان‌پذیرشی را انجام داد.

زمینه مطالعاتی: کشور ایران جزء یکی از محدود مناطقی است که کشاورزی و اهلی شدن حیوانات توسط انسان­های اولیه در آن اتفاق افتاده است و در نتیجه باعث شده است که ایران دارای ذخایر ژنتیکی ارزشمندی در حیوانات اهلی باشد. از طرفی ایران با داشتن بیش از 27 نژاد گوسفند اهلی به همراه 5 زیرگونه گوسفند وحشی، دارای ذخیره ژنتیکی با تنوع کم نظیری در دنیا می باشد. هدف: هدف از انجام این تحقیق توالی­یابی ناحیه HVR-III از ژنوم میتوکندری گوسفندان اهلی نژاد مغانی، لری­بختیاری، سنگسری، بلوچی، کرمانی، شال، قره­گل و کردی به منظور بررسی ارتباط فیلوژنیک بین نژادهای مذکور و همچنین مقایسه با هاپلوتایپ­های شاخص شناسایی شده گوسفند اهلی می­باشد. روش کار: برای این منظور تعداد 80 نمونه خون جمع‌آوری و پس از استخراج DNA، ناحیه موردنظر توسط پرایمرهای اختصاصی به روش PCR تکثیر و سپس توالی­یابی شدند. نتایج: با تجزیه و تحلیل داده­های حاصل از تعیین توالی و مقایسه توالی HVR-III گوسفندان ایرانی با یکدیگر و با توالی ناحیه مشابه از ژنوم گوسفندان سایر نژاد­ها، مشخص شد که علیرغم تنوع فنوتیپی قابل توجه در بین نژاد­های مورد مطالعه، این نژاد­ها همگی متعلق به گروه هاپلوتایپی A می­باشد. این امر ممکن است به دلیل نزدیکی جغرافیایی مکان زیستی آن ها و یا به دلیل روش خاص زندگی عشایر باشد که انتظار می رود نژاد­های متنوع امروزی ایران از توده های محدودی با تنوع نسبتا کم مشتق شده باشند. نتیجه گیری نهایی: نتیجه گیری کامل تر نیازمند مطالعه بخش­های بزرگتری از DNA میتوگندری و همچنین بر روی تعداد بیشتر نمونه از نژادهای اهلی به همراه مطالعه تنوع نژادهای وحشی گوسفند ایران است.

بروسلوز يکی از رايج ترين بيماری های دامی است که توسط باکتری گرم منفی بروسلا ايجاد می‌شود. با توجه به ضرر‌های جدی اقتصادی و درمانی اين بيماری که برای دام و انسان همواره به ارمغان دارد تلاش‌های بسياری جهت جلوگيری و درمان اين بيماری توسط واکسن‌های نوترکيب بر پايه آنتی ژن‌های غشای پروتئينی خارجی صورت می‌گيرد. بدين منظور هدف از مطالعه حاضر بررسی خصوصيات بيوانفورماتيکی آنتی ژن های Omp25  و BLSبه عنوان يکی از آنتی ژن های غالب غشای پروتئينی باکتری بروسلا بوده است. به منظور انجام توالی‌يابی و بررسی فيلوژنتيکی، ژن تکثير شده به ناقل pTZ57R/T انتقال داده شد. حضور ژن هدف در ناقل کلونينگ pTZ57R/T با استفاده از روش واکنش زنجيره ای پليمراز و هضم آنزيمی تاييد شد. نتايج اين مطالعه نشان داد که اين ژن همولوژی بالايی با ديگر گونه های بروسلا دارد. در اين پژوهش از نرم افزار‌های بيوانفورماتيکی مختلفی برای پيش بينی اپی توپ‌های B و T ، ساختار دوم و سوم پروتئين، خصوصيات ايمنی زايی و ويژگی‌های هضم پروتئين استفاده گرديد. پيش از استفاده از نرم افزار ها ميزان دقت آنها توسط داده های تجربی اعتبار سنجی گرديد. نتايج آناليز بيوانفورماتيکی نشان داد ناحيه 154-162 Omp25  و نواحی 37-48 و 119-139 برای BLS به عنوان يک اپی توپ مشترک بين سلول های B و T جهت طراحی واکسن نوترکيب پيش بينی گرديد.

بروسلوز یکی از رایج ترین بیماری های دامی است که توسط باکتری گرم منفی بروسلا ایجاد می‌شود. با توجه به ضرر‌های جدی اقتصادی و درمانی این بیماری که برای دام و انسان همواره به ارمغان دارد تلاش‌های بسیاری جهت جلوگیری و درمان این بیماری توسط واکسن‌های نوترکیب بر پایه آنتی ژن‌های غشای پروتئینی خارجی صورت می‌گیرد. بدین منظور هدف از مطالعه حاضر بررسی خصوصیات بیوانفورماتیکی آنتی ژن های Omp25 و BLSبه عنوان یکی از آنتی ژن های غالب غشای پروتئینی باکتری بروسلا بوده است. به منظور انجام توالی‌یابی و بررسی فیلوژنتیکی، ژن تکثیر شده به ناقل pTZ57R/T انتقال داده شد. حضور ژن هدف در ناقل کلونینگ pTZ57R/T با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلیمراز و هضم آنزیمی تایید شد. نتایج این مطالعه نشان داد که این ژن همولوژی بالایی با دیگر گونه های بروسلا دارد. در این پژوهش از نرم افزار‌های بیوانفورماتیکی مختلفی برای پیش بینی اپی توپ‌های B و T ، ساختار دوم و سوم پروتئین، خصوصیات ایمنی زایی و ویژگی‌های هضم پروتئین استفاده گردید. پیش از استفاده از نرم افزار ها میزان دقت آنها توسط داده های تجربی اعتبار سنجی گردید. نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی نشان داد ناحیه 154-162 Omp25 و نواحی 37-48 و 119-139 برای BLS به عنوان یک اپی توپ مشترک بین سلول های B و T جهت طراحی واکسن نوترکیب پیش بینی گردید.

خلوص ژنتیکی نژادهای گوسفند به‌علت تلاقی‌های کنترل نشده دستخوش تغییر شده است، استفاده از نشانگرهای ژنتیکی توالی­یابی ژنوم میتوکندری، یکی از راه‌های بررسی این تغییرات است. هدف از این تحقیق بررسی میزان تنوع ناحیه HVR-I از ژنوم میتوکندری گوسفند نژاد افشاری می­باشد. برای این منظور از تعداد 20 رأس گوسفندان افشاری غیرخویشاوند نمونه خون جمع‌آوری و پس از استخراج DNA از آنها، ناحیه موردنظر توسط پرایمرهای اختصاصی با تکنیک PCR، تکثیر و قطعات موردنظر توالی­یابی شدند. با تجزیه داده­های حاصل، تعداد 5 هاپلوتیپ در این جمعیت شناسایی شد. مقایسه توالی HVR-I گوسفند افشاری با توالی ناحیه مشابه از ژنوم گوسفندان سایر نژاد­ها، مشخص کرد این نژاد متعلق به گروه هاپلوتیپی A می­­باشد، همچنین مقایسه توالی مذکور گوسفند افشاری با منطقه مشابه در گروه هاپلوتیپی A از ژنوم گوسفندان سایر نژادها، نشان داد که گوسفند افشاری داری کمترین فاصله ژنتیکی با نژاد بلوچی و مغانی ایران می­باشد. همچنین تجزیه و تحلیل درخت فیلوژنی رسم شده برای گروه هاپلوئیدی A نشان داد که احتمالا قوچ و میش اوریال به‌عنوان منشا نژاد افشاری و دو نژاد دیگر گوسفند محسوب می‌شود.

چکیده:نژادهای بومی ایران بخشی از سرمایه ملی تلقی شده بنابراین شناسایی و حفظ آن‌ها اهمیت ویژه‌ای دارد. توجه بیشتر به این نژادها از دیدگاه ژنتیک حفاظتی با توجه به کاهش شدید جمعیت آن‌ها، در برخی مناطق از اهمیت زیادی برخوردار است. شتر از جمله دام‌های اهلی مناطق بیابانی است که می‌تواند چندین روز متوالی را بدون خوردن آب سپری کند و حداکثر استفاده را از مراتع بنماید، در صورتی که این امر برای سایر دام‌ها مشکل و اغلب غیر ممکن می‌باشد. این حیوان اهمیت بسیار زیادی در اقتصاد برخی از پرورش‌دهندگان و روستانشینان حاشیه کویر از جهت تولید شیر و گوشت و هم‌چنین به واسطه سواری و بارکشی دارد. این تحقیق با هدف بررسی ژنتیکی و فیلوژنتیکی توالی ناحیه دی لوپ در دو گونه شتر تک کوهانه و شتر دو کوهانه ایران انجام گرفت. نمونه خون شترهای تک کوهانه (10 نفر) از کشتارگاه مشهد و نمونه خون شترهای دو کوهانه (15نفر) از مرکز اصلاح نژاد شهر مشکین‌شهر در استان اردبیل جمع‌آوری شد. پس از استخراج DNA توالی مورد نظر با استفاده از آغازگرهای اختصاصی یه روش pcr تکثیر و توالی یابی شد.نتایج نشان داد که تمامی نمونه‌ها به خوبی توالی‌یابی شده‌اند، پس از تجزیه و تحلیل اطلاعات بدست آمده، 3 هاپلوتایپ در نژادهای تک‌کوهانه و 6 هاپلوتایپ در نژادهای دوکوهانه مشاهده گردید. نتایج درخت فیلوژنی نیز نشان داد که گونه شتر در میانه گونه‌های دارای توالی ثبت شده در بانک ژنی، بیشترین شباهت را با توالی‌های مرجع ثبت شده که مربوط به شترهای عربی می‌باشند دارد که این امر ممکن است به دلیل قرابت ژنتیکی بسیار نزدیک شترهای ایرانی با نژادهای عربی باشد.کلمات کلیدی: شتر بومی ایران- میتوکندری- هاپلوتایپ- فیلوژنیAbstract:Iranian native species are considered as part of the national asset therefore their preservation is important. Due to severe decrease in their population size in some parts of Iran, more attention to these species from conservation genetics perspective is required. The goal of this study was to analyse the DNA sequence of the D-loop region of mitochondria in Iranian camels and draw the phylogenetic tree. For this study 10 blood samples from Dromedary and 15 blood samples from Bacterian camels were collected. After DNA extraction, D-loop region was amplified with specific primers using PCR, and then the fragments were sequenced. In studied populations,3 and 6 haplotypes were observed in single-humped and double-humped Iranian camels, respectively. The Neighbor-Joining phylogenetic test results showed that Iranian camels have the lowest genetic distance with Arabian camels, it can be concluded that Iranian camels has genetic similarities with Arabian camels.Key words: Iranian camels- mitochondria- haplotypes- phylogenetic