Проанализированы современные данные о роли генетического тестирования мутаций в генах, ответственных за предрасположенность к наследственному раку половых органов у женщин. Представлены данные о важности использования генетического тестирования в клинической практике для прогнозирования развития заболевания, необходимости последующего мониторинга при наличии мутационной нагрузки и выбора тактики комбинированной терапии при злокачественных новообразованиях The authors analyzed available data in modern literature on the role of genetic testing for mutations in genes responsible for predisposing to hereditary cancers of reproductive organs in women. They are looking at data on the importance of using genetic testing in clinical practice to predict the disease development, need for follow-up monitoring in the presence of mutation load, and determination of combined chemotherapy policy for malignant neoplasms.

Неинвазивный пренатальный ДНК-скрининг (НИПС) начал использоваться в клинической практике в 2011г. и в настоящее время широко применяется, как и в мире, так и в России. Проанализирована встречаемость «редких» анеуплоидий при проведении полногеномного НИПС у 2061 пациенток и исходы беременностей при наличии таких результатов. Показано, что при анализе всего генома для полногеномного варианта НИПС можно получить дополнительную информацию, важную как для прогноза течения беременности, так и для прогноза плода. Это позволяет выделить дополнительную небольшую группу беременных, которым может быть рекомендовано более пристальное наблюдение в течение беременности или проведение дополнительных диагностических процедур. Однако для определения чувствительности и специфичности определения «редких» анеуплодий и CNV в настоящий момент недостаточно данных. Noninvasive prenatal DNA screening (NIPS) is getting more widespread in clinical practice in Russia and all around the world. The use of shallow whole-genome sequencing for NIPS allows analysis of all chromosome aneuploidies; hence there are large-scale studies only on test performance on common trisomies. This study aimed to analyze the prevalence of «rare» aneuploidies using whole-genome NIPS and pregnancy outcomes in case of a high risk of «rare» aneuploidy. Noninvasive prenatal DNA screening was performed using in house developed protocol. We have analyzed 2061 samples. In 8 cases (0.4%) high-risk of rare trisomy was detected (3 - trisomy 7, 2 - trisomy 8, 1 - trisomy 10, 2 - trisomy 15). We have identified two cases of a high risk of large copy number variations (CNV). For all of the high-risk cases, we have information about pregnancy outcomes. Thereby whole-genome analysis will enable us to get the additional information and reveal pregnancies in need of further observation or testing. Hence there is not enough data for the estimation of sensitivity and specificity of detection of «rare» aneuploidies.

Используемый в настоящее время в России пренатальный скрининг хромосомной патологии основан на косвенных маркерах и имеет ограничение по чувствительности и специфичности. Поэтому более перспективным является применение неинвазивного пренатального ДНК-скрининга анеуплоидий (НИПС). Целью данной работы являлась оценка возможности применения полногеномного НИПС при оказании акушерско-гинекологической помощи. Проведена валидация ДНК-скрининга на образцах с известными результатами пренатальной инвазивной диагностики (N=1134). Доказана возможность транспортировки и хранения образцов (N=477). Проведено отсроченное исследование аликвот плазмы через год после первоначального исследования (N=70). Оценены факторы, которые могут влиять на результаты НИПС - доля плодовой ДНК, индекс массы тела (ИМТ), срок беременности, мозаицизм и другие. Widely performed in Russia prenatally first-trimester screening is based on secondary markers of pathology and has limited sensitivity and specificity. The most promising alternative is the use of noninvasive prenatal screening for fetal aneuploidy (NIPS). This study aims to validate the possibility of NIPS usage for obstetric and gynecological care. DNA screening was validated on samples with known results of invasive prenatal diagnostics (N=1134). It was proven that it is possible to store and transport the samples (N=477). We studied plasma aliquot samples after one year of storage (N=70). Factors that can influence the NIPS results were also evaluated: the proportion of fetal DNA, body mass index (BMI), gestational age, mosaicism, and others.

Своевременное обнаружение анеуплоидий плода очень важно в клинической практике. В настоящее время идет активное развитие аналитических методов с применением высокопроизводительного секвенирования. Благодаря неинвазивному пренатальному ДНК-скринингу (НИПС) достоверные результаты можно получать на сроке 9–11 недель. Описан клинический случай применения НИПС и дальнейшей верификации полученных результатов. С помощью методов высокопроизводительного секвенирования, микроматричного анализа амниотической жидкости и цитогенетического кариотипирования у плода обнаружен высокий риск хромосомных перестроек в коротком плече 4-й и 12-й хромосом. Результаты были подтверждены с помощью молекулярного кариотипирования. Проверка родителей позволила выявить у матери сбалансированные хромосомные перестройки в 4-й и 12-й хромосомах. Данный случай демонстрирует преимущества полногеномного подхода перед таргетным при проведении НИПС.

Муковисцидоз (МВ) -одно из наиболее распространенных моногенных заболеваний человека.Определение частоты мутаций моногенного заболевания для конкретных популяций позволяет оптимизировать ДНК-диагностику, сократив ее себестоимость и время проведения.В статье представлены результаты ретроспективного исследования гена CFTR у 191 ребенка со смешенной формой МВ.Для определения 24 наиболее распространенных мутаций CFTR использовали диагностическую ПЦР-панель, а минорные варианты выявляли методом высокопроизводительного секвенирования.С помощью диагностической панели в выборке выявлено 18 типичных мутаций гена CFTR: F508del (с аллельной частотой 54,7%), dele 2,3 (21kb) (7,3%), 2143delT (3,4%), 2184insA (3,4%), 1677delTA (2,4%), N1303K (2,1%), 3849+10kbC>T (2,1%), E92K (2,1%), G542X (1,6%), W1282X (1,6%), S1196X (1,3%), R334W (1,0%), 394delTT(0,8%), 3944delGT (0,8%), 3821delT (0,5%), 2789+5G>A (0,5%), 621+1G>T(0,3%), 2183AA>G (0,3%).В результате секвенирования обнаружено 24 генетических варианта CFTR с потенциальной клинической значимостью.Обнаружено 8 минорных вариантов CFTR, до этого не отмеченных у пациентов в РФ, в том числе 4 новых мутации гена CFTR -p.Glu819Ter, p.Gln378Ter, p.Val1360Phefs и p.Lys1365Argfs.Cystic fibrosis (CF) is one of the most common monogenic disorders of humans.The knowledge of population frequency of a mutant genotype causing a monogenic disease helps to optimize DNA testing and to reduce its costs and time required for the procedure.This article presents the results of a retrospective study of the CFTR gene in 191 children with mixed manifestations of CF.To screen for 24 most common mutations, we used the diagnostic PCR panel; minor mutations were detected by next generation sequencing.The diagnostic panel allowed us to identify 18 typical CFTR mutations, including F508del (allelic frequency of 54.7%), dele 2,3 (21kb) (7.3%), 2143delT (3.4%), 2184insA (3.4%), 1677delTA (2.4%), N1303K (2.1%), 3849+10kbC>T (2.1%), E92K (2.1%), G542X (1.6%), W1282X (1.6%), S1196X (1.3%), R334W (1.0%), 394delTT(0.8%),3944delGT (0.8%), 3821delT (0.5%), 2789+5G>A (0.5%), 621+1G>T(0.3%), and 2183AA>G (0.3%).Sequencing revealed the presence of 24 potentially pathogenic CFTR variants in the sample.We also discovered 8 minor CFTR variants previously unseen in Russian patients with CF, including 4 new CFTR mutations: p.Glu819Ter, p.Gln378Ter, p.Val1360Phefs, and p.Lys1365Argfs.

Неинвазивный пренатальный ДНК-скрининг (НИПС) анеуплоидий по крови матери применяется для выявления хромосомных анеуплоидий (ХА) с 2011 г.Многочисленные клинические исследования показали, что важным параметром при проведении