V nastoyashchee vremya pri provedenii skrininga na rak shejki matki v kachestve pervichnogo metoda diagnostiki vse chashche primenyayut testirovanie na DNK VPCH. Odnako genotipy virusa papilomy cheloveka (VPCH), registriruemye pri issledovanii cervikal'nyh mazkov, mogut otlichat'sya ot rezul'tatov testirovaniya v bioptirovannyh fragmentah shejki matki. Cel'yu issledovaniya bylo izuchit' osobennosti detekcii DNK VPCH parnyh obrazcov epiteliya cervikal'nogo kanala i biopsijnogo materiala shejki matki. VPCH-pozitivnym pacientkam (n = 99) byla vypolnena pricel'naya biopsiya shejki matki. Registraciya DNK VPCH proizoshla 175 raz v biomateriale, poluchennom iz cervikal'nogo kanala, i 111 raz v gistologicheskih blokah. V gruppe pacientok s hronicheskim cervicitom pokazatel' sovpadeniya rezul'tatov testirovaniya na DNK VPCH sostavil 28,3%, dlya gruppy s LSIL — 45%, dlya gruppy s HSIL — 67,7%. Pri nizkoj virusnoj nagruzke VPCH sootvetstvie rezul'tatov nablyudalos' v 27,1% sluchaev, pri umerennoj virusnoj nagruzke — v 35,4%, pri vysokoj virusnoj nagruzke — v 82,3%. Obnaruzhena otnositel'no sil'naya korrelyacionnaya svyaz' mezhdu urovnem virusnoj nagruzki i veroyatnost'yu sovpadeniya rezul'tatov VPCH-testirovaniya: pri uvelichenii urovnya virusnoj nagruzki VPCH na 1 lg nablyudaetsya uvelichenie procenta sootvetstviya rezul'tatov testirovaniya na DNK VPCH mezhdu parnymi obrazcami na 9,3%.

V nastoyashchee vremya v mire idet aktivnaya rabota po optimizacii primeneniya podhodov k opredeleniyu hromosomnoj patologii embrionov. Cel'yu issledovaniya bylo ocenit' vozmozhnost' ispol'zovaniya neinvazivnogo preimplantacionnogo geneticheskogo testirovaniya na aneuploidii (niPGT-A) putem analiza vnekletochnoj DNK v otrabotannoj kul'tural'noj srede (OKS). Provedeno niPGT-A aneuploidnyh embrionov putem analiza vnekletochnoj DNK v OKS. Vse blastocisty byli aneuploidnymi po rezul'tatam predshestvuyushchego preimplantacionnogo geneticheskogo testirovaniya na aneuploidii (PGT-A) s biopsiej trofektodermy (TFE). V issledovanie bylo vklyucheno 11 embrionov ot semi supruzheskih par. Vse embriony razmorazhivali i kul'tivirovali v kaplyah po 10 mkl v techenie 9 ch. Ves' ob"em OKS sobirali i analizirovali putem niPGT-A. Poluchennye rezul'taty sravnivali na sootvetstvie s predshestvuyushchimi dannymi po PGT-A. Summarno vypolnili analiz 12 obrazcov OKS: 11 obrazcov, v kotoryh byli kul'tivirovany embriony, i odin kontrol'nyj obrazec. V odnom sluchae (9,1%) iz 11 byli polucheny haotichnye rezul'taty po dannym niPGT-A, ne pozvolyayushchie provesti diagnostiku sostoyaniya kariotipa. Polnoe sootvetstvie rezul'tatov PGT-A i niPGT-A polucheno v semi sluchayah iz 10 (70%), klinicheskoe sootvetstvie rezul'tatov — v devyati sluchayah iz 10 (90%). V odnom sluchae (10%) po dannym niPGT-A kariotip blastocisty byl diagnostirovan kak euploidnyj. Vyvod: niPGT-A mozhet byt' perspektivnym, ne trebuyushchim biopsii, metodom diagnostiki hromosomnogo statusa preimplantacionnyh embrionov.

Vydelyayut dva varianta sindroma Majera–Rokitanskogo–Kyustera–Hauzera (MRKKH): tip I, pri kotorom nablyudaetsya izolirovannaya aplaziya matki i vlagalishcha, i tip II, pri kotorom imeyut mesto soputstvuyushchie ekstragenital'nye poroki razvitiya, v ramkah nekotoryh sindromal'nyh sostoyanij. Sindrom Langera–Gideona ili trihorinofalangeal'nyj sindrom (TRPS) — redkoe autosomno-dominantnoe zabolevanie, harakterizuyushcheesya licevym dicmorfizmom i anomaliyami kozhi, nogtej i volos. Vydelyayut dva tipa trihorinofalangeal'nogo sindroma: TRPSI, obuslovlennyj patogennym variantom gena TRPSI, i TRPSII, obuslovlennyj deleciej s vovlecheniem genov TRPS1, RAD21 i EXT. Kak pravilo, poroki razvitiya polovyh organov vstrechayutsya pri tipe II. Predstavleno klinicheskoe nablyudenie TRPSII v sochetanii s MRKKH. Otsrochennaya diagnostika poroka razvitiya polovyh organov privela k dlitel'nomu bolevomu sindromu u pacientki s krajne otyagoshchennym anamnezom i provedeniyu neodnokratnyh hirurgicheskih vmeshatel'stv. Svoevremennoe obnaruzhenie sochetaniya anomalij polovyh organov u devochek s TRPS pozvolyaet ne tol'ko ustanovit' diagnoz, no i okazat' kvalificirovannuyu pomoshch' s uchastiem ginekologa detej i podrostkov, s cel'yu minimizacii vozmozhnyh oslozhnenij.

Представлено клиническое наблюдение, иллюстрирующее сложность выбора тактики ведения беременности при выявлении участка дупликации хромосомы Х на этапе пренатальной диагностики. Хромосомная перестройка 46,ХХ,dup(X)(q13.3q21.1) диагностирована при молекулярном кариотипировании околоплодных вод у плода женского пола с особенностями фенотипа: полидактилией левой кисти, полидактилией правой кисти под сомнением, гиперэхогенном кишечнике. We presented a clinical case report about the complexity of the choice of pregnancy management when identifying the X-chromosome duplication using prenatal diagnostic methods. Thus, a chromosomal rearrangement dup(X)(q13.3q21.1) was diagnosed by molecular karyotyping of amniotic fluid in a female fetus with phenotype features: left hand polydactyly, right hand polydactyly in question, hyperechoic intestine.

Testovaya predoperacionnaya gormonoterapiya stala standartnoj proceduroj lecheniya ESR+/Her2-negativnogo raka molochnoj zhelezy rannih stadij. Horoshim podspor'em v ocenke effektivnosti dannoj terapii mogut stat' transkripcionnye profili genov. Cel'yu issledovaniya bylo ocenit' izmeneniya ekspressionnoj aktivnosti genov pri provedenii predoperacionnogo testa na gormonochuvstvitel'nost' opuholi k ingibitoram aromatazy u zhenshchin postmenopauzal'nogo vozrasta pri ESR+/HER2-negativnom rake molochnoj zhelezy. V issledovanie voshlo 100 bol'nyh rakom molochnoj zhelezy, prohodivshih lechenie v otdelenii patologii molochnoj zhelezy FGBU «NMIC AGP im. V.I. Kulakova». Vypolneno patomorfologicheskoe issledovanie FFPE-blokov trepan-biopsii, provedennoj do naznacheniya testa na gormonochuvstvitel'nost', i operacionnogo materiala, a takzhe immunogistohimicheskoe (Ki67, ER, PR, HER2/neu) i molekulyarno-geneticheskoe issledovanie ekspressionnoj paneli 45 celevyh genov metodom kolichestvennoj polimeraznoj cepnoj reakcii v rezhime real'nogo vremeni. Primenenie ingibitorov aromatazy v predoperacionnom teste na gormonochuvstvitel'nost' soprovozhdaetsya statisticheski znachimymi izmeneniyami v ekspressii mRNK 37 genov v opuholyah molochnoj zhelezy, iz nih snizhenie urovnya ekspressii ustanovleno dlya 35 genov (ESR1, PGR, AR, ERBB2, FGFR4, MKI67, MYBL2, CCNB1, AURKA, BIRC5, CCND1, CCNE1, CDKN2A, KIF14, PPP2R2A, PTTG1, TMEM45B, TPX2, ANLN, MMP11, CTSL2, EMSY, PAK1, BCL2, BAG1, PTEN, TYMS, EXO1, UBE2T, NAT1, SCGB2A2, GATA3, FOXA1, ZNF703, CD274/PD-L1), povyshenie dlya 2 genov (SFRP1, KRT5). Poluchennye rezul'taty mogut byt' ispol'zovany v dal'nejshem pri razrabotke testa na gormonochuvstvitel'nost' i personifikacii ad"yuvantnoj sistemnoj terapii bol'nyh rakom molochnoj zhelezy.

Проанализированы современные данные о роли генетического тестирования мутаций в генах, ответственных за предрасположенность к наследственному раку половых органов у женщин. Представлены данные о важности использования генетического тестирования в клинической практике для прогнозирования развития заболевания, необходимости последующего мониторинга при наличии мутационной нагрузки и выбора тактики комбинированной терапии при злокачественных новообразованиях The authors analyzed available data in modern literature on the role of genetic testing for mutations in genes responsible for predisposing to hereditary cancers of reproductive organs in women. They are looking at data on the importance of using genetic testing in clinical practice to predict the disease development, need for follow-up monitoring in the presence of mutation load, and determination of combined chemotherapy policy for malignant neoplasms.

Неинвазивный пренатальный ДНК-скрининг (НИПС) начал использоваться в клинической практике в 2011г. и в настоящее время широко применяется, как и в мире, так и в России. Проанализирована встречаемость «редких» анеуплоидий при проведении полногеномного НИПС у 2061 пациенток и исходы беременностей при наличии таких результатов. Показано, что при анализе всего генома для полногеномного варианта НИПС можно получить дополнительную информацию, важную как для прогноза течения беременности, так и для прогноза плода. Это позволяет выделить дополнительную небольшую группу беременных, которым может быть рекомендовано более пристальное наблюдение в течение беременности или проведение дополнительных диагностических процедур. Однако для определения чувствительности и специфичности определения «редких» анеуплодий и CNV в настоящий момент недостаточно данных. Noninvasive prenatal DNA screening (NIPS) is getting more widespread in clinical practice in Russia and all around the world. The use of shallow whole-genome sequencing for NIPS allows analysis of all chromosome aneuploidies; hence there are large-scale studies only on test performance on common trisomies. This study aimed to analyze the prevalence of «rare» aneuploidies using whole-genome NIPS and pregnancy outcomes in case of a high risk of «rare» aneuploidy. Noninvasive prenatal DNA screening was performed using in house developed protocol. We have analyzed 2061 samples. In 8 cases (0.4%) high-risk of rare trisomy was detected (3 - trisomy 7, 2 - trisomy 8, 1 - trisomy 10, 2 - trisomy 15). We have identified two cases of a high risk of large copy number variations (CNV). For all of the high-risk cases, we have information about pregnancy outcomes. Thereby whole-genome analysis will enable us to get the additional information and reveal pregnancies in need of further observation or testing. Hence there is not enough data for the estimation of sensitivity and specificity of detection of «rare» aneuploidies.

Используемый в настоящее время в России пренатальный скрининг хромосомной патологии основан на косвенных маркерах и имеет ограничение по чувствительности и специфичности. Поэтому более перспективным является применение неинвазивного пренатального ДНК-скрининга анеуплоидий (НИПС). Целью данной работы являлась оценка возможности применения полногеномного НИПС при оказании акушерско-гинекологической помощи. Проведена валидация ДНК-скрининга на образцах с известными результатами пренатальной инвазивной диагностики (N=1134). Доказана возможность транспортировки и хранения образцов (N=477). Проведено отсроченное исследование аликвот плазмы через год после первоначального исследования (N=70). Оценены факторы, которые могут влиять на результаты НИПС - доля плодовой ДНК, индекс массы тела (ИМТ), срок беременности, мозаицизм и другие. Widely performed in Russia prenatally first-trimester screening is based on secondary markers of pathology and has limited sensitivity and specificity. The most promising alternative is the use of noninvasive prenatal screening for fetal aneuploidy (NIPS). This study aims to validate the possibility of NIPS usage for obstetric and gynecological care. DNA screening was validated on samples with known results of invasive prenatal diagnostics (N=1134). It was proven that it is possible to store and transport the samples (N=477). We studied plasma aliquot samples after one year of storage (N=70). Factors that can influence the NIPS results were also evaluated: the proportion of fetal DNA, body mass index (BMI), gestational age, mosaicism, and others.

Миома матки является одной из важнейших социально значимых проблем женского репродуктивного здоровья. Целью исследования было найти маркерные однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), ассоциированные с развитием миомы матки. Для проверки гипотезы о том, что наследственность играет важную роль в патогенезе миом, группу из 100 пациенток с подтвержденным диагнозом миомы матки разделили на две подгруппы: подгруппу Iа с отягощенным семейным анамнезом, подгруппу Iб с неотягощенным семейным анамнезом по миоме матки. Группа сравнения была сформирована из 30 пациенток (женщины в постменопаузе, не имевшие в анамнезе миому матки, отрицавшие наличие миом у ближайших родственниц). Первичную нуклеотидную последовательность определяли с помощью секвенирования по методу Сэнгера. Были выявлены статистически значимые (p < 0,05) различия между исследованными группами по частотам генотипов по rs12637801 и rs12457644. Впервые обнаружены «протективные» SNP, редкие аллели которых могут служить маркерами пониженного риска развития лейомиом матки.

Своевременное обнаружение анеуплоидий плода очень важно в клинической практике. В настоящее время идет активное развитие аналитических методов с применением высокопроизводительного секвенирования. Благодаря неинвазивному пренатальному ДНК-скринингу (НИПС) достоверные результаты можно получать на сроке 9–11 недель. Описан клинический случай применения НИПС и дальнейшей верификации полученных результатов. С помощью методов высокопроизводительного секвенирования, микроматричного анализа амниотической жидкости и цитогенетического кариотипирования у плода обнаружен высокий риск хромосомных перестроек в коротком плече 4-й и 12-й хромосом. Результаты были подтверждены с помощью молекулярного кариотипирования. Проверка родителей позволила выявить у матери сбалансированные хромосомные перестройки в 4-й и 12-й хромосомах. Данный случай демонстрирует преимущества полногеномного подхода перед таргетным при проведении НИПС.

Муковисцидоз (МВ) -одно из наиболее распространенных моногенных заболеваний человека.Определение частоты мутаций моногенного заболевания для конкретных популяций позволяет оптимизировать ДНК-диагностику, сократив ее себестоимость и время проведения.В статье представлены результаты ретроспективного исследования гена CFTR у 191 ребенка со смешенной формой МВ.Для определения 24 наиболее распространенных мутаций CFTR использовали диагностическую ПЦР-панель, а минорные варианты выявляли методом высокопроизводительного секвенирования.С помощью диагностической панели в выборке выявлено 18 типичных мутаций гена CFTR: F508del (с аллельной частотой 54,7%), dele 2,3 (21kb) (7,3%), 2143delT (3,4%), 2184insA (3,4%), 1677delTA (2,4%), N1303K (2,1%), 3849+10kbC>T (2,1%), E92K (2,1%), G542X (1,6%), W1282X (1,6%), S1196X (1,3%), R334W (1,0%), 394delTT(0,8%), 3944delGT (0,8%), 3821delT (0,5%), 2789+5G>A (0,5%), 621+1G>T(0,3%), 2183AA>G (0,3%).В результате секвенирования обнаружено 24 генетических варианта CFTR с потенциальной клинической значимостью.Обнаружено 8 минорных вариантов CFTR, до этого не отмеченных у пациентов в РФ, в том числе 4 новых мутации гена CFTR -p.Glu819Ter, p.Gln378Ter, p.Val1360Phefs и p.Lys1365Argfs.Cystic fibrosis (CF) is one of the most common monogenic disorders of humans.The knowledge of population frequency of a mutant genotype causing a monogenic disease helps to optimize DNA testing and to reduce its costs and time required for the procedure.This article presents the results of a retrospective study of the CFTR gene in 191 children with mixed manifestations of CF.To screen for 24 most common mutations, we used the diagnostic PCR panel; minor mutations were detected by next generation sequencing.The diagnostic panel allowed us to identify 18 typical CFTR mutations, including F508del (allelic frequency of 54.7%), dele 2,3 (21kb) (7.3%), 2143delT (3.4%), 2184insA (3.4%), 1677delTA (2.4%), N1303K (2.1%), 3849+10kbC>T (2.1%), E92K (2.1%), G542X (1.6%), W1282X (1.6%), S1196X (1.3%), R334W (1.0%), 394delTT(0.8%),3944delGT (0.8%), 3821delT (0.5%), 2789+5G>A (0.5%), 621+1G>T(0.3%), and 2183AA>G (0.3%).Sequencing revealed the presence of 24 potentially pathogenic CFTR variants in the sample.We also discovered 8 minor CFTR variants previously unseen in Russian patients with CF, including 4 new CFTR mutations: p.Glu819Ter, p.Gln378Ter, p.Val1360Phefs, and p.Lys1365Argfs.

Неинвазивный пренатальный ДНК-скрининг (НИПС) анеуплоидий по крови матери применяется для выявления хромосомных анеуплоидий (ХА) с 2011 г.Многочисленные клинические исследования показали, что важным параметром при проведении

Staphylococcus epidermidis представитель нормальной микрофлоры человека, способный вызывать опасные заболевания у новорожденных с очень низкой и экстремально низкой массой тела при рождении. Различные штаммы S. epidermidis обладают разным спектром генов, ассоциированных с их резистентностью к антимикробным препаратам и патогенностью. По результатам анализа данных полных геномных секвенирований четырнадцати штаммов S. epidermidis изучено генетическое разнообразие штаммов, циркулирующих в отделении реанимации и интенсивной терапии новорожденных НЦАГиП им. В. И. Кулакова. Выявлена принадлежность штаммов к восьми сиквенс-типам, из которых чаще встречались ST2 и ST59, принадлежащие к единому клональному комплексу СС2. К данному клональному комплексу относились 10 из 14 штаммов. Показано, что изученные штаммы обладали широким спектром генов резистентности к антимикробным препаратам. Обнаружено 15 различных генов, обуславливающих резистентность штаммов к аминогликозидам, бета-лактамным антибиотикам, фузидиевой кислоте, макролидам, линкозамидам, стрептограмину В, тетрациклину и триметоприму. Выявлены гены, ассоциированные с патогенностью (аае, atlE, аар, embp), встречающиеся в геномах изученных штаммов с разной частотой. В геномах девяти штаммов был обнаружен инсерционный элемент IS256, а в геномах семи штаммов гены iса-оперона, отвечающего за синтез белков матрикса биопленок.

Статья продолжает цикл работ, посвященных определению частоты носительства в российской популяции мутаций, ассоциированных с развитием распространенных моногенных заболеваний. Целью исследования было установление частоты распространенных в российской популяции мутаций в генах GJB2 и GALT у доноров первичной кроводачи. При генотипировании 1000 доноров первичной кроводачи, идентифицирующих себя как русских и постоянно проживающих на территории Российской Федерации, обнаружены 37 носителей мутаций в гене GJB2, ассоциированных с развитием нейросенсорной тугоухости (частота в выборке составила 3,7 %, или 1 : 27), и 6 носителей мутаций в гене GALT, ассоциированных с развитием галактоземии (частота в выборке 0,6 %, или 1 :167). Выявлен 1 случай сочетанного носительства мутаций, и, таким образом, всего обнаружены 42 носителя мутаций в генах GJB2 и GALT (частота в выборке 4,2 %, или 1 : 24).

Статья продолжает цикл работ, посвященных определению частоты носительства в российской популяции мутаций, ассоциированных с развитием распространенных моногенных заболеваний. Целью исследования было установление частоты распространенных в российской популяции мутаций в генах GJB2 и GALT у доноров первичной кроводачи. При генотипировании 1000 доноров первичной кроводачи, идентифицирующих себя как русских и постоянно проживающих на территории Российской Федерации, обнаружены 37 носителей мутаций в гене GJB2, ассоциированных с развитием нейросенсорной тугоухости (частота в выборке составила 3,7 %, или 1 : 27), и 6 носителей мутаций в гене GALT, ассоциированных с развитием галактоземии (частота в выборке 0,6 %, или 1 :167). Выявлен 1 случай сочетанного носительства мутаций, и, таким образом, всего обнаружены 42 носителя мутаций в генах GJB2 и GALT (частота в выборке 4,2 %, или 1 : 24).

The aim of the study was to improve approaches to the use of Rh0(D) immune globulin in pregnant women with Rh-negative blood by introducing noninvasive method of determination of fetal rhesus blood factor by mother’s blood into curation program of pregnancy at risk of RBC sensitization. The accuracy of noninvasive method of rhesus genotyping in 204 pregnant women with Rh negative blood in 14-27 weeks of pregnancy was 99.0%. The determination of fetal rhesus allows personify implementation of immunological prophylaxis in Rh negative pregnant women.

The objective of the study was to define treatment strategy in cases of facial bones bisphosphonate induced osteonecrosis based on the study of the role of conditionally pathogenic oral microorganisms. Three typical clinical cases of bisphosphonate osteonecrosis of the facial bones were analyzed and 15 conditionally pathogenic oral microorganisms were identified in these patients using real-time PCR in saliva, wound and bone samples. A comparative analysis was carried out with purulent-inflammatory diseases of maxillofacial area. The study results proved an important role of conditionally pathogenic microorganisms of the oral cavity in the development of osteonecrosis of the facial bones. Wide range of bacterial species was identified in osteonecrosis of the facial bones patients. While bone tissue is most exposed to microbial communities, surgical treatment results in effective rehabilitation for a long period.