为明确分离自黑龙江省克山县马铃薯上的2个病毒分离物KS4和KS7的分类地位,通过RTPCR扩增、克隆获得其基因组序列,利用重组分析程序包和最大似然法分别进行重组分析和系统发育分析.结果 显示,分离物KS4和KS7的开放阅读框均有9 186个核苷酸,编码3 061个氨基酸,分离物KS4的核苷酸和氨基酸序列均与马铃薯Y病毒(potato virus Y,PVY)分离物Mb112一致率最高,分别为96.9％和98.4％;分离物KS7的核苷酸序列与PVY分离物12-94一致率最高,为97.4％,其氨基酸序列与PVY分离物SYR-Ⅱ-Bel一致率最高,为97.8％.重组分析表明,分离物KS4和KS7均为分离物N-605和Oz的重组体,其中KS4基因组5'-端的2 392个核苷酸来自分离物N-605,其余核苷酸来自分离物Oz;KS7基因组的第800～2 227个核苷酸和第5 637～8 950个核苷酸来自分离物N-605,其余核苷酸来自分离物Oz.系统发育分析发现,分离物KS4被聚类到N∶O株系(PVYN∶O),分离物KS7被聚类到NTN株系(PVYNTN)b型.

为明确黑龙江烟区烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)分子株系和进化特征,从哈尔滨和牡丹江感病烟草采集到HEB1、HEB2和MDJ三个样品,通过RT-PCR扩增了其全基因组序列,并进行了一致率、重组、系统发育和选择压力等分析.结果表明,3个分离物全长均为6395核苷酸(GenBank登录号分别为MH595919、MH595920和MH595921).HEB1和MDJ与辽宁分离物Beipiao (HE818412)一致率最高,分别为98.9％和99.6％;HEB2与云南分离物Chuxiong1 (HE818417)一致率最高,为97.1％.HEB1是MDJ和HEB2的重组体.在根据全基因组序列构建的系统进化树中,TMV分为3个组,其中HEB1和MDJ均属Ⅰ (U1)组,HEB2属Ⅱ(Rakkyo)组.TMV的4个基因均处于负选择,其中衣壳蛋白基因的选择压力最大.

为明确黑龙江烟区马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)分子株系和进化特征,从哈尔滨和牡丹江感病烟草采集到Harbin和MDJ两个样品,通过RT-PCR扩增了其全基因组序列,并进行了一致率、重组、系统发育和选择压力等分析.结果表明,2个分离物(GenBank登录号分别为MH933741和MH933742)基因组全长均为9699核苷酸.Harbin与MDJ和比利时分离物GBVC 26(JQ969039)一致率最高,为98.5％;MDJ与Harbin和GBVC 26一致率最高,为98.5％.Harbin是美国分离物Oz和瑞士分离物N-605的重组体,MDJ是美国分离物CW和N-605的重组体.利用全基因组序列构建的系统进化树显示,PVY分离物分为9个组,Harbin和MDJ均属PVYN-Wi组.PVY的11个基因均处于负选择,其中NIa蛋白基因的选择压力最大.