小麦花叶病毒(wheat mosaic virus,WMoV)是严重危害小麦、玉米等禾本科作物的种传病毒,在我国尚无发生,具有重要检疫意义.本研究利用引物WMoV-283F/R全国首次检测出玉米种子中的WMoV,成功扩增出了两个不同典型毒株NP序列,并分析其序列特征.根据WMoV-RNA3、WMoV-RNA3A和WMoV-RNA3B序列特点设计特异性引物,经RT-PCR扩增玉米种子样品2211-2和8044-10的RNA,扩增产物测序得到283 bp基因序列,分别与WMoV分离物GG1-RNA3B(GenBank登录号KT988872.1)、WMoV分离物K1-RNA 3(GenBank登录号KT988889.1)同源性为96.11%、96.47%.设计引物分别扩增玉米种子样品2211-2和8044-10的RNA核衣壳全长序列,得到WMoV-Germany RNA3、WMoV-Malaysia RNA3A和WMoV-Malaysia RNA3B全长序列.使用MEGA6软件采用Maximum likelihood法建立系统发育树,它们分别属于3个同源性差异明显的簇.通过DNAMAN序列比对分析三者的关系,RNA3序列在标尺碱基位点220~506区域序列差异性最大,而序列700~892、972~1102区段则相对保守.这为检测引物的设计提供了重要参考.WMoV的首次截获并鉴定为该病毒的检测鉴定和致病机理研究提供依据.
葡萄是上海地区重要的经济水果,为探明上海葡萄种植园中昆虫种群组成,本研究在2017-2018年间,通过搜捕法、马氏网诱集法和黄色粘纸诱集法,对上海市嘉定区、奉贤区、青浦区、浦东新区、崇明岛进行了昆虫种群调查,共采集并鉴定昆虫7目65科123属182种,明确了上海地区葡萄种植园内主要害虫、天敌昆虫及环境昆虫的种类,并对上海葡萄园的昆虫种群结构和多样性进行了分析.
外来生物入侵是导致原生物种衰竭、物种多样性减少和遗传多样性丧失的重要原因.其中,有不少外来物种主要通过船只压舱水和随船木制包装箱携带这两种方式入侵新的环境.为了明确抵达我国的外来生物与海运船舶进港次数是否有关联,本文采用了 Stata 15软件,选取126个与我国有贸易往来的国家,以2007年一2017年到达我国各港口并被截获出有害生物的船舶进港次数为研究对象,先证明了截获有害生物的船舶进港次数与我国的进口贸易量呈线性正相关,再以贸易引力模型为基本模型,将船舶所属的贸易国与我国每年的人口数量、国民生产总值(GDP)、地理距离、当年的汇率、是否有共同语言、是否相邻、是否是沿海国家等因素作为变量因子,建立模型并进行相关统计分析,阐明了两国间的"汇率"因素,在一定程度上能够十分显著地负向影响由海运产生的生物入侵发生频次和入侵的风险.其结果可为今后由海运产生的生物入侵预测和管理提供参考依据.
国际贸易所带来的外来生物入侵已经成为各个国家面临的重要问题,对其进行风险评估迫在眉睫.为了能够对跨国运输带来的生物入侵风险进行量化评估,我们以联合国粮食及农业组织(FAO)的国际贸易、WorldClim的环境气候因子、全球生物多样性信息网络(GBIF)的物种分布和国内交通运输等数据为基础,以R语言为主要计算工具,建立综合分析外来生物入侵风险的评估方法.以苹果蠹蛾Cydia pomonella和番茄潜叶蛾Tuta absoluta为例计算其引入风险和定殖可能性,综合量化评估国际贸易带来的物种入侵风险.借此结果对国际进口贸易从入侵风险角度有针对性地提出合理建议.
为实现我国非重要的检疫性杂草——苍耳属Xanthium杂草快速高效的分子鉴定,利用Illu-mina二代测序平台对白苍耳X.albinum、意大利苍耳X.italicum、直刺苍耳X.ripicola、刺苍耳X.spinosum、柱果苍耳X.cylindricum、宾州苍耳X.pennsylvanicum、蝟实苍耳X.echinatum、苍耳X.si-biricum和北美苍耳X.strumarium共9种苍耳属杂草进行转录组测序,获得的unigene序列数分别为103362、93506、87452、83822、70994、66397、57598、57164和57134个.利用生物信息分析方法对9种苍耳属杂草转录组进行简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)和物种间的特异性序列预测和筛选.经过PCR试验验证,筛选获得了可以有效鉴定上述9种杂草的6对SSR引物和13对特异性引物,提高了苍耳属杂草鉴定的准确率.
澳柏松小吉丁为一种广泛分布于澳大利亚的林木害虫,寄主为柏科的澳柏属及柏木属植物.近期上海口岸多次从澳大利亚进境原木中截获澳柏松小吉丁.其寄主柏木属植物在我国分布范围广,该种在我国未有分布,具潜在入侵风险,应得到各口岸重视,警惕该种入侵.本文对其形态特征、生物学特性及入侵风险等内容进行了综述,为澳柏松小吉丁的识别提供参考.
随着我国进出口贸易的扩大,杂草等有害生物传入我国的风险也大大增加,海关部门从进境货物中截获到大量杂草,其中以苍耳属植物的截获量最大.本文系统分析了2003-2017年我国海关部门截获苍耳种类的情况:全国进境货物中共截获苍耳属杂草28种,70 269种次,其中检疫性苍耳26种,56 888种次;美国、澳大利亚和巴西是截获苍耳种类最多的3个来源国,占截获总数的69%;截获苍耳种类最多的货物是大豆和羊毛.另外,本文归纳整理了苍耳属的常见分类学说和研究现状,为口岸提供检疫鉴定苍耳属植物的理论支撑.本文也对进境货物检疫查验和后续监管提出管理建议.
虫道真菌菌株分离和鉴定难度大,口岸检出率低.随着口岸进境原木数量的不断增加,食菌小蠹传播扩散虫道真菌所带来的潜在风险越来越引起重视.本文针对进境原木中截获的重要食菌小蠹种类,从疑似样本采集、培养基选择和制备、虫道真菌的分离及菌种保存等方面对虫道真菌分离培养方法进行了介绍,以期增强检疫人员对食菌小蠹和虫道真菌的分离水平,提高口岸对虫道真菌疫情的截获率.
[目的]瓜实蝇是世界性检疫害虫,被列入我国口岸常年监测计划中.本研究以检疫性有害生物瓜实蝇为研究对象,利用不同地理种群瓜实蝇的转录组发现特异性的微卫星(simple sequence repeats,SSR)序列,分析我国口岸监测的瓜实蝇样本的遗传多样性.[方法]利用生物信息学方法,对4个不同地理来源的瓜实蝇转录组进行分析,发现了特异性的SSR序列,并设计特异性引物,选用我国11个省市的49个瓜实蝇监测样本进行测试及验证,使用NTsys和Popgene 32软件进行遗传多样性分析.[结果]筛选出15对多态性较好的引物,UPGMA聚类分析显示,新疆、四川和广西种群归为一支,浙江、广东、江苏种群归为一支,上海、云南、海南、天津种群归为一支,北京种群单独聚为一支.[结论]聚类分析结果显示,11个不同省市的瓜实蝇监测样本间基因分化系数为0.6712,表明不同口岸的瓜实蝇监测样本间的遗传分化较大,可能具有不同的来源地,可为进一步开发监测样本溯源技术提供理论依据.