Актуальность. Сахарный диабет типа 1 (ранее называемый ювенильным или инсулинозависимым) характеризуется тем, что продукция инсулина отсутствует вследствие аутоиммунной деструкции клеток поджелудочной железы, вероятно, вызванной действием факторов внешней среды на фоне генетической предрасположенности, которая проявляется в наличии функциональных однонуклеотидных замен (SNP) в генах цитокинов, ответственных за воспаление. Считается, что при длительном хроническом воспалении происходит необратимое разрушение β-клеток поджелудочной железы, и при наличии функциональных полиморфных маркёров в генах воспаления, таких как ген интерлейкин β (IL6), возможна манифестация болезни с последующей прогрессией и развитием осложнений. Цель исследования - изучение частоты распределения аллелей и генотипов ряда полиморфных маркёров гена IL6 при СД типа 1 у жителей Москвы и Московской области. Методика. В настоящую работу включено 366 больных СД типа 1 и 526 здоровых индивидов. Группу больных составили пациенты с наличием сахарного диабета типа 1 различной манифестации с общей медианой возраста 41±5 лет. Обе группы выравнены по полу и возрасту. Определение генотипов полиморфных маркёров rs1800795, rs1800796, rs1800797 и rs1554606 гена IL6 проводилось с помощью ПЦР «в реальном времени» на амплификаторе «Real-time CFX96 Touch» (Bio-Rad, США) с использованием готовой смеси для ПЦР qPCRmix-HS (Евроген, Россия) и уникальных праймеров и зондов. Результаты. В результате исследования выявлена статистически значимая ассоциация полиморфного маркёра rs1800795 гена IL6 с повышенным риском развития СД1 (χ2=9,48, OR=1,35, CI95%=1,11-1.64, р=0,0088). Заключение. Полученные результаты дополняют информацию о механизмах возникновения и патогенезе СД типа 1. Внедрение в практику анализа полиморфных вариантов гена IL6, позволит выявить вероятность развития этой болезни и/или её прогрессирование у пациентов с аутоиммунными заболеваниями или у лиц, находящихся в группе риска. Background. Type 1 diabetes mellitus (T1DM), previously called juvenile or insulin-dependent diabetes, is characterized by lack of insulin production due to autoimmune destruction of pancreatic cells. This destruction may be caused by environmental factors. These factors contribute to inflammation in the presence of genetic predisposition due functional single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the cytokine genes. It is supposed that during prolonged chronic inflammation, irreversible destruction of all pancreatic b-cells occurs. In the presence of functional, polymorphic markers in inflammatory genes, such as the interleukin 6 (IL6) gene, the manifestation and progression of T1DM is possible, followed by complications. Aim. The aim of the present study was to define the frequency distribution of allelic variants and genotypes in a number of polymorphic markers of the IL6 gene in patients with T1DM residing in Moscow and the Moscow Region. Methods. The present study included 366 patients with T1DM and 526 healthy individuals. The T1DM group consisted of native Russian patients with T1DM of various manifestations and with a median age of 41 ± 5 yrs. The groups were gender- and age- matched. Genotypes of polymorphic markers rs1800795, rs1800796, rs1800797, and rs1554606 of the IL6 gene were determined using real-time PCR on a Real-time CFX96 Touch amplifier (Bio-Rad, USA) using qPCRmix-HS ready-mixed PCR kits (Eurogen, Russia) and unique primers and probes. Results. Our study revealed a statistically significant association of the polymorphic marker rs1800795 of the IL6 gene with an increased risk of developing T1DM (χ2=9.48, OR=1.35, CI95%=1.11-1.64, р=0.0088). Conclusion. Our results complement present information on the origin, mechanisms, and pathogenesis of T1DM. By implementing the analysis of polymorphic variants of IL6 gene in clinical practice, it will be possible to identify the probability of developing T1DM and/or its progression in patients with autoimmune diseases or in people at risk.
Сахарный диабет типа 1 (СД1) представляет собой многофакторное заболевание, которое характеризуется аутоиммунной природой. Важным фактором в патогенезе СД1 является генетическая предрасположенность, характеризующаяся наличием функциональных однонуклеотидных замен (SNP) в генах цитокинов, ответственных за воспаление. Предполагают, что длительное хроническое воспаление приводит к необратимому разрушению β-клеток поджелудочной железы и может быть объяснено наличием функциональных полиморфных маркеров в генах-антагонистах. Цель исследования - изучение частоты аллельных вариантов ряда полиморфных маркеров гена IL10 при СД1 у жителей Москвы и Московской области. Методика. В работу включено 366 больных СД 1 типа и 526 здоровых индивидов русского происхождения. Группу больных составили пациенты с наличием сахарного диабета 1 типа различной манифестации с общей медианой 41±5 лет. Обе группы выравнены по полу и возрасту. Определение генотипов полиморфных маркеров rs1800896, rs1800872 и rs3024505 гена IL10 проводилось с помощью ПЦР «в реальном времени» на амплификаторе «Real-time CFX96 Touch» (Bio-Rad, США) с использованием готовой смеси для ПЦР qPCRmix-HS (Евроген, Россия) и уникальных праймеров и зондов. Результаты. В результате проведенного исследования выявлена статистически значимая ассоциация полиморфного маркера rs1800896 гена IL10 с повышенным риском развития СД1 (χ2=15.52, OR=1.48, CI95%=1.23-1.79, р=0,0004). Заключение. Полученные результаты дополняют информацию о механизмах возникновения СД типа 1. Внедрение в практику анализа полиморфных вариантов гена IL10 позволит выявить предрасположенность к развитию этого заболевания, его прогрессированию у пациентов с аутоиммунными заболеваниями и у лиц, находящихся в группе риска. Type 1 diabetes mellitus (T1DM) is a multifactorial disease of an autoimmune origin. An important factor in the pathogenesis of T1DM is genetic predisposition characterized by the presence of functional single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in the cytokine genes contributing to inflammation. Long-standing, chronic inflammation is considered to result in irreversible destruction of all pancreatic b-cells and may be due to the presence of functional polymorphic markers in genes of inflammation antagonists, such as the interleukin 10 (IL10) gene. Aim. The aim of this study was to determine the frequency of allelic variants in a number of IL10 gene polymorphic markers in residents of Moscow and the Moscow Region with T1DM. Methods. The study includes 366 patients with T1DM with different manifestations and a median duration of 41+5 years and 526 healthy individuals. The groups were gender- and age-matched. Genotypes of the rs1800896, rs1800872, and rs3024505 polymorphic markers of the IL10 gene were determined with real-time PCR on a Real-Time CFX96 Touch amplifier (Bio-Rad, USA) with a qPCRmix-HS ready-mixed PCR kit (Eurogen, Russia) and unique primers and probes. Results. The rs1800896 polymorphic marker of the IL10 gene statistically significantly correlated with increased risk of T1DM (χ2=15.52, OR=1.48, CI95%=1.23-1.79, р=0.0004). Conclusion. The study results complement the information about T1DM mechanisms of origin and pathogenesis. Implementation in practice of the methods for analyzing polymorphic variants of the IL10 gene will allow revealing a predisposition to this disease and/or its progression in patients with autoimmune diseases or in people at risk.
Introduction. Genetic susceptibility to Type 2 Diabetes (T2D) with a complex mode of inheritance is explained by the presence of multiple gene, each conferring a small moderate contribution the overall risk, as well as by alternative combinations of genes. Due to the success of Genome-Wide Association Study there has been rapid increase in the availability of genetic data for T2D. This allows the collection of large sets of genetic polymorphic loci, which could be key in the understanding of the genetic basis of T2D.The aim of this study was to determine alleles and allelic combinations that are associated with T2D phenotype.Methods. We assessed the associations of 96 single nucleotide polymorphisms (SNPs) linked with T2D different pathway components and carbohydrate metabolism abnormalities in 96 Russian patients and 96 normoglycemic controls using Illumina Golden Gate Genotyping Assay (low density DNA chip with 96 SNPs). T2D was defined according to the World Health Organization criteria, 1999. Data were analyzed with the free online statistical program named “Calculator for confidence intervals of odds ratio” (www.gen-exp.ru/calculator_or.php) and APSampler software (https://code.google.com/p/apsampler) for multi-locus association analysis.Results. On the first stage of the study we detected ten SNPs that can be independently contributing to T2D risk in the Russian cohort, they are rs8050136 (p=0,05) and rs11642841 (p=0,04) in FTO gene, rs2943641 (p=0,02) and rs2943634 (p=0,03) in IRS1 gene, rs571312 in MC4R gene, rs1470579 (p=0,04) in IGF2BP2 gene, rs163184(p=0,03) in KCNQ1 gene, rs11924032 (p=0,04) in SLC2A2 gene, rs11634397 (p=0,03) in ZFAND6 gene, rs7172432(p=0,04) in C2CD4A gene. On the second stage we found a biallelic combination of A allele rs8050136 in FTO gene and A allele rs7172432 in C2CD4R gene that was associated with T2D risk. Remarkable, the combined effect (association) of rs8050136 and rs7172432 was stronger (OR=1,97; p=0.006) than that of each SNP alone.Conclusion. The biallelic combination of A allele rs8050136 in FTO gene and A allele rs7172432 in C2CD4R gene can be used as a genetic marker of T2D.
Цель. Изучить кумулятивный эффект носительства сочетаний двух и более полиморфных генетических маркеров, ассоциированных с сахарным диабетом 2-го типа (СД2) в русской популяции Тюменской области. Материалы и методы. В исследование включены 192 неродственных испытуемых женского (n=120) и мужского (n=72) пола, из которых 96 участников имели СД2, а 96 здоровых индивидов составляли группу контроля. Постановку клинического диагноза СД2 проводили согласно критериям ВОЗ (1999). Генотипирование полиморфных маркеров выполнено по протоколу Bead Сhip Golden Gate с использованием синтезированного ДНК-биочипа (IlluminaInc, США), содержащего 96 однонуклеотидных полиморфизмов, ассоциированных в СД2, нарушениями углеводного и липидного обмена, артериальной гипертонией в европейских и азиатских популяциях. Статистический анализ данных проводился с помощью online программы «Калькулятор для расчета статистики в исследованиях "случай-контроль" ( http://gen-exp.ru/calculator_or.php ) и оригинального программного обеспечения APSampler (http://code.google.com/p/apsampler/), использующее метод Монте-Карло марковскими цепями и байесовскую непараметрическую статистику. Результаты. В ходе анализа ассоциаций исследуемой группы генетических маркеров установлена ассоциация с развитием СД2 полиморфных маркеров rs8050136 (p=0,05) и rs11642841 (p=0,04) гена FTO , rs571312 (p=0,002) гена MC4 R , rs1470579 (p=0,04) гена IGF2 BP2 , rs2943641 (р=0,03) и rs2943634 (p=0,03) гена IRS1 , rs163184 (p=0,03) гена KCNQ1 , rs11924032 (p=0,04) гена SLC2 A2 , rs11634397 (p=0,03) гена ZFAND6 , rs7172432 (p=0,04) гена C2 CD4 A с СД2 в русской популяции Тюменской области. Далее с помощью программного обеспечения APSampler, основанного на динамическом методе Монте-Карло, выполнен комплексный анализ кумулятивного эффекта носительства сочетаний двух и более рисковых генетических маркеров на формирование СД2. Установлена ассоциация с СД2 сочетания аллелей A маркера rs11642841 гена FTO и аллеля A маркера rs7172432 гена C2CD4A в русской популяции Тюменской области (OR=1,97; p=0,006). При этом выявленное сочетание соответствуют критерию минимального множества аллелей, и данную комбинацию можно отнести к дополнительным значимым маркерам генетического риска СД2. Заключение. Носительство комбинации аллеля А полиморфного маркера rs8050136 гена FTO и аллеля А полиморфного маркера rs7172432 гена C2CD4A в русской популяции Тюменской области ассоциировано с повышенным риском развития СД2.
Background. Chronic kidney disease is one of the most serious diabetic complications, which end-stage leads to a dramatic decline of renal function and needs for renal replacement therapy. Due to the progressive nature of CKD and the limited efficacy of treatment for advanced stages the prediction of risks and diagnostics on preclinical stage are of great importance. All of the above determines the high relevance of search for genetic markers predict the chronic kidney disease (CKD) development.The aim of our study was to investigate association between polymorphic marker (PM) of gene involved in insulin secretion with development of CKD in type 2 diabetic (T2D) patients. Polymorphism of KCNJ11 gene is associated with different phenotypes of glycemic disorders: neonatal diabetes, hyperinsulinemia, reduced insulin secretion and increased risk of type 2 diabetes. This gene coding Kir6.2 subunit of ATP-dependent potassium channels. The pathogenesis of it’s involvement in renal damage development referred to the fact that this type of potassium channels found not only in the beta- cells, but also in smooth muscle cells of blood vessels, and therefore might have an effect on risk of vascular complications, including CKD.Materials and methods. We enrolled 444 T2D patients. PM rs5219 in KCNJ11 gene was analysed among patients divided in 2 groups: with and without CKD (n=123/321) based on glomerular filtration rate (GFR) < and ≥ 60 ml/min/1,73m2 calculated by MDRD formula. PM studied using PCR. Differences in alleles/genotypes frequencies were assessed by χ² and odds ratio (OR) were calculated. The study was approved by local ethical committee; informed concern was obtained from all the patients.Results. We studied the main clinical parameters: age, HbA1c, serum levels of cholesterol and triglycerides, BP between the groups. We observed significant differences in alleles/genotypes distribution of rs5219 in KCNJ11 gene between groups with and without CKD: the prevalence of allele C and genotype CC in patients without CKD: OR=0,53, 95%CI: 0,40-0,72 and OR=0,46, 95%CI: 0,27-0,79, respectively; while allele T and genotype TT did as risk factors: χ²=17,33; р=0,0002; OR=1,87, 95%CI: 1,39-2,53; genotype TT OR=2,39, 95%CI: 1,52-3,76.Conclusions. We conclude that T2D patients might have genetic susceptibility to CKD development caused by polymorphism rs5219 of KCNJ11 gene with protective role of allele C and genotype CC and risk allelе/genotype is T/TT.
Цель: исследовать ассоциации клинических, гормональных и молекулярно-генетических факторов у женщин с ожирением в различные периоды жизни, включая неонатальный, пубертатный, гестационный и репродуктивный, для выявления закономерностей формирования метаболического синдрома (МС). Материалы и методы: за период с 2006 по 2013 гг. всего обследовано 2181 человек с использованием метода кросс-секционного многовыборочного исследования. Проведено проспективное исследование парных выборок «беременная–новорождённый», в которое методом случайных чисел включены 463 женщины, средний возраст 26,0 [22,0; 30,0] лет; одномоментное исследование 718 девочек-подростков от 12 до 18 лет, средний возраст 15,0 [13,0;17,0] лет; одномоментное исследование 537 женщин русской популяции от 18 до 45 лет, средний возраст 33,0 [28,0; 37,0] лет. Осуществлены общеклиническое обследование, измерение антропометрических параметров и АД, определение ИМТ. Проведен биохимический и иммуноферментный анализ с определением основных и дополнительных компонентов МС. Идентификация аллелей полиморфных маркеров генов-кандидатов инсулинорезистентности и инсулинопении проведена с использованием полимеразной цепной реакции. Исследовали полиморфные маркеры rs16928751 гена ADIPOR2, rs1501299 гена ADIPOQ, rs7903146 гена TCF7L2, rs7756992 гена CDKAL1. Статистический анализ проведен с применением пакета программ Statistica 10. Статистически достоверными учитывались различия при уровне p<0,05. Результаты: избыток массы тела с детского/подросткового возраста значительно повышает риск формирования МС у женщин (OR=44,6, р<0,001) и связан с полиморфным маркером rs7903146 гена TCF7L2 (р<0,001). Ранний возраст менархе ассоциирован с гиперлептинемией, гипоадипонектинемией и развитием ожирения (OR=2,7, р<0,001) и МС (OR=3,2, р<0,001) у женщин в репродуктивном периоде. С ранним менархе связаны полиморфные маркеры rs16928751 гена ADIPOR2 , rs1501299 гена ADIPOQ, rs7903146 гена TCF7L2. Чрезмерное увеличение массы тела в гестационном периоде чаще регистрировалось у женщин с ожирением (OR=5,4, р<0,001), повышая риск развития МС (OR=8,6, р<0,001). При ожирении 1 степени риск рождения плода с макросомией повышается в 6,8 раза (р<0,001). Макросомия имеет отдаленные последствия, в 3,1 раза повышая риск развития МС у женщин (р<0,001). Микросомия плода при рождении ассоциирована с полиморфным маркером rs7756992 гена CDKAL1 (OR=4,98, p=0,03). Выводы: сформирован комплекс клинических факторов связанных с развитием метаболических осложнений у женщин с ожирением, включающий избыточную массу тела с детского/подросткового возраста ранний возраст менархе, чрезмерную патологическую прибавку веса в гестационный период и макросомию при рождении для ранней персонифицированной диагностики и профилактики.
Цель. Изучить ассоциации полиморфных генетических маркеров rs1470579, rs4402960 гена белка 2, связывающего инсулиноподобный фактор роста-2 ( IGF2BP2 ), с сахарным диабетом 2-го типа (СД2) в русской популяции Тюменской области. Материалы и методы. В исследование при добровольном информированном согласии включены 96 пациентов с СД2 и 96 здоровых индивидов – всего 192 неродственных участника. Клинический диагноз СД2 устанавливался согласно критериям ВОЗ (1999). Генотипирование образцов ДНК 192 участников исследования проведено по протоколу Bead Сhip Golden Gate с использованием ДНК-биочипа (Illumina Inc, США). Отношение шансов (OR) вычислялось с помощью онлайн программы «Калькулятор для расчета статистики в исследованиях «случай-контроль» ( http://gen-exp.ru/calculator_or.php ). Результаты . Расчет отношения шансов позволил выявить ассоциации с СД2 полиморфного маркера rs1470579 гена IGF2BP2 , впервые исследованного в русской популяции. Представленный ген IGF2BP2 кодирует белок 2, связывающий инсулиноподобный фактор роста-2 – один из трех агентов, регулирующих трансляцию инсулиноподобного фактора роста-2 (ИФР-2). ИФР-2 – член семейства инсулиноподобных факторов роста, регулирующих рост плода и потенцирующих действие инсулина. Установлено, что с повышенным риском развития СД2 в русской популяции Тюменской области ассоциирован аллель C (OR=1,59 [1,01-2,48]; р=0,04) маркера rs1470579 гена IGF2BP2 . Со снижением риска СД2 связан аллель А (OR=0,63 [0,40-0,99]; р=0,04) маркера rs1470579 гена IGF2BP2 . Статистически значимых ассоциаций полиморфного маркера rs4402960 с СД2 не выявлено. Заключение . Полиморфный маркер rs1470579 гена IGF2BP2 ассоциирован с сахарным диабетом 2-го типа в русской популяции Тюменской области.
Цель представленного исследования – изучение ассоциации полиморфных маркеров G (-308)A гена TNF и Thr26Asn гена LTA с частотой развития неблагоприятных исходов у больных, перенесших обострение ишемической болезни сердца.Материалы и методы. В исследование были включены 1145 больных, госпитализированных в кардиологические стационары г.г. Москвы, Санкт-Петербурга, Казани, Челябинска, Перми, Ставрополя и Ростова-на-Дону в связи с обострением ишемической болезни сердца. Максимальный срок наблюдения – 62,5 месяца. Идентификацию аллелей полиморфных маркеров проводили с помощью гибридизационно-флуоресцентного анализа при амплификации в реальном времени. Результаты. В случае полиморфного маркера Thr26Asn гена LTA ассоциации с частотой развития неблагоприятных исходов у больных, перенесших обострение ишемической болезни сердца, обнаружено не было. Однако в случае полиморфного маркера G(-308)A гена TNF была обнаружена выраженная ассоциация. У носителей генотипов GA и AA по сравнению с носителями генотипа GG чаще наблюдался неблагоприятный исход. Время дожития до конечной точки у носителей генотипов GA и AA составило 43,30 месяцев (95% CI = 40,04 - 46,56) против 49,6 месяцев (95% CI = 47,38 - 51,82) у носителей генотипа GG (χ2 = 15,4; р < 0,001). Полученные нами данные позволяют сделать вывод о том, что полиморфный маркер G(-308)A гена TNF ассоциирован с наследственной предрасположенностью к развитию неблагоприятных исходов у больных, перенесших обострение ишемической болезни сердца.
Aims. In order to study type 1 diabetes mellitus associations, we conducted a comparative analysis of allele and genotype frequency distribution of polymorphic markers rs41295061 and rs11594656 of IL2RA gene, which encodes -chain of interleukin-2 receptor, and rs2069762, a marker of IL2, gene, encoding interleukin-2. Materials and methods. Experimental group included 451 patients with type 1 diabetes mellitus (DM); control group consisted of 306 healthy subjects (both groups were represented by ethnic Russians). Alleles and polymorphic markers were identified by real-time amplification method. Results. A comparative analysis of patients with type 1 DM and healthy control group did not show statistically significant differences from the viewpoint of allele and genotype frequency distribution of polymorphic markers rs41295061, rs11594656 and rs2069762. This makes Russian patients considerably different from European ones where markers in question show substantial association with type 1 DM. Conclusion. A comparative analysis of allele and genotype frequency distribution of IL2-RA and IL2 genes polymorphic markers showed population differences in association of these markers in Russian and European patients.
Materials and methods. HLA genotyping was accomplished in 51 DM1 patients and 51 volunteers randomly selected from the indigenous population of Yakutia (Yakuts in three successive generations). Another 205 DM1 patients and 300 healthy subjects comprised random samples of patients and controls respectively from residents of Moscow and Moscow region. Results. HLA DRB1*17(03) allele proved to be the strongest one predisposing to DM1 in the Yakutian population (relative risk, RR=8,47) and DQB1*0304 in the Moscow population (RR=8,94). The presence of DRB1*04, DRB1*17(03), DQA1*0301, DQB1*0201, and DQB1*0302 accounted for RR >2 in both populations. Only two alleles, DRB1*04 and DRB17(03), in the Yakutian population and five of the six (DRB1*04, DRB1*17(03), DQA1*(0301), DQB1*0302, and DQB1*0304) in the Moscow one were closely associated with DM1 (RR >4). DRB1*09, DRB1*11, DQB1*13, DQB1*0602/8 in Yakutian and DRB1*11, DRB1*13, DQA1*0103, DQB1*0301, DQB1*0602/8 in Moscow populations had the highest protective potential (RR