در این تحقیق از اطلاعات تلفات مربوط به 6426 رأس بره حاصل از آمیزش 223 رأس قوچ و 1769 رأس میش در سال های 1370 تا 1394 در گله ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند نژاد قره‌گل سرخس، استفاده شد. صفت مورد بررسی، میزان زنده‌مانی تجمعی ماهیانه بره‌ها از زمان تولد تا پایان سن یک‌سالگی بود. برای تعیین توزیع فراوانی علل تلفات و تابع توزیع زنده‌مانی به ترتیب از رویه‌های Freq و Lifetest برنامه آماری SAS استفاده شد. میزان تلفات بره‌ها از تولد تا یک‌سالگی 57/14 درصد بود. مهمترین دلایل تلفات به ترتیب شیرسوز شدن، بیماری‌های گوارشی و تنفسی بودند. میزان زنده‌مانی تجمعی بره‌ها از تولد تا سن یک‌سالگی 4/85 درصد برآورد شد. ضریب تابعیت میزان زنده‌مانی از سن بره نشان دهنده کاهش زنده‌مانی بره‌ها به میزان 037/0 درصد در هر روز تا سن یک‌سالگی بود. میزان مرگ و میر بره‌ها در سه ماهه اول، دوم، سوم و چهارم بعد از تولد به ترتیب 8/7، 06/4، 23/1 و 48/1 درصد بود. بیشترین تلفات بره‌ها به ترتیب در سنین یک، دو، شش و ده ماهگی آنها رخ داد. با توجه به بالاتر بودن میزان تلفات در سه ماهۀ اول حیات بره‌ها پیشنهاد می‌شود که در این بازه زمانی مدیریت بهتری از نظر نحوه نگهداری و تغذیه برای میش‌ها و بره‌ها اعمال گردد.

A Stochastic Simulation Study on Effect of Herd Size, Semen Type, Overlapping Generation and Breeding Goal on Genetic Gain in Holstein Dairy Cows

تب برفکی یک بیماری ویروسی بشدت واگیردار است که عمدتا دام‏های سم‏شکافته و حیوانات وحشی را متأثر می‏سازد. تب برفکی در ایران یک بیماری بومی محسوب شده که گاهی همه‏گیری‏های آن موجب خسارت‏ها و تلفات سنگین به خصوص در دام‏های جوان می‏شود. در این مطالعه، بیان mRNA ژن‏های سایتوکاینی IL-2 و IL-12 در خوکچه‏های هندی واکسینه شده با واکسن غیر فعال شده تب برفکی تیپ O (بدون استفاده از یاور) مورد بررسی قرار گرفت. نمونه‏های خون از سیاهرگ سافن 8 سر خوکچه هندی نر (در دو گروه شاهد و واکسینه) در روز‏های 7 و 28 پس از اولین واکسیناسیون گرفته شد. استخراج RNA کل از نمونه‏های خون با استفاده از کیت استخراج ستونی صورت گرفت و پس از آن طی واکنش نسخه‏برداری معکوس به cDNA تبدیل شد. سپس به منظور بررسی بیان ژن های IL-2 و IL-12از روش Real-time PCR نسبی استفاده شد. نتایج نشان داد بیان ژن IL-2 در حیوانات واکسینه شده نسبت به گروه شاهد در خونگیری‏های اول و دوم تفاوت معنی‏داری نداشت، ولی افزایش معنی‏داری در بیان ژن IL-12 مشاهده شد (P<0.05). از تغییر سطوح بیان ژن‏های سایتوکاینی می‏توان به عنوان شاخص‏هایی جهت ارزیابی اثرات واکسن‏های جدید بر سیستم ایمنی در مطالعات آینده استفاده نمود.

Investigation the Effect of a Threshold Trait Levels on the Accuracy of Breeding Value Estimations and Genetic, Phenotypic and in Breeding Trends in a Breeding Flock

در این مقاله، روشی برای تشخیص نوع گل و تخمین اندازه پوست بره‏های زندی با استفاده از الگوریتم‏های پردازش تصویر و شبکه عصبی مصنوعی ارائه شده است. داده مورد استفاده، از پوست‏های متعلق به کلکسیون پوست‏های زینتی مرکز پرورش گوسفند زندی تهران(خجیر) بدست آمد. ابتدا ابعاد و نوع گل های موجود روی پوست توسط ارزیاب‏های مجرب اندازه گیری شد. سپس با استفاده از دوربین دیجیتال، عکس‏های متعددی از هر یک از انواع گل و ابعاد پوست‏ها تهیه شد. ویژگی‏های مرتبط با کیفیت نوع گل و تخمین اندازه پوست بره‏ها از روی تصاویر دیجیتال و بوسیله ابزارهای پردازش تصویر نرم افزار متلب استخراج شد. دو شبکه عصبی مصنوعی مجزا برای دسته بندی گل‏ها و برآورد مساحت پوست طراحی گردید. شبکه عصبی طراحی شده برای تشخیص نوع گل بدون خطا آموزش دید و در مرحله آزمون نیز با دقت حدود %95، هفت نوع گل مختلف موجود روی پوست را تشخیص داد. اندازه پوست بره‏ها با دقت حدود %99 توسط شبکه عصبی دوم تخمین زده شد. همبستگی بین اندازه‏های برآورد شده از شبکه عصبی مصنوعی و ابعاد واقعی پوست‏ بره ها %15/97 و معنی دار بود(p

در انتخاب ژنومیک، صحت پیش بینی ارزش های اصلاحی در جمعیت تحت انتخاب اثر زیادی بر موفقیت این روش انتخاب دارد. تعداد و نوع حیوانات در جمعیت مرجعی که برای برآورد اثرات نشانگری از آن استفاده می شود از عوامل مؤثر بر صحت پیش بینی ها می باشند. ترکیب اطلاعات سایر جمعیت ها نیز بر صحت پیش بینی ها اثر داشته و می توان در جمعیت های کوچک برای افزایش کارایی انتخاب ژنومیک از آن استفاده کرد. در مطالعه حاضر به منظور بررسی عوامل مؤثر بر ایجاد جمعیت مرجع در انتخاب ژنومیک، گاوهای هلشتاین ایران شبیه سازی و اثر تعداد و نوع حیوانات جمعیت مرجع، میزان رابطه حیوانات این جمعیت با جمعیت تحت انتخاب و وارد کردن اطلاعات سایر جمعیت ها بر صحت پیش بینی ها بررسی شد. صحت پیش بینی ها با افزایش تعداد حیوانات نر در جمعیت مرجع به طور معنی داری افزایش یافت که این افزایش صحت با افزودن حیوانات ماده نیز به میزان کم‌تری مشاهده گردید و نشان دهنده رابطه مستقیم بین صحت پیش بینی ها و تعداد حیوانات جمعیت مرجع می باشد. هر چه از میزان رابطه خویشاوندی بین جمعیت مرجع با حیوانات تحت انتخاب کاسته شد، صحت پیش بینی ها نیز کاهش پیدا کرد که علاوه بر اینکه نشان دهنده اهمیت میزان رابطه خویشاوندی بین دو جمعیت مرجع و تحت انتخاب می باشد، لزوم تکرار برآورد اثرات نشانگری را در طول زمان نشان می دهد. ترکیب اطلاعات سایر جمعیت ها صحت را به میزان زیادی بهبود بخشید. در نتیجه می توان برای تشکیل جمعیت مرجع در ایران علاوه بر استفاده از گاوهای ماده در کنار گاوهای نر از اطلاعات سایر کشورها نیز بهره برد.

هدف از این تحقیق، ارزیابی هم‌خونی در گاوهای شیری با تغییر نوع آمیزش، شدت انتخاب با و بدون استفاده از انتقال جنین به کمک شبیه‌سازی تصادفی بود. به این منظور دو سطح نوع آمیزش (تصادفی، حداقل همتباری)، دو سطح شدت انتخاب برای چهار مسیر انتخابی (بالا و پایین) با و بدون استفاده از انتقال جنین برای مادر نرهای آینده باهم ترکیب شده و در مجموع 8 سناریو مورد مقایسه قرار گرفت. 5000 گاو ماده توزیع شده بین 50 گله 100 راسی و ثبت شده برای 6 صفت تولید شیر، پروتئین، چربی، سن در اولین گوساله‌زایی، فاصله گوساله‌زایی و نمره سلولهای بدنی برای 30 سال شبیه‌سازی شد. روند و تغییرات سالیانه هم‌خونی برای 8 سناریو و سطوح مختلف عوامل مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که آمیزش با حداقل همتباری و شدت انتخاب پایین نسبت به آمیزش تصادفی و شدت انتخاب بالا به ترتیب 43/60 و 56 درصد تغییرات هم‌خونی کمتری دارند. تغییرات سالیانه هم‌خونی در موقع استفاده کردن از انتقال جنین نسبت به حالت استفاده نکردن 98/21 درصد بیشتر بود. کمترین تغییرات سالیانه هم‌خونی برای سناریو هشتم (آمیزش با حداقل همتباری- شدت انتخاب پایین- استفاده از انتقال جنین) و بیشترین تغییرات سالیانه هم‌خونی برای سناریو سوم (آمیزش تصادفی- شدت انتخاب بالا- استفاده از انتقال جنین) بدست آمد. با توجه به نتایج می‌توان گفت که انتخاب حیوانات با شدت بالا و استفاده از انتقال جنین با هدف افزایش پیشرفت ژنتیکی بهتر است در کنار آمیزش‌های با حداقل همتباری باشد.

به منظور بررسی عوامل مؤثر بر صفت طول عمر اقتصادی گوسفند کردی خراسان شمالی از رکوردهای ثبت شده ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفندکردی طی سال های 1369 تا 1391 که شامل 7469 بره حاصل از 187 پدر و 2258 مادر بود، استفاده گردید. ترسیم جداول طول عمر تولیدی از رویه Life table نرم افزار SAS نسخه 1/9 صورت گرفت. عوامل ثابت سال و فصل بر طول عمر حیوان اثر معنی داری داشت. نتایج نشان داد که حدود 99 درصد از میش های داشتی به دلایل غیر از سن از گله حذف گردیده اند. بیشترین درصد حذف در میش ها مربوط به بیماری (1/33%) و کمترین درصد حذف در جنس نر مربوط به مسمومیت (11/0%) می باشد. تعداد میش های حذف شده از گله با بالا رفتن سن کاهش می یابد، اما حذف میش های بالای 4 سال در مقایسه با میش های جوان افزایش یافت. زنده مانی میش هایی که زایش تک قلو داشتند، بیشتر از میش هایی است که زایش دو قلو داشتند و میش های دارای 1 بره نسبت به میش های دارای 2 و 3 بره، درصد زنده مانی بیشتری را نشان دادند. نتایج نشان داد که میش هایی که در تمام زایش ها یک بره داشتند دارای بالاترین درصد ماندگاری هستند، درحالی که در میش هایی دارای دو بره، درصد زنده مانی کمتر مشاهده شد. اگر چه سیاست های کلی در دام های سبک به سمت افزایش میزان دوقلوزایی می باشد، اما نتایج نشان داد تأکید بر دوقلوزایی موجب حذف میش ها در سنین پایین و کاهش طول عمر اقتصادی خواهد شد. برای بهبود ماندگاری می توان شرایط مدیریتی و محیطی گله را بهبود بخشید.

سن اولین زایش اثر مهمی روی سودآوری و مدیریت تولیدمثلی گله گاو شیری دارد، به طوری که زایش تلیسه ها در سن بیشتر از 24 ماهگی به دلیل از دست رفتن فرصت تولید شیر و کاهش روز های تولیدی زندگی دام، باعث افزایش هزینه های تولید در صنعت گاو شیری می شود. به منظور برآورد اجزای ژنتیکی و بررسی روند تغییرات سن اولین زایش گاوهای شیری هلشتاین در ایران از 19499 رکوردهای تولید و تولید مثل 96 گله گاوهای شیری هلشتاین طی سال های 1375 لغایت 1387 استفاده شد. داده ها با استفاده از یک مدل تک صفتی و نرم افزار Wombat آنالیز شد. وراثت پذیری صفت سن اولین زایش 0994/0 برآورد گردید. میانگین سن اولین زایش گاوهای شیری هلشتاین در ایران طی سال های 1375 لغایت 1387، 91/24 ماه برآورد شد که طی سال های مورد مطالعه به واسطه تلقیح و زایش زودتر تلیسه ها کاهش یافته است، به طوری که گاوهایی که در سال های 1375 و 1376 متولد شده اند بیشترین سن در اولین زایش را داشتند و گاوهایی که در سال های 1386 و 1387 متولد شده اند کمترین سن را در زمان اولین زایش نشان دادند. با توجه به مقادیر برآورد شده ارزش های اصلاحی صفت سن اولین زایش، روند ژنتیکی این صفت طی سال های تولد 1375 لغایت 1387 برآورد شد. بدین صورت که روند ژنتیکی در بعضی سال ها مثبت و برای بعضی سال های مورد مطالعه منفی برآورد شد و نشان می دهد که در راهبردهای انتخاب، کاهش ژنتیکی سن اولین زایش در گله های ایران مد نظر قرار نگرفته است، هرچند که از نظر فنوتیپی این صفت کاهش داشته است. گاوهای استان های یزد، مرکزی و خراسان جنوبی بیشترین سن و گاوهای استان های کرمانشاه، آذربایجان شرقی و اردبیل کمترین سن اولین زایش را داشتند. شرایط اقلیمی و آب و هوایی مناسب می تواند در افزایش باروری تلیسه ها و کاهش سن اولین زایش مؤثر باشد، هرچند عوامل مدیریتی، با وجود عوامل جوی مناسب در برخی از استان های کشور اثر به سزایی روی این صفت داشت.

هدف از این تحقیق برآورد پارامترهای ژنتیکی و مطالعه روند فنوتیپی و ژنتیکی تغییرات سن اولین زایش، روزهای باز و عملکرد تولید شیر در اولین دوره شیردهی گاوهای هلشتاین ایران است. تعداد رکوردهای سن اولین زایش، روزهای باز و تولید شیر جهت ارزیابی‌های ژنتیکی به ترتیب 71736، 20126 و 20126 بودند، که طی سالهای 1363 تا 1384 جمع آوری گردیده است. از مدل‌های تک صفتی و دوصفتی، روش حداکثر درستنمایی محدود شده و نرم افزار Wombat جهت برآورد پارامترهای ژنتیکی استفاده گردید. وراثت پذیری سن اولین زایش، روزهای باز و تولید شیر به ترتیب 02/0± 20/0 ، 01/0 ± 04/0 و 9/0 ± 47/0 برآورد گردید. روند ژنتیکی و فنوتیپی سن اولین زایش منفی بود، به طوری که میانگین فنوتیپی و ارزش‌های اصلاحی این صفت طی سالهای 1363 لغایت 1384 کاهش یافت. روند فنوتیپی و ژنتیکی برای روزهای باز و تولید شیر مثبت برآورد گردید. همبستگی ژنتیکی و فنوتیپی تولید شیر و روزهای باز به ترتیب 23/0+ و 07/0 + محاسبه گردید.

این تحقیق با هدف تایید تفرق QTL مؤثر بر صفات کمی و کیفی الیاف پشم در نژاد بلوچی، دربخش هایی از کروموزومهای 1، 5 و 25 انجام شد. جمعیت مورد مطالعه شامل 503 حیوان مربوط به 13 خانواده ناتنی پدری بود که برای 15 جایگاه ریز ماهواره ماهواره‌ای تعیین ژنوتیپ شدند. متوسط تعداد نتاج هر خانواده ناتنی پدری برابر با 38 راس و دامنه تغییرات آن 16 تا 59 راس بود. 14 صفت کمی و کیفی الیاف پشم بر روی دامها اندازه گیری شد. 14صفات این صفات کمی و کیفی الیاف پشم ازدر مرکز اصلاح نژاد گوسفند بلوچی در طی سالهای 1388 و 1389اندازه گیری شده است. داده های فنوتیپی برای اثرات ثابت شامل سال تولد، جنس بره، نوع تولد و سال پشم چینی تصحیح شدند. آنالیز ناحیه کروموزومی مرتبط با صفات کمی (QTL) به روش مکان یابی درون فاصله‌ای مبتنی بر رگرسیون و با دو مدل تک QTL و دو QTL انجام گرفت. با آنالیز درونی خانواده خانواده‌ها ششQTL برای صفات کمی و کیفی الیاف پشم بر روی کروموزوم 1 شناسایی گردید، که این QTL QTL‌ها مرتبط با درصد اختلاط الیاف (درصد الیاف حقیقی، کمپ و هتروتیپ)، ضریب تنوع قطر الیاف در بیده پشم و وزن بیده تمیز و ناشور بودند. آنالیز نشانگرهای کروموزوم 5 یکQTL در موقعیت cM89 مرتبط با درصد الیاف هتروتیپ و وزن بیده تمیز را شناسایی کرد. نهایتا بر روی کروموزوم 25، تعداد هفتQTL شناسایی شد که مرتبط با صفات درصد اختلاط الیاف (درصد الیاف هتروتیپ، کمپ و حقیقی)، وزن بیده تمیز و ناشور، ضریب تنوع قطر الیاف و درصد الیاف با قطر 50-40 میکرومتر بودند.