目的:了解柯萨奇病毒A6(coxsackievirusA6,CV-A6)感染情况和排毒时长,指导科学制定防控策略和措施.方法:制定病例定义,搜索病例.经过知情同意,采集某幼儿园所有病例和罹患率较高的小1班、中2班全体儿童的咽拭子和肛拭子标本,RT-PCR检测肠道病毒核酸,对检测阳性的儿童,每间隔1周再次采集标本开展检测,直至连续两次均为阴性时终止采样.结果:儿童罹患率为8.2％(17/208),发现隐性感染者17例.小1班和中2班流行曲线都呈现单峰分布,卫生学调查排除饮食和饮水传播.病原检测显示为CV-A6型肠道病毒核酸阳性.检测阳性者中隐性感染比例为52％(95％CI:34％～69％).排毒时长中位数为18 d(95％CI:16～25 d),最短为1周内(4 d),最长为5.5周(39 d),Log-rank检验显示病例与隐性感染者、男性与女性、咽部与肠道排毒时长差异无统计学意义(P＞0.05).结论:此轮由CV-A6肠道病毒引起的手足口病暴发疫情中,CV-A6隐性感染比例高,排毒时间长.建议提高监测敏感性,病例解除隔离返园(校)、班级复课后应开展持续的健康监测和防控措施.

目的 了解武汉市青年学生对基层卫生服务机构提供的HIV检测服务的接受意愿,为提高青年学生HIV检测比例提供依据.方法 采用分层抽样方法抽取武汉市14个行政区的15家基层卫生服务机构,再采用方便抽样方法抽取15～24岁在校学生进行问卷调查,收集人口学信息、预防艾滋病相关知识和HIV检测意愿等资料.采用多因素logistic回归模型分析在校学生接受基层卫生服务机构HIV检测服务意愿的影响因素.结果 调查在校学生301人,回收有效问卷299份,问卷有效率为99.34％.男生143人,占47.83％;女生156人,占52.17％;年龄为(19.36±2.40)岁;大专及以上223人,占74.58％.预防艾滋病相关知识知晓率为71.57％;接受过基层卫生服务机构开展的艾滋病防治宣传144人,占48.16％.接受过HIV检测34人,占11.37％.愿意接受基层卫生服务机构HIV检测服务203人,占67.89％;不愿意接受的主要原因是认为自己不可能感染艾滋病79人,占82.29％.多因素logistic回归分析结果显示,知晓预防艾滋病相关知识(OR=2.797,95％CI:1.583～4.941)、知晓基层卫生服务机构开展免费艾滋病咨询和HIV检测(OR=2.070,95％CI:1.123～3.814)和接受过基层卫生服务机构开展的艾滋病防治宣传(OR=2.814,95％CI:1.573～5.032)的在校学生更愿意接受基层卫生服务机构提供的HIV检测服务.结论 武汉市67.89％的在校学生有基层卫生服务机构HIV检测意愿,且与学生艾滋病感染风险意识、是否知晓和体验过基层卫生服务机构开展的艾滋病防治相关服务有关.

Objective:To conduct the molecular epidemiological investigation on an outbreak of acute gastroenteritis caused by GII.2[P16] in a university in Nanjing area, so as to provide scientific basis for local epidemic control and management.Methods:The samples collected in the outbreak were tested for norovirus by fluorescence quantitative PCR, one-step RT-PCR amplification and first-generation sequencing. Some positive samples were sequenced by next-generation sequencing using universal primers.Results:A total of 13 GII positive samples were detected from 96 samples, including 8 samples of norovirus GII.2[P16] by first-generation sequencing with a similarity of 99.6%-100%. The strains were in the same clade with the reference strains from 2016 to 2020. The infections were supposed to be from the same source and the strains were more similar to the dominant strains in the world after 2016. Six positive samples were analyzed by next-generation sequencing using universal primers and the whole genome sequences of 4 strains of GII.2[P16] (2 strains from student patient A and E. and 2 strains from a asymptomatic chef G) were obtained. The phylogenetic tree showed a certain distance between the results of chef G's third sample and the results of his first sample and the samples of the student patients. There were 4 nucleotide substitutions in the two whole genome sequences of Chef G, including one non-synonymous mutation at the site of 6 221bp and synonymous mutations at the rest of sites. Amino acid change (D381N) occurred at residues 381 of VP1 region, namely, adjacent to the main HBGA site II.Conclusions:Since norovirus was detected from an asymptomatic chef in the outbreak with base substitution in the virus sequence during continuous excretion of the virus, norovirus surveillance should be enhanced among food processing staffs during epidemic period (October to the next March).

目的 分析武汉市2010-2018年新发现HIV/AIDS病例首次CD4细胞检测相关因素.方法 根据国家艾滋病综合防治信息系统,获取武汉市2010-2018年病例历史卡片和随访数据库,对2010年1月1日-2018年12月31新发现HIV/AIDS病例相关信息进行分析.结果 2010-2018年间,新报告16岁及以上HIV/AIDS 5 404例,新报告病例数呈现逐年上升的趋势;HIV/AIDS在报告后14d内接受首次CD4细胞检测的比例由2010年的42.0％上升至2018年的75.4％(x2趋势=251.594,P＜0.001).CD4细胞及时检测率在不同年龄、性别、样本来源方面差异有统计学意义(P＜0.05),晚发现比例呈上升趋势;多因素分析显示,报告年份、性别、婚姻状态、文化程度、职业、感染途径、性病史、样本来源和人口性质是影响CD4细胞检测及时性的相关因素;年龄、婚姻状态、职业、感染途径、性病史及样本来源是影响晚发现的相关因素.结论 武汉市2010-2018年间新发现HIV/AIDS首次CD4细胞检测比例和及时性均有明显提升,社会组织管理模式对首次CD4细胞检测及时性和晚发现方面起到积极作用,但总体晚发现现象仍然比较严重,50岁及以上、已婚有配偶、无稳定职业以及因症状就诊的患者是重点关注人群,进一步动员社会力量参加艾滋病防治工作,在全社会推广防艾宣传教育、扩大检测覆盖面,完善检测体系,提高患者发现率是当前应该努力的方向.

近年来,南京市急性胃肠炎暴发呈上升趋势,主要是由GⅡ型诺如病毒(norovirus,NoV)引起,GⅠ型较为少见.本研究通过对南京市输入性病例和本地性暴发急性胃肠炎疫情中GⅠ.5[P4]型NoV进行遗传进化分析,为本地疫情控制和处置提供科学依据.对两起暴发疫情采集的18份样本进行荧光定量RT-PCR检测,并对NoV阳性样本部分聚合酶区和衣壳蛋白区进行一步法RT-PCR扩增、测序,结合参考株进行序列比对和进化树分析.18份样本中,GⅠ型NoV阳性5份,其中4份扩增出条带,其N/S区域序列与2016-2018年已公布的GⅠ.5[P4]同源性高达99.0％以上.其部分聚合酶区同1987年之后检出的GⅠ.P4进化距离较近,变异不大.部分衣壳蛋白区在2003-2013年发生较为明显的进化,形成新的簇,期间在2008年又继续进化,慢慢趋于稳定.这是南京市首次在输入性病例和本地暴发疫情中均检出同源性极高的GⅠ.5[P4],该NoV虽然在聚合酶区和衣壳蛋白区并没有发生较大进化,但是通过重组已在亚洲地区人群特别是中国多个城市导致了急性胃肠炎流行.因此,该型病毒株将是本市今后监测的重点.

目的 分析医院焦虑抑郁量表中文版在艾滋病病毒(HIV)感染者/艾滋病(AIDS)病人(简称HIV/AIDS病人)中应用的信度效度,评估其适用性.方法 应用医院焦虑抑郁量表中文版对定点医院219例HIV/AIDS病人进行调查,采用Cronbach α系数、分半系数、重测系数评价其信度,采用集合效度、区分效度及探索性因子分析评价其效度.结果 219例HIV/AIDS病人中,43.8％(96例)调查对象呈焦虑阳性,30.1％(66例)呈抑郁阳性;不同婚姻状态和文化程度HIV/AIDS病人焦虑差异有统计学意义(P＜0.05),不同年龄、婚姻状态、文化程度、职业HIV/AIDS病人抑郁差异有统计学意义(P＜0.05).医院焦虑抑郁量表的Cronbach α系数为0.904,其中焦虑亚量表为0.869,抑郁亚量表为0.807;总表分半系数为0.869,重测系数为0.731;集合效度和区分效度均100％定标成功;KMO和Bartlett球形度检验结果显示适合采用因子分析评价结构效度,主成分分析按特征根大于1提取2个公因子,累计解释了总变异的53.95％.结论 医院焦虑抑郁量表在HIV/AIDS病人中测评具有良好的信度和效度,可作为临床评估HIV/AIDS病人负性心理状态的工具,应结合HIV/AIDS病人心理特点,在工作中全面、尽早开展心理筛查,有针对性地进行心理护理和治疗.

目的 分析武汉市2008-2018年新报告艾滋病病毒(HIV)感染者/艾滋病(AIDS)病人(简称HIWAIDS病人)晚发现状况及影响因素.方法 根据中国艾滋病综合防治信息系统中武汉市2008-2018年新报告HIV/AIDS病例信息,分析不同特征HIV/AIDS病人晚发现状况,采用单因素分析和Logistic回归模型对晚发现影响因素进行分析.结果 2008-2018年武汉市新报告HIV/AIDS病人5 602例,平均年龄(38.47±15.47)岁,晚发现病例占33.83％(1 895例).HIV/AIDS病人晚发现主要影响因素包括:年龄[25～49岁组与16～24岁组比较,比值比(OR)=2.010,95％可信区间(CI):1.655～2.441,50岁及以上组与16～24岁组比较,OR=2.634,95％CI:2.064～3.362]、婚姻状态(已婚有配偶与未婚比较,OR=1.474,95％CI:1.224～1.775)、职业状态(无稳定职业与有职业者比较,OR=1.277,95％CI:1.118～1.459)、感染途径(异性性传播与同性性传播比较,OR=1.460,95％CI:1.252～1.703)、性病史(无性病史与有性病史比较,OR=0.730,95％CI:0.585～0.910)以及样本来源(医疗机构与自愿咨询检测门诊比较,OR=2.154,95％CI:1.816～2.555).结论 2008-2018年武汉市新报告HIV/AIDS病人晚发现比例较高,下降趋势不明显,应重点关注50岁及以上、已婚有配偶、异性性传播、无职业及医疗机构就诊人群.

目的 对南京地区食源性疾病监测中致泻性大肠埃希氏菌(diarrheagenic Escherichia coli,DEC)分离株进行多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing,MLST),了解超广谱β-内酰胺酶(Extended-spectrum beta-lactamases,ESBLs)耐药基因blaTEM、blaCTX-M和质粒介导的喹诺酮耐药基因(plasmid-mediated quinolone resistance,PMQR)qnrA、qnrB、qnrS、oqxB、oqxB、qepA、aac(6')-Ib-cr的流行情况及其与MLST型别之间的关联.方法 对食源性监测中60株DEC分离株的管家基因(adk 、fumC、gyrB、icd、mdh、purA、recA)进行PCR扩增和测序,用EnteroBase上下载的ST(Sequencetype)分型方案确定菌株序列型.PCR法检测超广谱β-内酰胺酶ESBLs耐药基因和质粒介导的喹诺酮耐药基因PMQR.结果 60株DEC可分为34个ST型别,其中ST48为优势型别(16.67％),发现两个新等位基因型,fumC1413和purA746,一个新序列型ST9953.共有43株(71.67％)携带ESBLs耐药基因,10株(16.67％)携带喹诺酮耐药基因PMQR.ESBLs阳性的大肠埃希氏菌株中占比最高的是ST10组群.结论 南京地区食源性疾病监测中致泻性大肠埃希氏菌最常见的序列型是ST48.特定的ST型别在DEC不同类型中的分布不同,两者之间呈现一定相关性.ESBLs广泛流行,blaTEM为主要流行基因,最流行的PMQR基因是qnrS.

目的 明确2019年南京市登革热的输入和本地传播风险,科学制定防控策略和措施,指导应急准备,提早部署防控工作.方法 采用定量与定性相结合的方法对境外输入的病例数进行估计,对境内输入风险进行定性分析,对影响登革热本地传播的各种因素分别进行赋值并确定权重,采用量化指标对本地传播风险进行分析和评价.结果 2019年南京市境外输入病例数估计为7例(2 ～12例),存在境内输入风险但较低.2019年7-10月南京市有7个地区本地传播风险为“可能”,5-6月除秦淮区本地传播风险为“可能”外,其他地区本地传播的风险均为“不太可能”,1-3月和11-12月无本地传播风险.结论 南京市2019年仍会有登革热病例输入,7-10月需重点关注登革热本地传播,建议采取病例发现、规范处置、持续监测、健康宣教等综合措施,科学防控登革热疫情.

目的 通过自行研发的实验室信息管理系统,实现HIV确证实验室检测样品科学管理,达到减少人员、提升效率、降低成本、提高服务质量.方法HIV患者的样品送检的信息化管理通过LIMS系统实现.HIV初筛阳性样品进入这个平台后,全程,完成了样品接受,登记,流转,分析,报告,档案管理的相关工作,并对现有实验室管理流程进行监督及完善.结果2013-2017年每年收3000件样品,同一样品检测1～3个检测检测项目无一出现样品丢失,混乱差错,也无收样期间样品的品质变化影响检测.结论待检样品通过信息化管理,保证了检测结果的公正性及准确性.使得艾滋病监测工作更加规范化.

目的 对食物中毒事件中所采集样本进行食源性致病菌的分离鉴定,快速查明食物中毒原因并进行同源性分析.方法 应用实时荧光PCR技术对一起食物中毒10份可疑食品、2份餐具涂抹样和5份患者粪便进行检测,同时进行病原菌培养分离鉴定,分离菌株采用CLSI推荐的改良K-B纸片法进行抗生素敏感试验,应用PFGE分型技术进行同源性分析.结果 1份可疑食物和3份患者粪便经实时荧光PCR检测为沙门菌阳性,同时分离到4株斯坦利沙门氏菌,4株沙门氏菌的药敏试验结果一致,PFGE带型完全一致.结论 本次食物中毒是由斯坦利沙门氏菌污染引起.实时荧光PCR技术能够快速准确地对食物中毒做出病原学诊断,PFGE基因分型技术可对病原菌进行溯源分析,对研究病原菌流行病学规律具有重要意义.

目的 了解武汉市社会组织(CBO)参与艾滋病防治工作现状和效果,为进一步推进CBO建设与发展,不断提高艾滋病防治工作能力和质量提供参考.方法 采用定性与定量相结合的调查方法,对参与武汉市艾滋病防治工作的6个社会组织进行问卷调查和访谈收集数据,同时收集同期相关专业机构相关数据并进行统计学分析.结果 6个社会组织中,经民政部门注册的3个;均有固定场所;负责人均为全职,工作人员以志愿者为主(82.28％);参与艾滋病防治服务范围与内容较全面;面临资金短缺、人员不稳定、工作能力和质量不高等突出问题和相关需求.2016-2017年本市通过社会组织进行艾滋病病毒(HIV)检测31 467例,检出阳性357例,检出率1.13％,高于相关专业机构阳性检出率0.73％(x2=48.361,P＜0.001).结论 社会组织在艾滋病防治尤其是在高危人群干预、检测方面具有明显优势和效果,但参与艾滋病防治现状尚未得到根本性改善,资金来源是面临的最大问题和需求.建议多途径加大对社会组织资金支持,进一步提升社会组织参与艾滋病防治能力和可持续性.

目的 研究南京地区诺如病毒GⅡ.Pe-GⅡ.4基因特征和变化规律,了解其进化过程及高变区氨基酸变化情况,预测进化方向及流行趋势,为疫情预警和处置提供科学依据.方法 应用荧光定量PCR和一步法RT-PCR,对南京地区2014-2017年分离的10株GⅡ.Pe-GⅡ.4的部分聚合酶一衣壳蛋白区及P2区进行测序,并利用分子生物学软件对序列进行比对分析.结果 进化树分析发现,2014-2015年和2016-2017年南京流行株分别位于两个簇.氨基酸分析显示,10株南京流行株同源性达97.3％～100.0％,与21株国内外2011-2017年参考株同源性达97.1％～100.0％.与2008年前驱期澳洲株(KX789174) P2区相比较,10株南京株共19个氨基酸位点发生改变,其中10个位点位于5个抗原表位.南京株2016年后抗原表位A区有氨基酸位点改变.结论 2014-2017年南京地区分离的诺如病毒GⅡ.Pe-GⅡ.4基因型流行株氨基酸同源性较高,但仍呈现出随时间迁移某些抗原位点的氨基酸改变,应持续观察其进化趋势.

背景H5N1禽流感病毒可以感染人类导致重症呼吸道感染，致死率高。 目的研究我中心确认的一例人感染高致病性禽流感H5N1病毒A/Nanjing/1/2015的可能起源及基因组分子特征。 方法对病人痰液样本中的H5N1病毒进行全基因组测序，使用CLC Genomics Workbench 9.0对序列进行拼接，使用BLAST和MEGA 5.22软件进行同源性比对和各片段分子特征分析。 结果该株禽流感病毒属于H5亚型的2.3.2.1c家系，其8个片段均与江浙地区禽类中分离的病毒高度同源，未发现有明显的重配。分子特征显示，该病毒血凝素(Hemagglutinin，HA)蛋白裂解位点为PQRERRRR/G，受体结合位点呈现禽类受体特点，但出现D94N、S133A和T188I氨基酸置换增强了病毒对人类受体的亲和性。神经氨酸酶(Neuraminidase，NA)蛋白颈部在49-68位缺失20个氨基酸，非结构蛋白1 (Non-structure protein，NS1)存在P42S置换和80-84位氨基酸的缺失。其他蛋白中也存在多个增强病毒致病力和对人类细胞亲和力的氨基酸突变。对耐药位点分析发现存在对奥司他韦的耐药突变H274Y，病毒对金刚烷胺仍旧敏感。 结论人感染高致病性禽流感H5N1病毒A/Nanjing/1/2015属于2.3.2.1c家系，禽类来源，关键位点较保守，但仍出现了多个氨基酸的进化与变异使其更利于感染人类。H5N1禽流感病毒进化活跃，持续动态监测不能放松。

目的 建立嗜肺军团菌特异、快速检测方法,探讨南京地区公共场所环境水样嗜肺军团菌污染状况.方法 根据嗜肺军团菌的mip基因保守序列设计引物和探针,通过对嗜肺军团菌标准株ATCC33152、嗜肺军团菌南京分离株及大肠埃希菌ATCC25922、鼠伤寒沙门菌ATCC14028、福氏2a志贺菌ATCC12022进行检测,验证该方法的特异性.并应用该法对南京地区某商场、宾馆、办公楼、医院共计13家的中央空调系统的冷却水、淋浴水和景观水共计88份环境水样进行了PCR检测及军团菌的分离培养.结果 该法对嗜肺军团菌有特异性扩增曲线,而对其他细菌无阳性扩增曲线.88份水样中荧光定量PCR方法检测出28份阳性,阳性率为31.8％;传统培养方法分离出17株军团菌,分离率为19.3％.结论 本文建立的荧光定量PCR检测方法具有良好的特异性,可用于环境水中军团菌污染状况调查.南京地区中央空调冷却水中检出率最高,存在发生军团菌病的可能,应引起足够重视.

目的 监测分析2015-2016年南京地区儿童腹泻主要病原体,为该地区儿童腹泻病原的快速诊断与防治提供依据. 方法 收集2015-2016年在南京市儿童医院感染消化科就诊的典型腹泻患儿粪便标本(或肛拭子)300例,对易导致儿童腹泻的最常见的8种病原菌(沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、5种肠致泻性大肠埃希菌)进行病原菌分离、鉴定,同时采用荧光定量PCR方法对易导致儿童腹泻的5种肠道病毒(诺如病毒、札如病毒、轮状病毒、星状病毒、腺状病毒)进行检测分析. 结果 在300例腹泻患儿粪便标本中,病原菌的总检出率为17％,其中肠致泻性大肠埃希菌检出率为10％,志贺菌属检出率为0.03％,沙门菌属检出率为6.7％;副溶血性弧菌未检出;病毒总检出率为9％,其中诺如病毒检出率为4.7％,札如病毒2.3％,轮状病毒0.33％,星状病毒0.33％,腺状病毒1.33％.2015和2016年间病原体总检出率、病原菌检出率、病毒检出率差异无统计学意义(P＞0.05). 结论 2015-2016年南京地区引起儿童腹泻的主要肠道病原菌以致腹泻型大肠杆菌属为主;其次为沙门菌属,肠道病毒以诺如病毒为主,其次为札如病毒.

目的 深入了解武汉市艾滋病经性传播感染方式特征变化趋势.方法 分别在不同年份抽样调查武汉市当年新报告男男HIV/AIDS病例,结合病例随访收集分析历年报告传播途径为异性传播的HIV/AIDS信息.结果 接受调查的男男同性HIV/AIDS病例大学及以上文化所占比例由2012年的34.65％升至2016年的64.83％,通过互联网/交友App寻找性伴比例由2012年的25.88％升至2016年的72.76％,差异均有统计学意义(P<0.001).3298例异性性传播病例中非婚异性性行为占91.75％,阳性配偶/固定性伴的仅占8.25％.2015—2017年经非商业性行为感染比例达71.08％,远高于商业异性的18.03％,分层分析结果显示非商业性行为感染HIV/AIDS病例呈逐年增加趋势,在性别、年龄、文化、婚姻、流动性及非婚性行为人数等特征上不同于商业异性性行为病例.结论 互联网/交友软件已经成为武汉市MSM寻找性伴的重要平台/场所,需充分利用互联网资源,针对性宣教干预.同时调整异性性传播防治策略措施,区别对待非商业与商业异性性行为传播.

了解2014～2017年南京地区诺如病毒胃肠炎暴发流行特征、变化规律和流行株特征,为疫情控制、疫苗研发提供科学依据.收集2014年9月至2017年8月南京地区12个区疾控上送85起疑似诺如病毒急性胃肠炎暴发样本,应用荧光定量PCR和一步法RT-PCR检测诺如病毒基因序列,测序后利用分子生物学软件对序列进行分析.其中66起诺如病毒检测阳性,暴发集中于幼儿园和小学,冬春季节高发.诺如病毒优势株在连续的几个流行季持续变化,由GⅡ.4/Sydney 2012转变为新型GⅡ.P17-GⅡ.17,再到GⅡ.P16-GⅡ.2.其中GⅡ.P16-GⅡ.2与全球2016～2017年参考株同源性达98.4％～99.5％.2014～2017年南京地区诺如病毒急性胃肠炎暴发的流行强度呈上升趋势.引起暴发的诺如病毒以GⅡ为主,含多种基因型,并存在重组株,优势基因型在连续的几个流行季持续改变.诺如病毒近几年不断变异,从而逃脱人群免疫,可能是其流行趋势上升的原因之一.

Objective To establish a rapid and accurate method for analysis of multi-item quality control samples by conducting real-time PCR and culture for isolation and identification of food-borne pathogens in blind quality control samples.Methods A competition on prevention and treatment of infectious diseases was held in Jiangsu Province in 2014.According to clinical manifestations of infectious diseases in case A and case B,the scope of detection was established;real-time fluorescence PCR was first performed for preliminary screening of pathogens,and then based on fluorescence PCR results,culture methods were carried out for further isolation and identification.Correct detection results were obtained.Results Concerning item A,Sh.flexneri 2b was detected from samples A-049 and A-086,and no pathogen was detected from sample A-093;concerning item B,enterohemorrhage E.coli O157:H7 was detected from sample B-056,and no pathogen was detected from sample B-022 or sample B-086.Conclusion Fluorescence PCR is significant for rapid preliminary screening of pathogens in emerging infectious diseases.Combination of fluorescence PCR and culture methods for analysis of multi-item quality control samples can reduce the possibility of missing detection in traditional culture methods and improve the detection efficiency and accuracy.

目的:对多重PCR和荧光PCR两种核酸检测方法在多项目质控样本中的检测应用进行初步评价.方法:同时采用三种方法对多项目盲样质控样本进行检测,包括多重PCR、荧光PCR及传统的国标方法.结果:食源性致病菌盲样(W-B11)中采用多重PCR、荧光PCR均检出金黄色葡萄球菌和蜡样芽孢杆菌核酸阳性,培养法同步分离并鉴定为金黄色葡萄球菌和蜡样芽孢杆菌,三种方法检测结果一致.结论:PCR法结合培养法对于多项目质控样本中病原菌快速初筛分离具有重要意义,可减少传统培养法漏检的可能性,提高检测效率.